| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 458799 | 5 (0.080) | 67 (1.040) | 51/276 | 0.2 | 93.2% | intergenic (+99/‑89) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| ? | NC_000913 | = 609347 | NA (NA) | intergenic (+170/+112) | insL1/entD | IS186 transposase/phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex | |||||
Only 100 of 136 total aligned reads displayed.
TGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCGCTGCGCGAT > NC_000913/458657‑458941 | tGATTTATTGCAATCCGGAAGCGCAACGGGAATCTTGTGAATTGTTGACCATTCCCCTACCATTACTTATCCCAGAAGGGGAGATCTTATCTCCCCGTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATccc < 1:1102265/143‑1 (MQ=255)tGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCC > 2:780461‑M1/1‑143 (MQ=255)tGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGGTAACCAAAAAGGGGGGACTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCC > 1:263725‑M1/1‑143 (MQ=255) tgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATcccc > 1:461211‑M1/130‑143 (MQ=255) gcgaggtatccagttctgcgggcttaacaatatgggtcagaattgctgagcagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCat > 2:1098568‑M1/128‑143 (MQ=255) ccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCat > 2:181524‑M1/128‑143 (MQ=255) gaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGTCACTTCCccatct < 2:351715‑M1/18‑3 (MQ=255) tGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCCTTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcg < 2:88148‑M1/143‑8 (MQ=255) tccagttcttcgggcttaccagtatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttatatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGAc > 1:1006196‑M1/120‑143 (MQ=255) 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1:1048382‑M1/1‑4 (MQ=255) tCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCGCTgcgc < 1:1075977/143‑1 (MQ=255) ccccATATACTGACGTACATGTTAATAGCTGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAGATTAAACTAAGAGCGAGCTCTATGAATCCTCAGCGTTCTGACCGCATTCTACTCCCCGTATCGCCGCcgcgcg > 1:1152675/1‑143 (MQ=255) cccatacgcgctaacttacgggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggccacctgtaagctccag < 2:296830‑M1/143‑141 (MQ=255) cccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggccacctgtaagctccag > 1:317462‑M1/1‑3 (MQ=255) cccataagcgctaacttaagcgttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcacgttcctcaactgccttttgtagactgtcagggataccgtcccacgaatggccacctgtcagctccag < 2:1115295‑M1/143‑141 (MQ=255) 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NC_000913/458657‑458941 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |