| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 458787 = | 5 (0.080) | 56 (0.860) | 47/278 | 0.3 | 92.0% | intergenic (+87/‑101) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| ? | NC_000913 | 608011 = | NA (NA) | intergenic (+23/‑54) | hokE/insL1 | toxic polypeptide, small/IS186 transposase | |||||
Only 100 of 141 total aligned reads displayed.
GCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATT > NC_000913/458645‑458928 | gCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTgg < 2:613869/143‑1 (MQ=255)cccggccattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttacccatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatg > 1:382225‑M1/143‑143 (MQ=255)ccccggcgttacgtgccgaaggatcgggttctgcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgggagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatg > 1:397441‑M1/143‑143 (MQ=255)ccccggcattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcgggcgtaataccaccacccttaagttagcgcttatg < 1:556120‑M1/1‑1 (MQ=255)ccccggcattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttcgcgcttatg < 1:1104630‑M1/1‑1 (MQ=255)ccccggcattacgtgccgaagtatccacttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatg > 1:203992‑M1/143‑143 (MQ=255) cccggcactacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgg > 1:1097091‑M1/142‑143 (MQ=255) ccggcattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatggg > 2:1004392‑M1/141‑143 (MQ=255) ccggcattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaataatatccagcgtaatacaccaacccttaacgtagagcttatgga < 1:950473‑M1/3‑2 (MQ=255) 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tGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCCTTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcg < 2:88148‑M1/143‑8 (MQ=255) ggCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACACATGGGTCACAAGTAGTTAACCAATCAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgc < 2:789460‑M1/143‑9 (MQ=255) tccagttcttcgggcttaccagtatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttatatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGAc > 1:1006196‑M1/120‑143 (MQ=255) ccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACg < 2:394747‑M1/25‑1 (MQ=255) gCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAACAGGGGGCATTTTATCACCCATTTACTTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAACCCacaagcactaaca > 1:869326‑M1/1‑130 (MQ=255) 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gcgcAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacctaagggt > 1:428300‑M1/1‑123 (MQ=255) gcAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttg < 1:992758‑M1/143‑23 (MQ=255) gcAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCAATACAATTAGGTAACCAAAAAAGGGGGATTTTAACACCCCTTTCATTTTTCCTCTATCCCCGGCGTTGAATGCGGGGGCAACATCCCatacgcgataacttcagggttg > 1:999206‑M1/1‑121 (MQ=255) caccaatatgggccagaattgctgaccagtgatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGAt > 2:285901‑M1/104‑143 (MQ=255) gCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatc > 2:795228‑M1/1‑114 (MQ=255) 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(MQ=255) cgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGAGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTg > 1:203860‑M1/33‑143 (MQ=255) taataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACGTCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGAGGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAg > 1:370429‑M1/31‑143 (MQ=255) cacaacccttaagttagcgcttatGGGGCAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCt < 2:872937‑M1/119‑1 (MQ=255) cacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTCATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCt < 1:999074‑M1/119‑1 (MQ=255) ttCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaggggttgaagcatctgaaaaataagatccctgtcgacctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattccgttttgtaggctgtcagggctactgt > 2:537848‑M1/1‑31 (MQ=255) 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GCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATT > NC_000913/458645‑458928 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |