| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | 3220407 = | 139 (1.130) | coding (916/1380 nt) | patA | putrescine:2‑oxoglutaric acid aminotransferase, PLP‑dependent | |||||
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
GTTTACTTTTATTGCCACCAGCGGCGCGTTCCACGGTAAATCACTTGGCGCGCTGTCGGCCACGGCGAAATCGACCTTCCGCAAACCGTTTATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGCAAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCG‑GTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTATCTCACCGCCGTACGTAAGCTATGCGATGAGTTCGGCGCACTGATGATCCTCGATGAAGTACAAACGGGCATGGGGCGCACGGGCAAGATGTTCGCCTGCGAGCATGAGAACGTACAGCCGGATATCCTCTGCCTTGCCAAAGCGCTCGGCGGCGGCGTGATGCCGATTGGCGCGACCATCGCCACTGAAGAGGTGTTTTCAGTTCTGTTCGACAACCCA > NC_000913/3220001‑3220469 | gTTTACTTTTATTGCCACCAGCGGCGCGTTCCACGGTAAATCACTTGGCGCGCTGTCGGCCACGGCGAAATCGACCTTCCGCAAACCGTTTATGCCGTTACTGCC‑GGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGCAAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCG‑GTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTgccgcc > 2:673709/1‑239 (MQ=255) 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ttGCCACCAGCGGCGCGTTCCACGGTAAATCACTTGGCGCGCTGTCGGCCACGGCGAAATCGACCTTCCGCAAACCGTTTATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGCAAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCG‑GTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCTGCCGCCGGGCTa > 1:332846/1‑238 (MQ=255) ttGCCACCAGCGGCGCGTTCCACGGTAAATCACTTGGCGCGCTGTCGGCCACGGCGAAATCGACCTTCCGCAAACCGTTTATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGCAAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCG‑GTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTa > 1:713892/1‑238 (MQ=255) ccaccaGCGGCGCGTTCCACGGTAAATCACTTGGCGCGCTGTCGGCCACGGCGAAATCGACCTTCCGCAAACCGTTTATGCCGTTACTGCCGGGCTTCCGTCATGTGCCGTTTGGCAATATCGAAGCCATGCGCACGGCTCTTAACGAGTGCAAAAAAACCGGTGATGATGTGGCTGCG‑GTGATCCTCGAACCGATTCAGGGTGAAGGTGGCGTAATTCTGCCGCCGCCGGGCTAtctc > 1:314020/1‑239 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |