New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_000913 | = 3830252 | 161 (1.180) | coding (1309/1392 nt) | xanP | xanthine permease | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 199 total aligned reads displayed.
TCTGACGTTTCCGAACAGCCAGTGTCCGGTCCGCTGTACATGAAACGCCTGAAAGGCGGCGTGCTGGCAAACGGCCTGAACTCGTTTGTTTCGGCGGTGTTTAACACCTTCCCGAACTCCTGCTTCGGGCAAAACAACGGAGTGATCCAGTTGACTGGTGTTGCCAGCCGCTATGTCGGTTTTGTCGTCGCGCTGATGTTGATCGTGCTGGGTCTGTTCCCGGCAGTGAGCGGTTTTGTACAACACATTCCAGAACCGGTTCTGGGCGGCGCAACGCTTGTAATGTTTGGCACCATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTAC > NC_000913/3829820‑3830292 | ctGACGTTTCCGAACAGCCAGTGTCCGGTCCGCTGTACATGAAACGCCTGAAAGGCGGCGTGCTGGCAAACGGCCTGAACTCGTTTGTTTCGGCGGTGTTTAACACCTTCCCGAACTCCTGCTTCGGGCAAAACAACGGAGTGATCCAGTTGACTGGTGTTGCCAGCCGCTATGTCGGTTTTGTCGTCGCGCTGATGTTGATCGTGCTGGGTCTGTTCCCGGCAGTGAGCGGTTTTGTa < 2:183199/239‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |