| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3830056 | 183 (1.310) | 4 (0.030) | 3/418 | NT | 2.3% | coding (1113/1392 nt) | xanP | xanthine permease |
| ? | NC_000913 | = 3830252 | 161 (1.180) | coding (1309/1392 nt) | xanP | xanthine permease | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 183 total aligned reads displayed.
GATGTTGATCGTGCTGGGTCTGTTCCCGGCAGTGAGCGGTTTTGTACAACACATTCCAGAACCGGTTCTGGGCGGCGCAACGCTTGTAATGTTTGGCACCATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCTCA‑GCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTG‑AATGGCTGAAAAA‑CC‑TG‑CTCTCCTCCGGGA‑TCGCCGCGGGCGGTATTACTG‑CCATCGTGCTGAATCTGATTTTCCCACCAGAAAAAC‑AGTAATTCACTGGCGGCGGTAAGATAATTACCGCCGCAGTCTCACCTCTTTAACCATTCCCGCCTTGAGGATTGCGCGTAAATCGTGCATAACTCCCTTATGTGCATTTCACGGGATGGAAGACCATGAAATTTATTGGGAAGCTGCTTCTCT > NC_000913/3830014‑3830483 | gATGTTGATCGTGCTGGGTCTGTTCCCGGCAGTGAGCGGTTTTGTACAACACATTCCAGAACCGGTTCTGGGCGGCGCAACGCTTGTAATGTTTGGCACCATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCTCA‑GCAGCCGCTGGTTTTGCCGTTTGCCCCTG‑GATGGGTGa > 2:397276/1‑239 (MQ=255) tGATCGTGCTGGGTCTGTTCCCGGCAGTGAGCGGTTTTGTACAACACATTCCAGAACCGGTTCTGGGCGGCGCAACGCTTGTAATGTTTGGCACCATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCTCA‑GCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTG‑AATGGCTGAaaaac > 1:261605‑M2/1‑234 (MQ=255) cGTGCTGGGTCTGTTCCCGGCAGTGAGCGGTTTTGTACAACACATTCCAGAACCGGTTCTGGGCGGCGCAACGCTTGTAATGTTTGGCACCATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCTCA‑GCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTG‑AATGGCTGAAAAA‑CC‑t > 1:1057255/1‑237 (MQ=255) gTGCTGGGTCTGTTCCCGGCAGTGAGCGGTTTTGTACAACACATTCCAGAACCGGTTCTGGGCGGCGCAACGCTTGTAATGTTTGGCACCATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTGTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCTCA‑GCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTG‑AATGGCTGAAAAA‑CC‑TG‑ct < 1:676306/239‑1 (MQ=255) gTGCGGGGTCGGTTCCAGGCAGTGAGCGGTTTTGTACAACACATTCCAGGACCGGTTCTGGGCGGCGCAACGCTGTTAATGTTTGGCACCATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTGCTCGTGCGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCTCA‑GCAGCCGCGGATTTTGCAGTTTGCCCCTG‑AATGTCTGACAAA‑CC‑TG‑ct < 2:1420243/239‑1 (MQ=255) tGCTGGGTCTGTTCCCGGCAGTGAGCGGTTTTGTACAACACATTCCAGAACCGGTTCTGGGCGGCGCAACGCTTGTAATGTTTGGCACCATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGGGTCTCA‑GCAGCCGCTGCTTTTTCCGTTTGCCCCTG‑TATGGCTGTaaaacccgct < 2:1492033‑M2/238‑11 (MQ=255) tGCTGGGTCTGTTCCCGGCAGTGAGCGGTTTTGTACAACACATTCCAGAACCGGTTCTGGGCGGCGCAACGCTTGTAATGTTTGGCACCATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGGGTCTCA‑GCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTG‑AATGGCTGAAAAA‑CC‑TG‑c > 1:1497645/1‑237 (MQ=255) tGCTGGGTCTGTTCCCGGCAGTGAGCGGTTTTGTACAACACATTCCAGAACCGGTTCTGGGCGGCGCAACGCTTGTAATGTTTGGCACCATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGGCTGGGCGGGTCTCA‑GCAGGCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTG‑AATGGCTGTAAAA‑CC‑TG‑c > 1:1166843/1‑237 (MQ=255) ttCCCGGCAGTGAGCGGTTTTGTACAACACATTCCAGAACCGGTTCTGGGCGGCGCAACGCTTGTAATGTTTGGCACCATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCTCA‑GCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTTCCCCTG‑AATGGCTGAAAAA‑CC‑TG‑CTCTCCTCCGGGa > 1:611213/1‑238 (MQ=255) ttCCCGGCAGTGAGCGGTTTTGTACAACACATTCCAGAACCGGTTCTGGGCGGCGCAACGCTTGTAATGTTTGGCACCATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCTCA‑GCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTTCCCCTG‑AATGGCTGAAAAA‑CC‑TG‑CTCTCCTCCGGGa > 1:1459971/1‑238 (MQ=255) ttCCCGGCAGTGAGCGGTTTTGTACAACACATTCCAGAACCGGTTCTGGGCGGCGCAACGCTTGTAATGTTTGGCACCATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGGGGCTCC‑GCAGCCGCTCATTTTGCAGTTTGCCCCTG‑AATGGCTGAAAAA‑CC‑TG‑CTCTCCTCCcggc > 2:1432418/1‑237 (MQ=255) gcccGGCAGTGAGCGGTTTTGTACAACACATTCCAGAACCGGTTCTGGGCGGCGCAACGCTTGTAATGTTTGGCACCATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCTCA‑GCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTG‑AATGGCTGAAAAA‑CC‑TG‑CTCTCCTCCGGGA‑t < 1:1530943/237‑1 (MQ=255) ggCAGTGAGCGGTTTTGTACAACACATTCCAGAACCGGTTCTGGGCGGCGCAACGCTTGTAATGTTTGGCACCATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGGGTCTCA‑GCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTG‑AATGGCTGAAAAA‑CC‑TG‑CCCTCCTCCCGGA‑Tcgcc > 1:1372793/1‑238 (MQ=255) 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gtaGCGGGTTTGTACAACACATGCCAGAACCGGTTCTGGGCGGGGCAAGGCTTTTAAGGTTTGGCACCATCGCCGCCTCGGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCGCA‑GCAGCCGCTGATTGTGCAGTTTGCCCCTG‑AATGGCTGAAAAA‑CC‑TG‑CTCTCCTCCGGGA‑TCGCCgctgg < 2:1223781/236‑1 (MQ=255) gggggggtttGTTCAACCCATTCCGGAACCGTGTCTGGGCGGCGCAACGCTTTGAATGGTTGGCACCATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGGGGTGTCGCTGGCGGGTGGTCTGGGCGTGTCTCA‑GCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTG‑AATGGCTGAAAAA‑CC‑TG‑CTCTCCTCCGGGA‑TCGCCgcgggc < 2:185173/231‑1 (MQ=255) gAGCGGTTTTGTACAACACATTCCAGAACCGGTTCTGGGCGGCGCAACGCTTGTAATGTTTGGCACCATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCTCA‑GCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTG‑AATGGCTGAAAAA‑CC‑TG‑CTCTCCTCCGGGA‑TCGCCgcgggc < 1:49344/238‑1 (MQ=255) gAGCGGTTTTGTACAACACATTCCAGAACCGGTTCTGGGCGGCGCAACGCTTGTAATGTTTGGCACCATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCTCA‑GCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTG‑AATGGCTGAAAAA‑CC‑TG‑CTCTCCTCCGGGA‑TCGCCgcggg < 1:142922/237‑1 (MQ=255) gAGCGGTTGTGTACAACACAGTCCAGAACCGGTTCTGGGCGGCGCAACGTTTGTAATGTTTGGCACCATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTGTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGAGTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCTCA‑GCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTG‑AATGGCTGAAAAA‑CC‑TG‑CTCTCCTCCGGGA‑TCGCCgcgggc < 1:422390/238‑1 (MQ=255) caacaCATTCCAGAACCGGTTCTGGGCGGCGCAACGCTTGTAATGTTTGGCACCATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCTCA‑GCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTG‑AATGGCTGAAAAA‑CC‑TG‑CTCTCCTCCGGGA‑TCGCCGCGGGCGGTATTACTG‑CCAt < 1:954149/239‑1 (MQ=255) cacaTTCCAGAACCGGTTCTGGGCGGCGCAACGCTTGTAATGTTTGGCACCATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTTGCCTGGGCGTGTCCCA‑GCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTG‑AATGGCTGAAAAA‑CC‑TG‑CTCTCCTCCGGGC‑TCGCCCCCGGCGGGATTTTCG‑CCATcc > 1:1012093/1‑237 (MQ=255) cacaTTCCAGAACCGGTTCTGGGCGGCGCAACGCTTGTAATGTTTGGCACCATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCTCA‑GCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTG‑AATGGCTGAACAA‑CC‑TG‑CTCTCCTCCGGGC‑TCGCCCGGGGCGGTATTACTG‑GCACCGt > 2:1289076/1‑239 (MQ=255) cacaTTCCAGAACCGGTTCTGGGCGGCGCAACGCTTGTAATGTTTGGCACCATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCTCA‑GCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTG‑AATGGCTGAAAAA‑CC‑TG‑CTCTCCTCCGGGA‑TCGCCGCGGGCGGTATTACTG‑CCATCGt > 1:686667/1‑239 (MQ=255) cacaTTCCAGAACCGGTTCTGGGCGGCGCAACGCTTGTAATGTTTGGCACCATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGGGTCTCA‑GCAGGCGCTGATTTTGCCGTTTGCCCCTG‑AATGGCTGAAAAA‑CC‑TG‑CCCTCCTCCCGGA‑TCGCCGCGGGCGGTATTACTG‑CCATCGt > 2:909847/1‑239 (MQ=255) cacaTTCCAGAACCGGTTCTGGGCGGCGCAACGCTTGTAATGTTTGGCACCATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGGTGGGCTGGGCGTGTCTCA‑GCAGACGCTGCTTTTGCAGTTTGCCCCTG‑AATGGCTGGAAAA‑CC‑TG‑CTCTCCTCCGGGA‑TCGGCGCGGGCGGGATTACTG‑TCCTCGt > 1:1330996/1‑239 (MQ=255) aTTCCAGAACCGGTTCTGGGCGGCGCAACGCTTGTAATGTTTGGCACCATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCTCA‑GCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTG‑AATGGCTGAAAAA‑CC‑TG‑CTCTCCTCCGGGA‑TCGCCGCGGGCGGTATTACTG‑CCATCGTGCt < 1:673338/239‑1 (MQ=255) 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aTCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCTCA‑GCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTG‑AATGGCTGAAAAA‑CC‑TG‑CTCTCCTCCGGGA‑TCGCCGCGGGCGGTATTACTG‑CCATCGTGCTGAATCTGATTTTCCCACCAGAAAAAC‑AGTAATTTACTCGCGGCGGGAAGAAAATTACCGACGCAGtttc > 1:292615/1‑239 (MQ=255) aTCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCTCA‑GCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTG‑AATGGCTGAAAAA‑CC‑TG‑CTCTCCTCCGGGA‑TCGCCGCGGGCGGGATTACTG‑CCATCGTGCTGAATCTGATTTTCCCACCAGAAAAAC‑AGTAATTCACTGGCGGCGGGAAGATAATTACCGCCCCAGtct > 1:664256/1‑238 (MQ=255) tcttttCTCGTGGGCCGCTGAACCGTGGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGTTGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCTCA‑GCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTG‑AATGGCTGAAAAA‑CC‑TG‑CTCTCCTCCGGGA‑TCGCCGCGGGCGGTATTACTG‑CCATCGTGCTGAATCTGATTTTCCCACCAGAAAAAC‑AGTAATTCACTGGCGGCGGTAAGATAATTACCGCCGCAGTCTCa < 1:488522/236‑1 (MQ=255) tCGTTTCCGTTGAGCCGCTGAACCGTGGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCTCA‑GCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTG‑AATGGCTGAAAAACCC‑TG‑CTCTCCTCCGGGA‑TCGCCGCGGGCGGTATTACTG‑CCATCGTGCTGAATCTGATTTTCCCACCAGAAAAAC‑AGTAATTCACTGGCGGCGGTAAGATAATTACCGCCGCAGtctc < 1:190181/239‑1 (MQ=255) ccGTTTCCCGTGGGCCGCTGACCCGGCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGGTGGCGGTTGGTCTGGGCGTTTCTCA‑GCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTG‑AATGGCTGAAAAA‑CC‑TG‑CTCTCCTCCGGGA‑TCGCCGGGGGCGGTATTACTG‑CCATCGTGCTGAATCTGATTTTCCCCCCAGAAAAAC‑AGTAATTCACTGGCGGCGGTAAGATAATTACCGCCGCAGTCTCa < 2:908290/238‑1 (MQ=255) gttttGTCGGGGGCCGCTGACCCGTCGGGCGATTTGGATTATGCCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCGGGCCGTGTTTCG‑CCAGCCGATGATTTGGCAGTTGCCCCCTG‑ACTGGCTGAAAAC‑CC‑TG‑CTCTCCTCGGGGA‑TGGCCGCGGGCGGTATTACTG‑CCATCGTGCTGAATCTGATTTTCCCACCAGAAAAAC‑AGTAATTCACTGGGGGCGGGAAGTTAATTACCGCCGCAGTCTCAc < 2:948057/237‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |