| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3100616 = | 211 (1.340) | 3 (0.020) | 3/418 | NT | 1.4% | coding (111/1047 nt) | ansB | periplasmic L‑asparaginase 2 |
| ? | NC_000913 | 3100637 = | 207 (1.360) | coding (90/1047 nt) | ansB | periplasmic L‑asparaginase 2 | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 224 total aligned reads displayed.
TTCTTCCATCGTGTCGGTACCGTGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAATTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCACCACCACCGGCAATGGTCCCGCCGGTTGCTAAAATGGTGATATTGGGTAATGCCAATGCTGCACCACTAAAACCCATAACCAGTGCGGCAAGTGCCGTCTTTTTGAAAAACTCCATTTCATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGA > NC_000913/3100379‑3100854 | ttttatgccgtttaattcttcgttttgttacctgcctctaactttgtagatctccaaaatatattcacgttgtaaattgtttaacgtcaaatttcccatacagagctaagggataatgcgtagcgttcacgtaactggaggaatgaaatggagtttttcaaaaagacggcacttgccgcactggttatgggttttagtggtgcagcattggcattacccaatatcaccattttagcaa < 2:341488‑M1/1‑1 (MQ=255)ttttatgccgtttaattcttcgttttgttacctgcctctaactttgtagatctccaaaatatattcacgttgtaaattgtttaacgtcaaatttcccatacagagctaagggataatgcgtagcgttcacgtaactggaggaatgaaatggagtttttcaaaaagacggcacttgccgcactggttatgggttttagtggtgcagcattggcattacccaatatcaccattttagcaa < 1:934787‑M1/1‑1 (MQ=255) tcCATCGTGTCGGTACCGTGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAATTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACCTTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCCTTAACCAGCTTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCACCACCACCgg > 2:277770/1‑238 (MQ=255) tttaattcttcgttttgttacctacctctaactttgtagatctccaaaatatattcaagttgtaaattgtttaacgtcacatttcccatacagagctaagggataatgcgtagcgttcacgaaactggaggactgaaatggcgtttttcaaaaagacggtccttgccgcactggttatgggtgttggtggcgcagcattggcattacccaagatcaccattttagcaaccgtcggcacc < 1:741219‑M1/12‑9 (MQ=255) gTGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAATTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCACCACCACCGGCAATGGTCCCGCCGGtt > 2:1259425/1‑238 (MQ=255) tGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAATTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCACCACCACCGGCAATGGTCCCGCCGGtt > 1:350677/1‑237 (MQ=255) aaTGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAATTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCACCACCACCGGCAATGGTCCCGCCGGTTGCTaaaa < 2:1395156/239‑1 (MQ=255) 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gACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGGCGGTGTTAATTTTTTGCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCTCCACCACCGGCAATGGTCCCGCCGGTTGCTAAAATgg < 2:329732/239‑1 (MQ=255) aCGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAATTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCACCACCCCCGGCAATGGTCCCGCCGGTTGCTAAAATgg < 1:490252/238‑1 (MQ=255) aCGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGGCGGTGTTAATTTTTTGCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCAGATATTCACTACCGGATCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCACCACCACCGGCAATGGTCCCGCCGGTTGCTAAAATgg < 2:1369901/238‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |