| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 3100616 = | 211 (1.340) | 3 (0.020) | 3/418 | NT | 1.4% | coding (111/1047 nt) | ansB | periplasmic L‑asparaginase 2 |
| ? | NC_000913 | 3100637 = | 207 (1.360) | coding (90/1047 nt) | ansB | periplasmic L‑asparaginase 2 | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 240 total aligned reads displayed.
GTGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAATTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCACCACCACCGGCAATGGTCCCGCCGGTTGCTAAAATGGTGATATTGGGTAATGCCAATGCTGCACCACTAAAACCCATAACCAGTGCGGCAAGTGCCGTCTTTTTGAAAAACTCCATTTCATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAA > NC_000913/3100400‑3100873 | tGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAATTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCACCACCACCGGCAATGGTCCCGCCGGtt > 1:350677/1‑237 (MQ=255) tGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAATTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCACCACCACCGGCAATGGTCCCGCCGGtt > 1:781072/1‑237 (MQ=255) aaTGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAATTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCACCACCACCGGCAATGGTCCCGCCGGTTGCTaaaa < 2:1395156/239‑1 (MQ=255) gACGAGGCCGTCGGTCTTATGTCAGTCGATGTTAATTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGCCATTATCGTTCATGCCCTGGTAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTCCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCGCCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCACCGCCACCGGCAATGGTCCCGCCGGTTGCTAAAATgg < 1:66560/239‑1 (MQ=255) gACGAAGCCGTCGGTTTTATCGCAGTCGGTGTTAATTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTCCCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTCCCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCACCGCCACCGGCAATGGTCCCGCCGGTTGCTAAAATgg < 1:1070078/239‑1 (MQ=255) gACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAATTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTCCCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCACCACCACCGGCAATGGTCCCGCCGGTTGCTAAAATgg < 2:879467/239‑1 (MQ=255) gACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGGCGGTGTTAATTTTTTGCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCTCCACCACCGGCAATGGTCCCGCCGGTTGCTAAAATgg < 2:329732/239‑1 (MQ=255) 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aaTTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCACCACCACCGGCAATGGTCCCGCCGGTTGCTAAAATGGTGATATTGGGTAATGCCAATGCTGCACCACTaa < 2:350677/239‑1 (MQ=255) aaTTTTTTACGCCAGTGCCGGCCAGACATTATCGTTCATGTCCCGGGTGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAGCTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCACCACCACCGGCAATGGTCCCGCCGGTTGCTAAAATGGTGATATTGGGTAATGCCAATGCTGCACCACTaa < 1:315504/239‑1 (MQ=255) tgtCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCACCACCACCGGCAATGGTCCCGCCGGTTGCTAAAATGGGGATATTGGGTAATGCCAATGCTGCACCACTAAAAc > 2:1330282/1‑227 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |