New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | = 2766335 | 206 (1.310) | 3 (0.020) | 3/416 | NT | 1.4% | coding (420/1074 nt) | rnlA | CP4‑57 prophage, RNase LS |
? | NC_000913 | = 2766339 | 209 (1.370) | coding (424/1074 nt) | rnlA | CP4‑57 prophage, RNase LS | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 222 total aligned reads displayed.
ACGGGGACGGTTCGACTACAATTCAATATCTCACTGGAGCCAATCGTTCTCTGGGCCAAGAGTTAGCGGATCATCTTTTTGAAACCATCAATCCTGCTGAATTTGAGCAGGTAAATATGGTACTGCAAGGATTTGTAGAGACAAGCGTTCTACCTGTACTTGAGCTATCAGCAGATGAATCGCATATAGAGTTCAGAGAACACTCTCGTAACGCTCATACCGTAGTGTGGAAAATTATTTCCACCAGCTATCAGGACGAATTGACTGTGAGCCTGCATATCACAACAGGTAAGCTCCAGATTCAGGGCCGACCGCTGTCATGTTACAGAGTTTTCACGTTTAACTTGGCAGCCCTGCTTGATTTACAGGGTTTGGAGAAAGTGCTAATCCGCCAGGAGGATGGTAAAGCTAATATTGTTCAACAGGAGGTTGCCCGCACTTACTTGCAGACTGTAATGGCCGATGCTTACCCGC > NC_000913/2766103‑2766576 | aCGGGGACGGTTCGACTACAATTCAATATCTCACTGGAGCCAATCGTTCTCTGGGCCAAGAGTTAGCGGATCATCTTTTTGAAACCATCAATCCTGCTGAATTTGAGCAGGTAAATATGGTACTGCAAGGATTTGTAGAGACAAGCGTTCTACCTGTACTTGAGCTATCAGCAGATGAATCGCATATAGAGTTCAGAGAACACTCTCGTAACGCTCATACCGTAGTGTGGAAAATTAtt < 2:76559‑M2/239‑3 (MQ=255) cGGTTCGACTACAATTCAATATCTCACTGGAGCCAATCGTTCTCTGGGCCAAGAGTTAGCGGATCATCTTTTTGAAACCATCAATCCTGCTGAATTTGAGCAGGTAAATATGGTACTGCAAGGATTTGTAGAGACAAGCGTTCTACCTGTACTTGAGCTATCAGCAGATGAATCGCATATAGAGTTCAGAGAACACTCTCGTAACGCTCATACCGTAGTGTGGAAAATTATTTccacc < 2:1450784/238‑1 (MQ=255) ttCGACTACAATTCAATATCTCACTGGAGCCAATCGTTCTCTGGGCCAAGAGTTAGCGGATCATCTTTTTGAAACCATCAATCCTGCTGAATTTGAGCAGGTAAATATGGTACTGCAAGGATTTGTAGAGACAAGCGTTCTACCTGTACTTGAGCTATCAGCAGATGAATCGCATATAGAGTTCAGAGAACACTCTCGTAACGCTCATACCGTAGTGTGGAAAATTATTTCCACCAGCt > 2:122029/1‑239 (MQ=255) aCAATTCAATATCTCACTGGAGCCAATCGTTCTCTGGGCCAAGAGTTAGCGGATCATCTTTTTGAAACCATCAATCCTGCTGAATTTGAGCAGGTAAATATGGTACTGCAAGGATTTGTAGAGACAAGCGTTCTACCTGTACTTGAGCTATCAGCAGATGAATCGCATATAGAGTTCAGAGAACACTCTCGTAACGCTCATACCGTAGTGTGGAAAATTATTTCCACCAGCTATCAGGa < 2:1205882/239‑1 (MQ=255) aCAATTCAATATCTCACTGGAGCCAATCGTTCTCTGGGCCAAGAGTTAGCGGATCATCTTTTTGAAACCATCAATCCTGCTGAATTTGAGCAGGTAAATATGGTACTGCAAGGATTTGTAGAGACAAGCGTTCTACCTGTACTTGAGCTATCAGCAGATGAATCGCATATAGAGTTCAGAGAACACTCTCGTAACGCCCATACCGTAGTGTGGAAAATTATTTCCACCAGCTATCAGGa < 1:202968/239‑1 (MQ=255) aTTCAATATCTCACTGGAGCCAATCGTTCTCTGGGCCAAGAGTTAGCGGATCATCTTTTTGAAACCATCAATCCTGCTGAATTTGAGCAGGTAAATATGGTACTGCAAGGATTTGTAGAGACAAGCGTTCTACCTGTACTTGAGCTATCAGCAGATGAATCGCATATAGAGTTCAGAGAACACTCTCGTAACGCTCATACCGTAGTGTGGAAAATTATTTCCACCAGCTATCAGGACGa > 2:154967/1‑239 (MQ=255) cAATATCTCACTGGAGCCAATCGTTCTCTGGGCCAAGAGTTAGCGGATCATCTTTTTGAAACCATCAATCCTGCTGAATTTGAGCAGGTAAATATGGTACTGCAAGGATTTGTAGAGACAAGCGTTCTACCTGTACTTGAGCTATCAGCAGATGAATCGCATATAGAGTTCAGAGAACACTCTCGTAACGCTCATACCGTAGTGTGGAAAATTATTTCCACCAGCTATCAGGACGAAtt < 2:438063/239‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |