| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 235341 = | 156 (1.380) | 3 (0.030) | 3/424 | NT | 2.0% | coding (526/723 nt) | yafS | putative S‑adenosyl‑L‑methionine‑dependent methyltransferase |
| ? | NC_000913 | 235361 = | 143 (1.310) | coding (546/723 nt) | yafS | putative S‑adenosyl‑L‑methionine‑dependent methyltransferase | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 169 total aligned reads displayed.
ACATACATTGCCGTGGTGCACCGATCCGCATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTATTGATTGATGATGGCTGGCTGGTCATTAGTGGCTTCAATCCCATCAGTTTTATGGGATTACGCAAACTTGTGCCGGTATTGCGCAAAACCTCGCCCTATAACAGCCGGATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAATGCGCATATTCCTGCGCTTGGTTGCTTACAACTTATTGTTGCCCGGAAACGGACTATTCCTTTAACGCTAAATCCGATGAAACAGAGTAAAAACAAGCCACGAATTCGCCAGGCGGTTGGAGCCACCCGGCAATGTCGTAAACCACAGGCTTAAACTTCAACTTGGTAGCCTGTATCTTCCAGTGTGGGAT > NC_000913/235106‑235575 | gctcgtgccgcggcgatgaatcccacactggaagatacaggctaccaagttgaagtttaagcctgtggtttacgacattgccgggtggctccaaccgcctggcgaattcgtggcttgtttttactctgtttcctcggatttagcgttaaaggaatagtccgtttccgggcaacaataaggtgtaagcaaccaaacgccggaatatgcgcattcaatagttttcctccgtgtttgTTcc < 1:139060‑M1/4‑1 (MQ=255) ctggtgccgcggcgatgaatcccacactggaagatacaggctgccaagttgaagtttaagcctgtggtttacgacattgccgggtggctccaaccgcctggcgaattcgtggcttgtttttactctgtttcatcggatttagcgttaaaggaatagtccgtttccgggcaacaataagttgtaagcaaccaagcgcaggaatatgcgcattcaatagttttcctccgtgtttgTTCCa > 1:913258‑M1/234‑238 (MQ=255) tacatTGCCGTGGTGCACCGATCCGCATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTATTGATTGATGATGGCTGGCTGGTCATTAGTGGCTTCAATCCCATCAGTTTTATGGGATTACGCAAACTTGTGCCGGTATTGCGCAAAACCTCGCCCTATAACAGCCGGATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACg > 1:1190259/1‑239 (MQ=255) catTGCCGTGGTGCACCGATCCGCATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTATTGATTGATGATGGCTGGCTGGTCATTAGTGGCTTCAATCCCATCAGTTTTATGGGATTACGCAAACTTGTGCCGGTATTGCGCAAAACCTCGCCCTATAACAGCCGGATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGtt < 1:265397/239‑1 (MQ=255) tgccgcggcgttgaatcccacactggaagatacaggctaccaagttgaagtttaagcctgtggtttacgacattgccgggtggctccaaccgcctggcgaattcgtggcttgtttttactctgtttcaacggctttttcgttaaaggaattgtcccttttcgggcaaacataagttgtaagcaaaccagcgcagggatatgccacattaacagttttcgtccctgtttgtttcccgggg < 1:675208‑M1/10‑9 (MQ=255) tGCCGTGGTGCACCGATCCGCATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTATTGATTGATGATGGCTGGCTGGTCATTAGTGGCTTCAATCCCATCAGTTTTATGGGATTACGCAAACTTGTGCCGGTATTGCGCAAAACCTCGCCCTATAACAGCCGGATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGTAGTGCTACACGCCAGCCGGTTCCACGTtct > 1:300150/1‑238 (MQ=255) tGCCGTGGTGCACCGATCCGCATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTATTGATTGATGATGGCTGGCTGGTCATTAGTGGCTTCAATCCCATCAGTTTTATGGGATTACGCAAACTTGTGCCGGTATTGCGCAAAACCTCGCCCTATAACAGCCGGATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTtct > 2:894691/1‑238 (MQ=255) tGCCGTGGTGCACCGATCCGCATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTATTGATTGATGATGGCTGGCTGGTCATTAGTGGCTTCAATCCCATCAGTTTTATGGGATTACGCAAACTTGTGCCGGTATTGCGCAAAACCTCGCCCTATAACAGCCGGATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGGTGAATTTTGAAGTGCTACCGCCCAGCCGTTTcccaggtct > 1:170958/1‑231 (MQ=255) gtgCACCGATCCGCATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTATTGATTGATGATGGCTGGCTGGTCATTAGTGGCTTCAATCCCATCAGTTTTATGGGATTACGCAAACTTGTGCCGGTATTGCGCAAAACCTCGCCCTATAACAGCCGGATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGa > 1:614898/1‑239 (MQ=255) cACCGATCCGCATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTATTGATTGATGCTGGCTGGCTGGTCATTAGTGGCTTCAATCCCATCAGTTTTATGGGATTACGCAAACTTGTGCCGGTATTGCGCAAAACCTCGCCCTATAACAGCCGGATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGCTTCCACGTTCTCCCGTGGaaca > 2:428122/1‑239 (MQ=255) ccGATCCGCATCGTTTATTGAGTGAAGCCGATCGGGTATTGATTGATGATGGCTGGCTGGTCATTAGTGGCTTCAATCCCATCAGTTTTATGGGATTCCGCAAACTTGTGCCGGTATTGCGCAAAACCTCGCCCTATAACAGCAGGATGTTTACTCTGATGCGGCAGATGGACTGGCACTCTTTGTTGAATTTTGGAGTGCTACACGCCAGACGTTTCTAAGTCCTCCCGTGGtacaa > 1:441069/1‑238 (MQ=255) aTCCGCATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATAGGGTATTGATTGATGATGGCTGGCTGGTCATTAGTGGCTTCAATCCCATCAGTTTTATGGGATTACGCACACTTGTGCCGGTATTGCGCAAAACCTCGCCCTATAACAGCCGGATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGGAGTGTTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAacac > 1:109545/1‑239 (MQ=255) cGCATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTATTGATTGATGATGGCTGGCTGGTCATTAGTGGCTTCAATCCCATCAGTTTTATGGGATTACGCAAACTTGTGCCGGTATTGCGCAAAACCTCGCCCTATAACAGCCGGATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACgga > 1:560662/1‑239 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |