| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 235341 = | 156 (1.380) | 3 (0.030) | 3/424 | NT | 2.0% | coding (526/723 nt) | yafS | putative S‑adenosyl‑L‑methionine‑dependent methyltransferase |
| ? | NC_000913 | 235361 = | 143 (1.310) | coding (546/723 nt) | yafS | putative S‑adenosyl‑L‑methionine‑dependent methyltransferase | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 162 total aligned reads displayed.
CACCGATCCGCATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTATTGATTGATGATGGCTGGCTGGTCATTAGTGGCTTCAATCCCATCAGTTTTATGGGATTACGCAAACTTGTGCCGGTATTGCGCAAAACCTCGCCCTATAACAGCCGGATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAATGCGCATATTCCTGCGCTTGGTTGCTTACAACTTATTGTTGCCCGGAAACGGACTATTCCTTTAACGCTAAATCCGATGAAACAGAGTAAAAACAAGCCACGAATTCGCCAGGCGGTTGGAGCCACCCGGCAATGTCGTAAACCACAGGCTTAAACTTCAACTTGGTAGCCTGTATCTTCCAGTGTGGGATTCATCGCCGCGGCACGAGC > NC_000913/235124‑235594 | cACCGATCCGCATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTATTGATTGATGCTGGCTGGCTGGTCATTAGTGGCTTCAATCCCATCAGTTTTATGGGATTACGCAAACTTGTGCCGGTATTGCGCAAAACCTCGCCCTATAACAGCCGGATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGCTTCCACGTTCTCCCGTGGaaca > 2:428122/1‑239 (MQ=255) ccGATCCGCATCGTTTATTGAGTGAAGCCGATCGGGTATTGATTGATGATGGCTGGCTGGTCATTAGTGGCTTCAATCCCATCAGTTTTATGGGATTCCGCAAACTTGTGCCGGTATTGCGCAAAACCTCGCCCTATAACAGCAGGATGTTTACTCTGATGCGGCAGATGGACTGGCACTCTTTGTTGAATTTTGGAGTGCTACACGCCAGACGTTTCTAAGTCCTCCCGTGGtacaa > 1:441069/1‑238 (MQ=255) aTCCGCATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTATTGATTGATGATGGCTGGCTGGTCATTAGTGGCTTCAATCCCATCAGTTTTATGGGATTACGCAAACTTGTGCCGGTATTGCGCAAAACCTCGCCCTATAACAGCCGGATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAacac > 2:622952/1‑239 (MQ=255) cGCATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTATTGATTGATGATGGCTGGCTGGTCATTAGTGGCTTCAATCCCATCAGTTTTATGGGATTACGCAAACTTGTGCCGGTATTGCGCAAAACCTCGCCCTATAACAGCCGGATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACgga > 1:560662/1‑239 (MQ=255) cGCATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTATTGATTGATGATGGCTGGCTGGTCATTAGTGGCTTCAATCCCATCAGTTTTATGGGATTACGCAAACTTGTGCCGGTATTGCGCAAAACCTCGCCCTATAACAGCCGGATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACgga > 2:139060/1‑239 (MQ=255) gCATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTATTGATTGATGATGGCTGGCTGGTCATTAGTGGCTTCAATCCCATCAGTTTTATGGGATTACGCAAACTTGTGCCGGTATTGCGCAAAACCTCGCCCTATAACAGCCGGATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACggag < 2:560662/239‑1 (MQ=255) gCATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTATTGATTGATGATGGCTGGCTGGTCATTAGTGGCTTCAATCCCATCAGTTTTATGGGATTACGCAAACTTGTGCCGGTATTGCGCAAAACCTCGCCCTATAACAGCCGGATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACggag < 1:1165110/239‑1 (MQ=255) aTCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTATTGATTGATGATGGCTGGCTGGTCATTAGTGGCTTCAATCCCATCAGTTTTATGGGATTACGCAAACTTGTGCCGGTATTGCGCAAAACCTCGCCCTATAACAGCCGGATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACggagga < 2:730489/239‑1 (MQ=255) gTGAAGCCGATCGGGTATTGATTGATGATGGCTGGCTGGTCATTAGTGGCTTCAATCCCATCAGTTTTATGGGATTACGCAAACTTGTGCCGGTATTGCGCAAAACCTCGCCCTATAACAGCCGGATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAAt < 2:836338/239‑1 (MQ=255) gAAGCCGATCGGGTATTGATTGATGATGGCTGGCTGGTCATTAGTGGCTTCAATCCCATCAGTTTTATGGGATTACGCAAACTTGTGCCGGTATTGCGCAAAACCTCGCCCTATAACAGCCTGATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAAt < 1:403288/237‑1 (MQ=255) gAAGCCGATCGGGTATTGATTGATGATGGCTGGCTGGTCATTAGTGGCTTCAATCCCATCAGTTTTATGGGATTACGCAAACTTGTGCCGGTATTGCGCAAAACCTCGCCCTATAACAGCCGGATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACCCGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGATCAACCACGGAGGAAAACTATTGACTgc > 1:333900/1‑239 (MQ=255) gAAGCCGATCGGGTATTGATTGATGATGGCTGGCTGGTCATTAGTGGCTTCAATCCCATCAGTTTTATGGGATTACGCAAACTTGTGCCGGTATTGCGCAAAACCTCGCCCTATAACAGCCGGATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAAt > 2:403288/1‑237 (MQ=255) cGATCGGGTATTGATTGATGATGGCTGGCTGGTCATTAGTGGCTTCAATCCCATCAGTTTTATGGGATTACGCAAACTTGTGCCGGTATTGCGCAAAACCTCGCCCTATAACAGCCGGATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAATGCGCa < 2:633716/237‑1 (MQ=255) 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atgatgGCTGGCTGGTCATTAGTGGCTTCAATCCCATCAGTTTTATGGGATTACGCAAACTTGTGCCGGTATTGCGCAAAACCTCGCCCTATAACAGCCGGATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAATGCGCATATTCCTGCGCTTGGtt > 1:689064/1‑237 (MQ=255) gatgGCTGGCTGGTCATTAGTGGCTTCAATCCCATCAGTTTTATGGGATTACGCAAACTTGTGCCGGTATTGCGCAAAACCTCGCCCTATAACAGCCGGATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAATGCGCATATTCCTGCGCTTGGTTGCtt < 2:689064/239‑1 (MQ=255) tggctggcTGGTCATTAGTGGCTTCAATCCCATCAGTTTTATGGGATTACGCAAACTTGTGCCGGTATTGCGCAAAACCTCGCCCTATAACAGCCGGATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAATGCGCATATTCCTGCGCTTGGTTGCTTa < 2:441069/238‑1 (MQ=255) gctggctgGTCATTAGTGGCTTCAATCCCATCAGTTTTATGGGATTACGCAAACTTGTGCCGGTATTGCGCAAAACCTCGCCCTATAACAGCCGGATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTATCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAATGCGCATATTCCTGCGCTTGGTTGCTTACa > 1:999809/1‑238 (MQ=255) gctggTCATTAGTGGCTTCAATCCCATCAGTTTTATGGGATTACGCAAACTTGTGCCGGTATTGCGCAAAACCTCGCCCTATAACAGCCGGATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGACAACTATTGAATGCGCATATTCCTGCGCTTGGTTGCTTACAACTTa > 2:492625/1‑239 (MQ=255) gctggTCATTAGTGGCTTCAATCCCATCAGTTTTATGGGATTACGCAAACTTGTGCCGGTATTGCGCAAAACCTCGCCCTATAACAGCCGGATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAATGCGCATATTCCTGCGCTTGGTTGCTTACAACTTa > 2:1141722/1‑239 (MQ=255) 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tttATGGGATTACGCAAACTTGTGCCGGTATTGCGCAAAACCTCGCCCTATAACAGCCGGATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAATGCGCATATTCCTGCGCTTGGTTGCTTACAACTTATTGTTGCCCGGAAACGGACTATTCCttt < 2:241810/236‑1 (MQ=255) ttATGGGATTACGCAAACTTGTGCCGGTATTGCGCAAAACCTCGCCCTATAACAGCCGGATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAATGCGCATATTCCTGCGCTTGGTTGCTTACAACTTATTGTTGCCCGGAAACGGACTATTCCTTTAAc > 2:60337/1‑238 (MQ=255) tGGGATTACGCAAACTTGTGCCGGTATTGCGCAAAACCTCGCCCTATAACAGCCGGATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAATGCGCATATTCCTGCGCTTGGTTGCTTACAACTTATTGTTGCCCGGAAACGGACTATTCCTTTAACGCTa > 2:509028/1‑239 (MQ=255) 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(MQ=255) | CACCGATCCGCATCGTTTATTGCGTGAAGCCGATCGGGTATTGATTGATGATGGCTGGCTGGTCATTAGTGGCTTCAATCCCATCAGTTTTATGGGATTACGCAAACTTGTGCCGGTATTGCGCAAAACCTCGCCCTATAACAGCCGGATGTTTACTCTGATGCGGCAGCTGGACTGGCTCTCTTTGTTGAATTTTGAAGTGCTACACGCCAGCCGTTTCCACGTTCTCCCGTGGAACAAACACGGAGGAAAACTATTGAATGCGCATATTCCTGCGCTTGGTTGCTTACAACTTATTGTTGCCCGGAAACGGACTATTCCTTTAACGCTAAATCCGATGAAACAGAGTAAAAACAAGCCACGAATTCGCCAGGCGGTTGGAGCCACCCGGCAATGTCGTAAACCACAGGCTTAAACTTCAACTTGGTAGCCTGTATCTTCCAGTGTGGGATTCATCGCCGCGGCACGAGC > NC_000913/235124‑235594 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |