Predicted mutation | |||||||
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New junction evidence | |||||||||||
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? | NC_000913 | 3382374 = | 107 (1.020) | coding (177/1068 nt) | degS | serine endoprotease, periplasmic |
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
ACGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCCTTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTTGTGAAGCTCTTACGTTCCGTTGCGATTGGATTAATTGTCGGCGCTATTCTGCTGGTTGCCATGCCTTCGCTGCGCAGCCTTAACCCGCTTTCCACTCCGCAATTTGACAGTACCGATGAGACGCCTGCCAGCTATAATCTGGCGGTTCGCCGCGCCGCGCCAGC‑GG‑TGGTTAACGTTTACAACCGTGGTTTGAACACCAACTCTCACAACCAGCTTGAGATCCGCACCCTGGGATCCGGTGTAATCATGGATCAACGCGGTTATATCATCACCAATAAACACGTCATCAACGACGCCGATCAGATCATCGTCGCCTTACAGGATGGACGTGTATTTGAAGCATTGCTGGTGGGATCTGACTCTCTAACCGATCTGGCGGTACTTAAAATTAATGCCACTGGCG > NC_000913/3382133‑3382606 | aCGTGTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCCTTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTTGTGAAGCTCTTACGTTCCGTTGCGATTGGATTAATTGTCGGCGCTATTCTGCTGGTTGCCATGCCTTCGCTGCGCAGCCTTAACCCGCTTTCCACTCCGCAATTTGACAGTACCGATGAGACGCCTGCCAGCTATAATCTGGCGGTTCGCCGCGCCGCGCCAGC‑gg‑tg > 2:347943/1‑239 (MQ=255) 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gtgATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCCTTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTTGTGAAGCTCTTACGTGCCGTTGCGATTGGATTAATTGTCGGCGCTATTCTGCTGTTTGCCATGCCTTCGCTGCGCAGCCTTAACCCGCTTTCCACTCCGCAATTTGACAGTACCGATGAGACGCCTGCCAGCTATAATCTGGCGGTTCGCCGCGCCGCGCCAGC‑GG‑TGGttg < 1:154680/239‑2 (MQ=255) gATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCCTTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTTGTGAAGCTCTTACGTTCCGTTGCGATTGGATTAATTGTCGGCGCTATTCTGCTGGTTGCCATGCCTTCGCTGCGCAGCCTTAACCCGCTTTCCACTCCGCAATTTGACAGTACCGATGAGACGCCTGCCAGCTATAATCTGGCGGTTCGCCGCGCCGCGCCAGC‑GG‑TGGTTAAc > 2:23953/1‑239 (MQ=255) ccGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCCTTTTTTAATGACGCCTCCAGCATGTTTGTGAAGCTCTTACGTTCCGTTGCGATTGGATTAATTGTCGGCGCTATTCTGCTGGTTGCCATGCCTTCGCTGCGCAGCCTTAACCCGCTTTCCACTCCGCAATTTGACAGTACCGATGAGACGCCTGCCAGCTATAATCTGGCGGTTCGCCGCGCCGCGCCAGC‑GG‑TGGTTAACGTTTa < 1:1042666/239‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |