| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 3,382,371 | (GGT)2→1 | 3.6% | coding (174‑176/1068 nt) | degS → | serine endoprotease, periplasmic |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3382370 | 108 (1.010) | 4 (0.040) | 4/424 | NT | 3.6% | coding (173/1068 nt) | degS | serine endoprotease, periplasmic |
| ? | NC_000913 | 3382374 = | 107 (1.020) | coding (177/1068 nt) | degS | serine endoprotease, periplasmic | |||||
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
GTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCCTTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTTGTGAAGCTCTTACGTTCCGTTGCGATTGGATTAATTGTCGGCGCTATTCTGCTGGTTGCCATGCCTTCGCTGCGCAGCCTTAACCCGCTTTCCACTCCGCAATTTGACAGTACCGATGAGACGCCTGCCAGCTATAATCTGGCGGTTCGCCGCGCCGCGCCAGCGGTGGTTAACGTTTACAACCGTGGTTTGAACACCAACTCTCACAACCAGCTTGAGATCCGCACCCTGGGATCCGGTGTAATCATGGATCAACGCGGTTATATCATCACCAATAAACACGTCATCAACGACGCCGATCAGATCATCGTCGCCTTACAGGATGGACGTGTATTTGAAGCATTGCTGGTGGGATCTGACTCTCTAACCGATCTGGCGGTACTTAAAATTAATGCCACTGGCGGT > NC_000913/3382137‑3382608 | gtgATTTCCGGTTAACTCGGTGTATGCGGCTGCTGTTCCCTTTGTTAATGACGCCTCCATCATGTTTGTGAAGCTCTTACTTTCCGTTGCGATTGGATTAATTGTCGGCGCTATTCTGCTGGTTGCCATGCCTTCGCGGCGCAGCCTTAACCCGCTTTCCACTCCGCAATTTGACAGTCCCGATGAGACGCCTGTCAGCTATAATCTGGCGGTTCGCCGCGCCGCGCCAGCAGTGGTTa < 1:1034946/239‑1 (MQ=255)gtgATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCCTTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTTGTGAAGCTCTTACGTTCCGTTGCGATTGGATTAATTGTCGGCGCTATTCTGCTGGTTGCCATGCCTTCGCTGCGCAGCCTTAACCCGCTTTCCACTCCGCAATTTGACAGTACCGATGAGACGCCTGCCAGCTATAATCTGGCGGTTCGCCGCGCCGCGCCAGCGGTGGTTa < 1:380122/239‑1 (MQ=255)gtgATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCCTTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTTGTGAAGCTCTTACGTTCCGTTGCGATTGGATTAATTGTCGGCGCTATTCTGCTGGTTGCCATGCCTTCGCTGCGCAGCCTTAACCCGCTTTCCACTCCGCAATTTGACAGTACCGATGAGACGCCTGCCAGCTATAATCTGGCGGTTCGCCGCGCCGCGCCAGCGGTGGTTa < 1:599553/239‑1 (MQ=255)gtgATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCCTTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTTGTGAAGCTCTTACGTGCCGTTGCGATTGGATTAATTGTCGGCGCTATTCTGCTGTTTGCCATGCCTTCGCTGCGCAGCCTTAACCCGCTTTCCACTCCGCAATTTGACAGTACCGATGAGACGCCTGCCAGCTATAATCTGGCGGTTCGCCGCGCCGCGCCAGCGGTGGttg < 1:154680/239‑2 (MQ=255) gATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCCTTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTTGTGAAGCTCTTACGTTCCGTTGCGATTGGATTAATTGTCGGCGCTATTCTGCTGGTTGCCATGCCTTCGCTGCGCAGCCTTAACCCGCTTTCCACTCCGCAATTTGACAGTACCGATGAGACGCCTGCCAGCTATAATCTGGCGGTTCGCCGCGCCGCGCCAGCGGTGGTTAAc > 2:23953/1‑239 (MQ=255) ccGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCCTTTTTTAATGACGCCTCCAGCATGTTTGTGAAGCTCTTACGTTCCGTTGCGATTGGATTAATTGTCGGCGCTATTCTGCTGGTTGCCATGCCTTCGCTGCGCAGCCTTAACCCGCTTTCCACTCCGCAATTTGACAGTACCGATGAGACGCCTGCCAGCTATAATCTGGCGGTTCGCCGCGCCGCGCCAGCGGTGGTTAACGTTTa < 1:1042666/239‑1 (MQ=255) gaccccGTGGTATGCTGCATCCGTTCCCTTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTTGGGAAGCTCTTACGTTCCGTTGCGATTGGATTAATTGTCGGCGCTATTCTGCTGGTTGCCATGCCTTCGCTGCGCAGCCTTAACCCGCTTTCCACGCCGCAATTTGACAGTACCGATGAGACGCCTGCCAGCTATAATCTGGCGGTTCGCCGCGCCGCGCCAGCGGTGGTTAACGTTTACAAcc < 1:244466/234‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |