| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 2,023,805 | (CTTTA)2→1 | intergenic (+127/‑159) | fliR → / → rcsA | flagellar export pore protein/transcriptional regulator of colanic acid capsular biosynthesis |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2023801 = | 1 (0.020) | 55 (1.270) | 46/266 | 0.0 | 98.3% | intergenic (+123/‑167) | fliR/rcsA | flagellar export pore protein/transcriptional regulator of colanic acid capsular biosynthesis |
| ? | NC_000913 | = 2023795 | 1 (0.020) | intergenic (+117/‑173) | fliR/rcsA | flagellar export pore protein/transcriptional regulator of colanic acid capsular biosynthesis | |||||
GCGTAACGATAATTCCCCTTACCTGAATATTTCATCATGACTAAACGGAACAACATGGGTCACCTAATGCGCCACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2023949‑2023801‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑taaagtaaaTGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAAT‑ATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTACGGAATTATATTAATGGCAATTCACTAA < NC_000913/2023795‑2023656 GCGTAACGATAATTCCCCTTACCTGAATATTTCATCATGACTAAACGGAACAACATGGGTCACCTAATGCGCCACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAA < 1:649619/143‑1 aaGATAATTACCTTTAGCTGAATATTTCATCATGACTAAACGGAATAACATGGGTCACCTAATGCGCAACTATCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAA < 2:220446/141‑1 GATAATTCCCCTTACCTGAATATTTCATCATGACTAAACGGAACAACATGGGTCACCTAATGCGCCACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAAT < 2:497488/143‑1 AATTCCCCTCACCGGAATATTTCATCATGACTAAACGGAACAACATGGGTCACCTAATGCGCCACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTT < 1:58665/143‑1 gTCCCCTTACCTGAATCTTTCATCATGACCAAACGGAACAACATGGGTCACCTAATGCGCCACTCTCGCTATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAACTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGC < 2:172659/142‑1 CCCCTTACCTGAATATTTCATCATGACTAAACGGAACAACATGGGTCACCTAATGCGCCACTCGCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGA < 2:372394/143‑1 TACCTGAATATTTCATCATGACTAAACGGAACAACATGGGTCACCTAATGCGCCACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGT < 1:540493/143‑1 CCTGAATACTCCATCATGACTAAACGGAACAACATGGGTCACCTAATGCGCCACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACCTACTATCCCGTAAAGTGGTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGA < 1:150879/143‑1 CTGAATATTTCATCATGACTAAACGGAACAACATGGGTCACCTAATGCGCCACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGcg > 2:260621/1‑141 CTGAATATTTCATCATGACTAAACGGAACAACATGGGTCACCTAATGCGCCACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAG > 1:604958/1‑143 TATTTCATCATGACTAAACGGAACAACATGGGTCACCTAATGCGCCACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGC > 2:38352/1‑143 cTTTCATCATGTCTAACGCGCACAACATGGGTCACCTAATGCGCCACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCT < 1:381058/142‑1 TTCATCATGACTAAACGGAACAACATGGGTCACCTAATGCGCCACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTA > 2:773626/1‑143 ATCATGACTAAACGGAACAACATGGGTCACCTAATGCGCCACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAA < 1:637087/143‑1 TCATGACTAAACGGAACAACATGGGTCACCTAATGCGCCACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAAC > 1:385256/1‑143 gaacgacctcaGTCACCTAATGCGCCACTCTTGCCATTTTTCAGGTGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTTTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAAT‑ATTTCGCTG < 2:601558/132‑1 ACAACATGGGTCACCTAATGCGCCACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAAT‑ATTTCGCTGCA > 1:456199/1‑143 CAACATGGGTCACCTAATGCGCACCTCTCGCTATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAAT‑ATTTCGCTGCAG < 1:716093/143‑1 ACATGGGTCACCTAATGCGCCACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAAT‑ATTTCGCTGCAGGA > 2:68928/1‑143 TGGGTCACCTAATGCGCCACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAAT‑ATTGCGCTGCAGGAGTA > 2:305886/1‑143 GGGTCACCTAATGCGCCACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTCACGTGTTGTATCATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAATAAAAGTTGAGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAAT‑ATTTCGCTGCAGGAGTAT > 1:137993/1‑143 TCACCTAATGCGCCACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAAT‑ATTTCGCTGCAGGAGTATCCT < 1:407023/143‑1 TCACCTAATGCGCCACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAAT‑ATTTCGCTGCAGGAGTATCCT < 1:126758/143‑1 CACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAAT‑ATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGT > 1:391385/1‑143 TCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAAT‑ATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTA > 2:213105/1‑143 GCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAAT‑ATTTCGCTGCAGGGGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATT > 1:330636/1‑143 GCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAAT‑ATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATT > 1:684392/1‑143 GCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAAT‑ATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATT > 1:671522/1‑143 GATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAAT‑ATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTAGTAT > 1:269069/1‑143 TTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAAT‑ATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAGGAGGTTCGTAGGTATTATTT > 1:750482/1‑143 TTCAGGCGGAGTTACTAACGCGGAAAGGGTTGGATAAGTGGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAAT‑ATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTC < 1:198275/143‑1 TTCAGCCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAAT‑ACTCCGCTGCAGGCGTACCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTC < 1:375126/143‑1 TCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGGATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAAT‑ATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCG < 2:761365/143‑1 GCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAAT‑ATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATA > 1:656398/1‑143 TTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAAT‑ATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTT > 1:363168/1‑143 ACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAAT‑ATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGGTCATCCTTAG > 1:344657/1‑143 ACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAAT‑ATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAG > 2:672049/1‑143 ACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAAT‑ATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAG < 1:604709/143‑1 CCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAAT‑ATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAA < 2:304409/143‑1 CCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAAT‑ATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTCGGATAAC > 2:145634/1‑143 CGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAAT‑ATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTGAGGGTAgcc > 1:569060/1‑140 GTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAAT‑ATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAAGATAAAAT > 1:292440/1‑143 GTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGGGAGCCTAATACAAAT‑ATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACAT > 1:548280/1‑143 AAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAAT‑ATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGAT < 2:604958/143‑1 GTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAAT‑ATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAAC < 2:655608/143‑1 TTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAAT‑ATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATAATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACG > 1:57687/1‑143 GTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATATTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAAT‑ATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTGGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAAgatt > 1:44814/1‑139 TATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAAT‑ATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGCTAAGCCTTAGGATAACATGCTAAACGTTA > 2:466781/1‑143 TAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAAT‑ATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTACG > 1:323581/1‑143 TGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGAGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAAT‑ATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTACGGAATT < 2:662714/143‑1 GCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAAGGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAAT‑ATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTACGGAATTA < 1:260621/143‑1 TGGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAAT‑ATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTCGGATAACATGATAAACGTTACGGACTTAGAT > 2:149573/1‑143 GGAATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAAT‑ATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTACGGAATTATATT > 1:25683/1‑143 atttgctgAAAGTCATTGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAAT‑ATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTACGGAATTATATTAAT < 2:20548/135‑1 ATTTTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAAT‑ATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGGTAAACGTTACGGAATTATATTAAT < 2:385256/143‑1 ATTGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAAT‑ATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTACGGAATTATATTAAT < 1:70853/143‑1 TCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTT‑GAACAAATGATTTCTCTGCAGGAGTAGCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAACACTTAGGATAACATGATAAACGTTACGGAATTATATTAATGGCA > 2:786898/1‑143 TTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAAT‑ATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTACGGAATTATATTAATGGCAAT > 2:598978/1‑143 AAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAAT‑ATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTACGGAATTATATTAATGGCAATTC > 2:574199/1‑143 GTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAAT‑ATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTACGGAATTATCTTAATGACAATTAACT > 2:537794/1‑143 AAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAAT‑ATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTACGGAATTATATTAATGGCAATTCACTAA < 1:379038/143‑1 GCGTAACGATAATTCCCCTTACCTGAATATTTCATCATGACTAAACGGAACAACATGGGTCACCTAATGCGCCACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAATTGTCTTAAAGTAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2023949‑2023801‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑taaagtaaaTGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAAT‑ATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTACGGAATTATATTAATGGCAATTCACTAA < NC_000913/2023795‑2023656 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |