Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
MC JC | NC_000913 | 1,978,503 | Δ776 bp | insB1–insA | insB1, insA |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 1978503–1979269 | 1979278 | 10–776 | 93 [0] | [0] 94 | insB1–insA | insB1, insA |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 1978502 | 0 (0.000) | 85 (1.150) | 66/268 | 0.0 | 100% | intergenic (‑305/+16) | flhD/insB1 | flagellar class II regulon transcriptional activator, with FlhC/IS1 transposase B |
? | NC_000913 | 1979279 = | 0 (0.000) | intergenic (‑64/‑474) | insA/uspC | IS1 repressor TnpA/universal stress protein |
GGGTCTTTACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCAC‑ACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCG > NC_000913/1978361‑1978643 | gggTCTTTACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCCACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCAC‑ACAAAACACTCCATTACGTAACATAAATGt > 2:1244738‑M1/1‑142 (MQ=255) gTCTTTACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCAC‑ACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtat > 1:962266‑M1/1‑140 (MQ=255) ccgtacaGTAATCTAAGATTTTTCCTAAAACGAGGCAACTGTAGTCGTCACCACACGCACATACAACTGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCATAATGCAGATCAC‑ACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataa < 2:1254503‑M1/140‑6 (MQ=255) tttACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCAC‑ACAAAACCGTCAATTACTTAACATAAATGtatagg > 1:786738‑M1/1‑137 (MQ=255) tcacacgtATCTAAGATTTTTCCTTAATCGTCGGAATTGTACTCGTCACTACACGCACATCCAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCAC‑ACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagt < 1:1282843‑M1/141‑8 (MQ=255) acacTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCAC‑ACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtca < 1:716339‑M1/143‑10 (MQ=255) tATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCAC‑ACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatactt < 2:321160‑M1/143‑15 (MQ=255) cTAAGATGTTTCCGAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCAC‑ACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttg < 2:980118‑M1/143‑18 (MQ=255) tAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCAC‑ACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataactcatacttttgt > 2:1294703‑M1/1‑125 (MQ=255) tAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGAGCAC‑ACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGaataagccatactctcga > 2:739912‑M1/1‑125 (MQ=255) aaGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCAC‑ACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgct > 2:267469‑M1/1‑124 (MQ=255) aGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCAC‑ACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttt > 1:893042‑M1/1‑123 (MQ=255) aGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACAGACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGAGAGGCAGATCAC‑GCAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtatacgtcatactttcgttt > 2:825491‑M1/1‑123 (MQ=255) ggttttgccTAAATCGACGCCACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCAC‑ACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgtttt < 2:436644‑M1/141‑22 (MQ=255) gATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCAC‑ACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgtttt < 1:1008461‑M1/143‑22 (MQ=255) aTTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCAC‑ACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttg > 1:580425‑M1/1‑121 (MQ=255) tttttCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCAC‑ACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgg < 1:1025851‑M1/143‑24 (MQ=255) tttttCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCAC‑ACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttctgg < 1:601538‑M1/143‑24 (MQ=255) ccTAATTCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGTTTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCAC‑ACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgta < 1:841634‑M1/143‑29 (MQ=255) aaaTCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCAC‑ACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATTgataattcaaacttttgttttgggagtactt > 2:615727‑M1/1‑112 (MQ=255) tCGACGCAACTGTACTCGCCACAACACGCGCGTACGACGGAGGGGAGCTGCTATTGTCAATAATGCGTGATGCAGATCAC‑ACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaa < 1:504995‑M1/143‑35 (MQ=255) cgccgcaACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCAC‑ACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaat < 1:90238‑M1/140‑36 (MQ=255) cGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCAC‑ACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaat < 1:327272‑M1/143‑36 (MQ=255) gACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGAGTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCAC‑ACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatactgttgttttgagtgtatatgaatc > 2:176774‑M1/1‑107 (MQ=255) aCGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCAC‑ACAAAACAATCAATTACTTAACATAAATGtataagacatacttttgttttgggtgtatttcaatct > 2:1024565‑M1/1‑106 (MQ=255) cGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCAC‑ACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctg > 2:1217456‑M1/1‑105 (MQ=255) aaCTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCAC‑ACAAAACACTCAATTACTTCACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgtta > 2:628266‑M1/1‑102 (MQ=255) aaCTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCAC‑ACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggcgtatttcaatctgtta > 2:510184‑M1/1‑102 (MQ=255) tGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCAC‑ACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaa > 2:165315‑M1/1‑99 (MQ=255) cTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCAC‑ACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtctttcaatctgttcaaatgtt > 2:863572‑M1/1‑95 (MQ=255) tCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCAC‑ACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagttt > 1:968613‑M1/1‑94 (MQ=255) tCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCAC‑ACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttccgggagtacgtctatctgttaaaaagttg > 1:1278975‑M1/1‑94 (MQ=255) gTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCAG‑ACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatatgttaacaagttttt > 2:453235‑M1/1‑92 (MQ=255) gTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCAC‑ACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagttttt < 1:556851‑M1/143‑52 (MQ=255) gTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGAACAC‑ACAAAACAGTCAATTACTTAACATAAATGgatacgtcagacctttgtcttgggtgtatttcaatctgctaaaaagttgtt > 2:453417‑M1/1‑92 (MQ=255) acGCACATACATCGGAGGGTGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCAC‑ACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgc < 2:422358‑M1/143‑60 (MQ=255) acGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCTAAACAC‑ACAAAACCCTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgc < 1:929348‑M1/143‑60 (MQ=255) acGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCAC‑ACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgc > 1:876907‑M1/1‑84 (MQ=255) acaTACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCAC‑ACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagc < 1:16866‑M1/143‑64 (MQ=255) acaTACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCAC‑ACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagc > 1:833574‑M1/1‑80 (MQ=255) aTACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATGAA‑ACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaa > 1:516407‑M1/1‑78 (MQ=255) tACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCAC‑ACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgttagcaag > 2:900383‑M1/1‑77 (MQ=255) aCAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCAC‑ACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcatgc > 2:1136291‑M1/1‑76 (MQ=255) tacGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCAC‑ACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaa < 1:1342158‑M1/142‑70 (MQ=255) aaCGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCAC‑ACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaa > 1:807252‑M1/1‑74 (MQ=255) ggAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTTATGCAGATCAC‑ACAAATCACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaa < 2:63565‑M1/143‑73 (MQ=255) ggAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCAC‑ACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttctttctgttaaaaagtttttcgctccgctagcaagcaaaaa > 1:143008‑M1/1‑71 (MQ=255) aGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCAC‑ACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatg > 2:642948‑M1/1‑69 (MQ=255) ggggggCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCAC‑ACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacactcgcaagcaaaaatga > 2:70557‑M1/1‑68 (MQ=255) gggggCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCAC‑ACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtatacgtcatacttttgttttgggtgtatttcactctgttaaaaagtttttcgctacgctagcacgcaacaatgaa > 1:1146150‑M1/1‑67 (MQ=255) gCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCAC‑ACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacag > 1:967111‑M1/1‑63 (MQ=255) tGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCAC‑ACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaaacaaacatgaaacccga > 2:403929‑M1/1‑61 (MQ=255) tttCAATAATGCGTGATGCGGATCAC‑AAAACACACTCATATACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatc < 1:1286537‑M1/143‑89 (MQ=255) gttcAATAATGCGTGATGCAGATCAC‑ACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatc < 1:1319156‑M1/142‑89 (MQ=255) ttCAATAATGCGTGATGCAGATCAC‑ACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatcg > 1:320920‑M1/1‑54 (MQ=255) tCAATAATGCGTGATGCAGATCAC‑ACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatcga > 1:1033343‑M1/1‑53 (MQ=255) ataatGCGTGATGCAGATCAC‑ACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatcgaaat < 1:24069‑M1/143‑94 (MQ=255) taatGCGTGATGCAGATCAC‑ACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatcgaaatg > 1:1343723‑M1/1‑49 (MQ=255) aatGCGTGATGCAGATCAC‑ACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatcgaaatgg < 1:1024846‑M1/143‑96 (MQ=255) aatGCGTGATGCAGATCAC‑ACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatcgaaatgg > 1:783735‑M1/1‑48 (MQ=255) aaggcgtGATGCAGA‑CACAACATGGCGCTCTATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacagcaataatcgaaatgg < 2:534082‑M1/140‑96 (MQ=255) cgcGTGATGCAGATCAC‑ACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGgataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttagctacgctagtaagcaaaaatgaaacaggaataatcgaaatggga < 2:972982‑M1/142‑98 (MQ=255) gTGATGCAGATCAC‑ACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctcgcaagcaaaaatgaaacaggaataatcgaaatgggatat > 1:473300‑M1/1‑43 (MQ=255) gCAGATCAC‑ACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatcgaaatgggatgttgcgc > 1:1155894‑M1/1‑38 (MQ=255) cac‑acaAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatcgaaatgggatgttgcgcacagtc < 1:299650‑M1/143‑112 (MQ=255) ac‑acaAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttcaaaagtttttcgctaagctagcaggcaaaaatgaaacaggaataatcgaaatgggatgttgcgcacagtca > 1:163798‑M1/1‑31 (MQ=255) c‑acaAAACACTCAATTACTTGACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtggatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatcgaaatgggatgttgcgcacagtcaa < 1:952450‑M1/143‑114 (MQ=255) c‑acaAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctcgcaagcaataattaaacaggaataatcgaaatgggatgttgcgcacagtcac > 1:1290396‑M1/1‑30 (MQ=255) c‑acaAAACACTCAATGACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatcgagatgggatgttgcgaacagtcaa > 2:1148729‑M1/1‑30 (MQ=255) acaAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatcgaaatgggatgttgcgcacagtcaaa > 2:877327‑M1/1‑29 (MQ=255) acaAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatcgaaatgggatgttgcgaacagaaaaa > 2:696975‑M1/1‑29 (MQ=255) caAAACACTCAATTACTTATCATAAATTtataactcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttctctacgctagcaagcaaaaatgaaacagtaataatcgaaatgggatgttgcgcacagtcaaaa < 2:363837‑M1/143‑116 (MQ=255) aaCACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatactgttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatcgaaatgggatgttgcgcacagtcaaaataa < 1:1337265‑M1/143‑119 (MQ=255) aaCACTCAATTACTGAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatcgaaatgggatgttgcgcacagtcaaaataa < 1:369753‑M1/143‑119 (MQ=255) actcgtttcgttaacttacatgtataagtcagacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatcgaaatgggatgttgcgcacagtcaaaataactc < 2:1032873‑M1/133‑122 (MQ=255) tCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtttatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataattgaaataggctgttgataacagtaaaaataagtcac > 2:776815‑M1/1‑20 (MQ=255) cAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatcgaaatgggatgttgcgcacagtcaaaataactcacc > 1:131024‑M1/1‑19 (MQ=255) aaTTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatcgaaatgggatgttgcgcacagtcagactgagcgaccg > 1:681735‑M1/1‑18 (MQ=255) aaTTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatcgaaatgggatgttgcgcacagtcaaaataactcaccg < 1:895599‑M1/143‑126 (MQ=255) aTTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatcgaaatgggatgttgcgcacagtcaaaataactcaccgt < 1:165315‑M1/143‑127 (MQ=255) aTTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatcgaaatgggatgttgcgcacagtcaaaataactcaccgt > 1:798229‑M1/1‑17 (MQ=255) cTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatcgaaatgagatgttgcgcacagtccaaataactaaccgtaaat > 2:840393‑M1/1‑13 (MQ=255) ttAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatcgaaatgggatgttgcgcacagtcaaaataactcaccgtaaata > 2:1050204‑M1/1‑12 (MQ=255) ttAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatcgaaatgggatgttgcgcacagtcaaaataactcaccgtaaata > 1:672732‑M1/1‑12 (MQ=255) aCATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatcgaaatgggatgttgcgcacagtcaaaataactcaccgtaaataatc > 2:701285‑M1/1‑9 (MQ=255) cATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatcgaaatgggatgttgcgcacagtcaaaataactcaccgtaaataatca > 1:422289‑M1/1‑8 (MQ=255) aTAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcgaaaatgaaacaggaataatcgaaatgggatgttgcgcacagtcaaaataactccccgtaaataatcac > 1:417103‑M1/1‑7 (MQ=255) aTAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacagtaataatcgaaatgggatgttccgcacagtcaaaataactcaacgtacataataat > 2:602579‑M1/1‑7 (MQ=255) aTAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatcgaaattggatgttgcgcacagtcaaaataactcaccgtaaataatcat > 2:1150083‑M1/1‑7 (MQ=255) aaTGtataagtcatacttttggtgtgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatcgaaatgggatgttgcgcacagtcaaaataactcaccgtaaataatcatctg < 1:1244738‑M1/143‑140 (MQ=255) tGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcactctgttaaaaagtttttcgctacgcgagcatgcaaaactgaaacaggaataatcgacacgggtgcttgcgcacagccaaaataactcaccgtaaatgatcatccggt > 2:766997‑M1/1‑2 (MQ=255) tGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatcgaaatgggatgttgcgcacagtcaaaataactcaccgtaaataatgatctgat > 1:1049189‑M1/1‑2 (MQ=255) tGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagcaagcaaaaatgaaacaggaataatcgaaatgggatgttgcgcacagtcaaaataactcaccgtaaataatcatctgct > 1:797608‑M1/1‑2 (MQ=255) | GGGTCTTTACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCAC‑ACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCG > NC_000913/1978361‑1978643 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |