| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 186,137:1 | +CCC | 10.1% | coding (2514/2673 nt) | glnD ← | uridylyltransferase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 186134 | 54 (1.010) | 6 (0.110) +CCC |
6/490 | NT | 10.1% | coding (2517/2673 nt) | glnD | uridylyltransferase |
| ? | NC_000913 | 186135 = | 54 (1.000) | coding (2516/2673 nt) | glnD | uridylyltransferase | |||||
CCGCTTCGCGGGTAACGGTGTCTGCATTGGCTGGCGTGATCTCGGCACGGCGTTCAAAAGCGGTTTCAATAATGTTCTGTAACTGCTGCATTGTTAAACTCTTTTCATATCAGTAAACACATCACCCTTTATCGTTTGGATTGAGGGCCTCTGTCAACCGCTGATGCACTTCCTGCTGCAACTCGTTATTAAGCGCACGCCGGTCAGCGGTGGCAATTATGAATAAATCTTCTACTCGCTCGCCAATGGTTGTAATTCGGGCACCATGAAGCGAAATTCCCAGATCGGCAAAAATTTTCCCGACTCGCGCCAGCAGTCCAGGTTGGTCGAGGGCGATCAGTTCGAGGAACGATTTGCGGTCGGTATGGGTCGGCAAAAACGTTACTTCGGTTTCAACAGTAAAATGGCGTAATTTGGCGGGTTGGCGACGGGGCTGCGGTGGCTGCCAGCTACTTTGCGTCAGTACTTGCTCCAGACCAAACCGAATAACCTCATGACGATCTGCGGACAGCGGGTTGCCATCGGGTTCCAGCACGATAAAGGTATCCAT > NC_000913/185857‑186406 | ccGCTTCGCGGGTAACGGTGTCTGCATTGGCTGGCGTGATCTCGGCACGGCGTTCAAAAGCGGTTTCAATAATGTTCTGTAACTGCTGCATTGTTAAACTCTTTTCATATCAGTAAACACATCACCCTTTATCGTTTGGATTGAGGGCCTCTGTCAACCGCTGATGCACTTCCTGCTGCAACTCGTTATTAAGCGCACGCCGGTCAGCGGTGGCAATTATGAATAAATCTTCTACTCGCTCGCCAATGGTTGTAATTCGGGCACCATGAAGCGAAATTCCCAGCTCGGc > 2:133907/1‑289 (MQ=255) tGCATTGGCTGGCGTGATCTCGGCACGGCGTTCAAAAGCGGTTTCAATAATGTTCTGTAACTGCTGCATTGTTAAACTCTTTTCATATCAGTAAACACATCACCCTTTATCGTTTGGATTGAGGGCCTCTGTCAACCGCTGATGCACTTCCTGCTGCAACTCGTTATTAAGCGCACGCCGGTCAGCGGTGGCAATTATGAATAAATCTTCTACTCGCTCGCCAATGGTTGTAATTCGGGCACCATGAAGCGAAATTCCCAGATCGGCAAAAATTTTCCCGACTCGCGcc < 1:109711/289‑1 (MQ=255) ggctggcGTGATCTCGGCACGGCGTTCAAAAGCGGTTTCAATAATGTTCTGTAACTGCTGCATTGTTAAACTCTTTTCATATCAGTAAACACATCACCCTTTATCGTTTGGATTGAGGGCCTCTGTCAACCGCTGATGCACTTCCTGCTGCAACTCGTTATTAAGCGCACGCCGGTCAGCGGTGGCAATTATGAATAAATCTTCTACTCGCTCGCCAATGGTTGTAATTCGGGCACCATGAAGCGAAATTCCCAGATCGGCAAAAATTTTCCCGACTCGCGCcagcag > 2:350973/1‑288 (MQ=255) cGTGATCTCGGCACGGCGTTCAAAAGCGGTTTCAATAATGTTCTGTAACTGCTGCATTGTTAAACTCTTTTCATATCAGTAAACACATCACCCTTTATCGTTTGGATTGAGGGCCTCTGTCAACCGCTGATGCACTTCCTGCTGCAACTCGTTATTAAGCGCACGCCGGTCAGCGGTGGCAATTATGAATAAATCTTCTACTCGCTCGCCAATGGTTGTAATTCGGGCACCATGAAGCGAAATTCCCAGATCGGCAAAAATTTTCCCGACTCGCGCCAGCAGTCCAGGt > 1:49958/1‑289 (MQ=255) 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aaTTCGGGCACCATGAAGCGAAATTCCCAGATCGGCAAAAATTTTCCCGACTCGCGCCAGCAGTCCAGGTTGGTCGAGGGCGATCAGTTCGAGGAACGATTTGCGGTCGGTATGGGTCGGCAAAAACGTTACTTCGGTTTCAACAGTAAAATGGCGTAATTTGGCGGGTTGGCGACGGGGCTGCGGTGGCTGCCAg > 2:175294/1‑196 (MQ=255) aaTTCGGGCACCATGAAGCGAAATTCCCAGATCGGCAAAAATTTTCCCGACTCGCGCCAGCAGTCCAGGTTGGTCGAGGGCGATCAGTTCGAGGAACGATTTGCGGTCGGTATGGGTCGGCAAAAACGTTACTTCGGTTTCAACAGTAAAATGGCGTAATTTGGCGGGTTGGCGACGGGGCTGCGGTGGCTGCCAg < 1:175294/196‑1 (MQ=255) cGGGCACCATGAAGCGAAATTCCCAGATCGGCAAAAATTTTCCCGACTCGCGCCAGCAGTCCAGGTTGGTCGAGGGCGATCAGTTCGAGGAACGATTTGCGGTCGGTATGGGTCGGCAAAAACGTTACTTCGGTTTCAACAGTAAAATGGCGTAATTTGGCGGGTTGGCGACGGGGCTGCGGTGGCTGCCAGCTACTTTGCGTCAGTACTTGCTCCAGACCAAACCGAATAACCTCATGACGATCTGCGGACAGCGGGTTGCCATCGGGTTCCAGCACGATAGAGGTa > 1:307995/1‑288 (MQ=255) cGGGCACCATGAAGCGAAATTCCCAGATCGGCAAAAATTTTCCCGACTCGCGCCAGCAGTCCAGGTTGGTCGAGGGCGATCAGTTCGAGGAACGATTTGCGGTCGGTATGGGTCGGCAAAAACGTTACTTCGGTTTCAACAGTAAAATGGCGTAATTTGGCGGGTTGGCGACGGGGCTGCGGTGGCTGCCAGCTACTTTGCGTCAGTACTTGCTCCAGACCAAACCGAATAACCTCATGACGATCTGCGGACAGCGGGTTGCCATCGGGTTCCAGCACGATAAAGGTa > 1:362240/1‑288 (MQ=255) gCACCATGAAGCGAAATTCCCAGATCGGCAAAAATTTTCCCGACTCGCGCCAGCAGTCCAGGTTGGTCGAGGGCGATCAGTTCGAGGAACGATTTGCGGTCGGTATGGGTCGGCAAAAACGTTACTTCGGTTTCAACAGTAAAATGGCGTAATTTGGCGGGTTGGCGACGGGGCTGCGGTGGCTGCCAGCTACTTTGCGTCAGTACTTGCTCCAGACCAAACCGAATAACCTCATGACGATCTGCGGACAGCGGGTTGCCATCGGGTTCCAGCACGATAGAGGTATcc < 2:307995/288‑1 (MQ=255) aCCATGAAGCGAAATTCCCAGATCGGCAAAAATTTTCCCGACTCGCGCCAGCAGTCCAGGTTGGTCGAGGGCGATCAGTTCGAGGAACGATTTGCGGTCGGTATGGGTCGGCAAAAACGTTACTTCGGTTTCAACAGTAAAATGGCGTAATTTGGCGGGTTGGCGACGGGGCTGCGGTGGCTGCCAGCTACTTTGCGTCAGTACTTGCTCCAGACCAAACCGAATAACCTCATGACGATCTGCGGACAGCGGGTTGCCATCGGGTTCCAGCACGATAAAgggtgatgt < 1:219183/288‑8 (MQ=255) | CCGCTTCGCGGGTAACGGTGTCTGCATTGGCTGGCGTGATCTCGGCACGGCGTTCAAAAGCGGTTTCAATAATGTTCTGTAACTGCTGCATTGTTAAACTCTTTTCATATCAGTAAACACATCACCCTTTATCGTTTGGATTGAGGGCCTCTGTCAACCGCTGATGCACTTCCTGCTGCAACTCGTTATTAAGCGCACGCCGGTCAGCGGTGGCAATTATGAATAAATCTTCTACTCGCTCGCCAATGGTTGTAATTCGGGCACCATGAAGCGAAATTCCCAGATCGGCAAAAATTTTCCCGACTCGCGCCAGCAGTCCAGGTTGGTCGAGGGCGATCAGTTCGAGGAACGATTTGCGGTCGGTATGGGTCGGCAAAAACGTTACTTCGGTTTCAACAGTAAAATGGCGTAATTTGGCGGGTTGGCGACGGGGCTGCGGTGGCTGCCAGCTACTTTGCGTCAGTACTTGCTCCAGACCAAACCGAATAACCTCATGACGATCTGCGGACAGCGGGTTGCCATCGGGTTCCAGCACGATAAAGGTATCCAT > NC_000913/185857‑186406 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |