| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 1,978,503 | Δ776 bp | insB1–insA | insB1, insA | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 1978503–1979268 | 1979278 | 11–776 | 76 [0] | [1] 78 | insB1–insA | insB1, insA |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1978502 | 0 (0.000) | 71 (1.000) | 53/266 | 0.2 | 100% | intergenic (‑305/+16) | flhD/insB1 | flagellar class II regulon transcriptional activator, with FlhC/IS1 transposase B |
| ? | NC_000913 | 1979279 = | 0 (0.000) | intergenic (‑64/‑474) | insA/uspC | IS1 repressor TnpA/universal stress protein | |||||
ATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATG‑CGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1978353‑1978502‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cataaatgTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTA > NC_000913/1979279‑1979420 ATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATG‑CGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAAC < 1:330377/143‑1ATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCAAATAAAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATG‑CGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAAC > 1:247179/1‑143 ATGGGTCTTTACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATG‑CGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAAT < 1:588768/143‑1 ctgTACACTTATCTAAGATGTTTCCTAAACCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATG‑CGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAA < 1:782856/140‑1 CTTTACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTACGATTTTCAATAATG‑CGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAA < 2:369199/143‑1 TTTACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATG‑CGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTAAAAG > 2:778033/1‑143 ACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGCGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATG‑CGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCA > 1:1269706/1‑143 ACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTT‑AACAAGGCCAGGGTGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCA > 1:606547/1‑143 ACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATG‑CGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATA > 1:1118452/1‑143 AAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTGCTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATG‑CGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTT > 1:874072/1‑143 ATTTTTTCTATATCGACGTACATTTACTCGTTACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCTATTTTCAATAATG‑CGTGATGCAGATCACACAATACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTG < 2:319001/143‑1 ttgcTCCGAAATCGACGTGACTGTACGCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATG‑CGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAAGTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGG < 2:924814/139‑1 TTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATG‑CGTGATGCAGATCACACAAAACACTCACATACAAATTATTGTTTTATAAGTCATACTTTTGTCTTGG > 1:239511/1‑143 CTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATG‑CGTGATGCAGATCACACAAAACGCTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACCTTTGTGTTGGGTGTAT > 1:609930/1‑143 CTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGACTTTCAATAATG‑CGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGTTGTAT > 2:112204/1‑143 TAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGCTTTTCAATACTG‑AGTGATGCAGACCACACAAAACACTCAATTACTTAACATACCTGTATACGTCATACTATTGCTCTGGGTGTATT > 2:302010/1‑143 TAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATG‑CGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATT > 2:116027/1‑143 TAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATG‑CGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTAGTTTTGGATGTATT > 2:22034/1‑143 AAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATG‑CGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTT < 2:61579/143‑1 ATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATG‑CGTGATGCAGATCGCACAAAACACCCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACGTTTGTTTTGGGTGTATTTCA > 2:193200/1‑143 CGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATG‑CGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATATATAAGTCATACTTTTGTATTGGGTGTATATCAAT > 2:410136/1‑143 CGACGCAACGGTACTCGTCTCTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATG‑CGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAAT < 2:1272329/143‑1 GACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATG‑CGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATC > 2:726242/1‑143 ACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATG‑CGTGATCCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCAAACTTTTGTTTTTGTTGTATATAAATCT > 2:33321/1‑143 CTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATG‑CGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAA < 1:6077/143‑1 TGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATG‑CGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAA > 1:346078/1‑143 GTACTCGTCTCTACACGCACGTACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATG‑CGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACAAAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAA < 2:1261094/143‑1 TACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATG‑CGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAA < 2:1210928/142‑1 TACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATG‑CGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAA > 1:1210928/1‑142 TACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATG‑CGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTCTTAAAAAG > 2:500654/1‑143 TACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATG‑CGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTT‑TTTTGGGTGTATTTCCATCTGTTAAAAAGT > 1:759304/1‑143 TCGTCAGTACACGCACTTACAACGGAGGTGCGCTGCGATTTTCAATAATG‑CGTGATGCAGATCACACAAAACTCTCAATTACTTAACTTAAACGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTGAAAAAGTTT < 2:371520/143‑1 TCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATG‑CGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGAATTTCAATCTGTTAAAAAGTTT > 1:448446/1‑143 GTCACTACACGCACCTGCAACGGAGGCGGGCTGCGATTTTCAATAATG‑CGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTGAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTT < 2:520701/143‑1 CTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATG‑CGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCT > 1:477862/1‑143 GCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATG‑CGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTA > 2:114463/1‑143 ACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATG‑CGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTGTTCGCTTCGCTAGC > 2:852493/1‑143 TACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATG‑CGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAG < 2:247179/143‑1 CAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATG‑CGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCA > 1:263929/1‑143 GGAGGTGCGCTTCGATTTTCAATAATG‑CGTGATGCATATCACATAAAGCACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTCTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAA < 2:520324/143‑1 GGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATG‑CGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAA < 1:1047981/143‑1 GGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATG‑CGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAA < 1:25332/143‑1 GGAGGGGGGCTGCACTTTTCAACAATG‑CGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGCGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAA < 2:621368/143‑1 GAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATG‑CGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGGATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAAT < 1:138081/143‑1 GGGGCTGCGATTTTCAATAATG‑CGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAA < 1:1293057/143‑1 GGCTGCGATTTTCAATAATG‑CGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACA < 1:1215019/143‑1 GCTGCGATTTTCAATAATG‑CGTCATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAG < 1:980149/143‑1 CTGCGATTTTCAATAATG‑CGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATATGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCCAAAATGAAATAGG > 2:263353/1‑143 TTTCAATAATG‑CGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAACCGTTTATGTGCACGCGAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATC > 2:271345/1‑143 TCAATAATG‑CGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGCTTCTGTCGACGCGAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGA > 2:272223/1‑143 TAATG‑CGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGACTCATCGAAATG > 1:326789/1‑143 TAAGG‑CGTTATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTGTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGGTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATG < 1:39227/143‑1 tcacgcgtccaGCATATCACCCACAACACTCACCTGCTTAACCTAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATG < 1:42094/132‑1 AATG‑CGTCATGCAGATCACGTAGAACACTCAAGTACTTAACGTAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTGTTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGG < 2:661478/143‑1 ATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGC > 1:976131/1‑143 GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCTCTACGCTAGCAAGCAATCATGAAACAGGAATCATCGAAATGGGATACTGCGC > 2:1020145/1‑143 GCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGC > 2:882346/1‑143 AGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCAC > 2:502281/1‑143 GATTACACAAAAGACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGGGGATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCGAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACA < 2:554637/143‑1 GATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACA < 1:778033/143‑1 GATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACA < 2:706081/143‑1 TCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGT < 1:344713/143‑1 CACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTC < 1:922488/143‑1 ACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAA > 1:1201659/1‑143 AAAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTAAGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCAAAGTCAAAAT > 1:976328/1‑143 AAACACTCAATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATA > 1:726642/1‑143 AATTACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCG > 2:862537/1‑143 TTACGTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTAGTTCAATCTGTTAAAAAGTGTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAACCAAGAATGATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTA < 2:1076361/143‑1 TACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAACAGTTCTTCGCTACGCTAGCATGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAA > 1:971041/1‑143 TACTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCCAAATAACTCACCGTAA > 1:763756/1‑143 CTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCTAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCATAAAT > 1:590472/1‑143 CTTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAAT > 1:1215701/1‑143 TTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAAT > 2:176850/1‑85 TTAACATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAAT < 1:176850/85‑1 ATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGAAACAAACAACAAGTGAGAAGCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAACTAATCAT > 1:609107/1‑143 AATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTG > 2:849203/1‑143 GTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTATCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTA > 1:1266816/1‑143 GTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCCTAAACAAGCATCCGCTg > 1:155765/1‑142 GTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAAAAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGGACAGACAAAATAACTCGCGGTAAGTAATCATATGGTA > 1:742535/1‑143 ATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATG‑CGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1978353‑1978502‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cataaatgTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTA > NC_000913/1979279‑1979420 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |