| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 3,815,858 | Δ82 bp | [rph]–[rph] | [rph], [rph] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 3815858 | 3815939 | 82 | 44 [0] | [0] 44 | [rph]–[rph] | [rph], [rph] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3815857 | 0 (0.000) | 40 (1.120) | 31/264 | 0.1 | 100% | pseudogene (24/48 nt) | rph | ribonuclease PH (defective),enzyme, Degradation of RNA, RNase PH |
| ? | NC_000913 | 3815940 = | 0 (0.000) | pseudogene (609/669 nt) | rph | ribonuclease PH (defective),enzyme, Degradation of RNA, RNase PH | |||||
ACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCGTCGCTACAATGGATTCGATTCCCCTCGGGCCAGAGCCAACAAGATGAGTAGCTCTTCATGGGTGAACGGCTCGCCTTCTGCCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAACTGCGGCTACCATCCCT > NC_000913/3815798‑3816081 | acacctgcttgctaagcgcaaattcaataaactggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcc < 2:576090‑M2/1‑1 (MQ=255) tcctgcttgctaagcgcaaattcaataaactggcgcttatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGt < 1:125099‑M2/3‑1 (MQ=255) tgcttgctaagcgcaaattcaataaactggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTccc < 2:423333‑M2/6‑1 (MQ=255) tgcttgctaagcgcaaattcaataaactggcgctgatatggtttcatgccctcgctcctcttcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTccc < 2:383488‑M2/6‑1 (MQ=255) gcttgctaagcgcaaattcaataaactggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttaccagcgccgccttctgcCGTcccc > 1:421834‑M2/137‑143 (MQ=255) cttgctaagcgcaaattcaataaactggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCt < 1:546495‑M2/8‑1 (MQ=255) gctaagcgcaaattcaataaactggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCa < 1:150470‑M2/11‑1 (MQ=255) taagcgcaaattcaataaactggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctacCGTACCCTGCACt > 1:565552‑M2/131‑143 (MQ=255) gcaaattcaataaactgtcgcttatatggtgtcatgccttcgctcctcatcttactattctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAat < 1:326053‑M2/18‑1 (MQ=255) ggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCg < 2:101001‑M2/34‑1 (MQ=255) gccgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCg < 2:202626‑M2/34‑1 (MQ=255) gctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATCATGCGCCCGTCTtcggcc > 2:457353‑M2/107‑141 (MQ=255) gctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacggttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtggccttaaaaatcggtttgccagcgcggccttcagcGATCCCCTGCACTCcaatggtgcgccctgcgtcgctc > 1:287303‑M2/107‑133 (MQ=255) tggtatcatgccttcgctccgcatcttacgtgtctacagacaaaaaaaaggcgactcagcagtcgccttaaaaatcagtctgccagcgctgcgttcggcTGGCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTa < 1:300737‑M2/44‑1 (MQ=255) ggtttcatgcctgcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTAc < 2:377094‑M2/45‑1 (MQ=255) tttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaacaaggcgcctcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCCTCCGGCACCACCACGt > 1:158451‑M2/97‑143 (MQ=255) cttcgcacctcatcttacttctctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAAAGAAGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCg < 1:609204‑M2/55‑1 (MQ=255) cctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGtcggtacct > 1:173007‑M2/83‑139 (MQ=255) taatcttactgttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCCATGATGCGCCCGACTTCGGTCCTCACTACGCTCATGTCGGTCTCTGCg > 1:174073‑M2/80‑143 (MQ=255) tcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCACTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTGTCTGCGGCa > 2:362791‑M2/77‑143 (MQ=255) cttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCag > 2:424829‑M2/76‑143 (MQ=255) ttccttttctacaggcaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtctgccagcgccgccttctgcCGGCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCaga < 2:13247‑M2/69‑1 (MQ=255) ttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCTCCTGCACTTCAATGATCCGCCCGTCTTCCGTCACCGCTACGTTCCTTGCGGTCcccgcggccgccact > 2:204227‑M2/71‑136 (MQ=255) ttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCCGCGGCAGCGtcc > 2:272409‑M2/71‑142 (MQ=255) ttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGGTCATGTCGCTCTCTGCcgcagaggcg > 1:345649‑M2/71‑140 (MQ=255) ttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTCCGGTCCTCACTACGTTCATGTCGCGCTCTGCGGCAGAGTCt > 1:377732‑M2/71‑143 (MQ=255) ttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGCCTTc > 2:529669‑M2/69‑143 (MQ=255) ctacctacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaagcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCaa < 2:450975‑M2/77‑1 (MQ=255) ctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTCCATGTCGGTCTCTGCGGCAGGGTCTTCaa > 2:155194‑M2/67‑143 (MQ=255) tacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTtcacc > 1:304666‑M2/66‑141 (MQ=255) agacaaaaaaagggcgacgcatcgggcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTa < 1:230119‑M2/81‑1 (MQ=255) tttttaaggcgactgatgagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGCCATCACTACGCTCATGTCGGTCTCTGCGGCGGTGTCTTCAACGTACTCCa > 2:97942‑M2/58‑143 (MQ=255) ataaaaaggcgcctcatcagtcgccttaatgatccgtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCa < 1:72215‑M2/86‑1 (MQ=255) aaacggcgcctcatctctcgccttaaacatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGCTGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGAt < 1:318677‑M2/89‑1 (MQ=255) aaaggcgattcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATc < 1:537119‑M2/90‑1 (MQ=255) aaaggcgactcatcagtcgtgttagagttcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATc < 2:519086‑M2/90‑1 (MQ=255) gactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGCATTCAACGCATTCCAGATCGCAAAc > 1:53127‑M2/48‑143 (MQ=255) gtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCCGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTcccc > 2:166901‑M2/39‑143 (MQ=255) ttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTcac > 2:403868‑M2/33‑143 (MQ=255) cagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACCATTCCGCCAGAAACt > 2:657375‑M2/17‑143 (MQ=255) cgctttctgcTGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCACGTATTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAACTGCGGCt < 2:287303‑M2/133‑1 (MQ=255) cgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGGCCTCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGAGCGCAAACCGCTGCGCCGTCTCCACTTCCGCCAGAACCTGGGgcg > 1:290416‑M2/11‑142 (MQ=255) ccttctgcCGTCCCATGCACTTCAGTGATGGTCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAACTGCGGCTAc < 1:217929‑M2/135‑1 (MQ=255) cCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCACACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAACTGCGGCTACCATCCCt > 1:646324‑M2/2‑143 (MQ=255) | ACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCGTCGCTACAATGGATTCGATTCCCCTCGGGCCAGAGCCAACAAGATGAGTAGCTCTTCATGGGTGAACGGCTCGCCTTCTGCCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAACTGCGGCTACCATCCCT > NC_000913/3815798‑3816081 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |