| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 687,860 | Δ1,185 bp | IS5‑mediated | insH‑3 | insH‑3 |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 687860 | 689044 | 1185 | 125 [0] | [0] 121 | insH‑3 | insH‑3 |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 687859 | 0 (0.000) | 115 (1.640) | 51/66 | 0.0 | 100% | noncoding (1187/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 689045 = | 0 (0.000) | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region | |||||
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
TTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/687825‑687859‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGA > NC_000913/689045‑689078 TTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGC < 1:7720780/35‑1TTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGC < 1:3956523/35‑1TTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGC > 1:2807865/1‑35TTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGC < 1:3434468/35‑1TTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGC > 1:5382113/1‑35 TATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCC < 1:7391161/35‑1 TATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCC > 1:4946379/1‑35 TATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCC < 1:6498024/35‑1 TATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCC < 1:2684516/35‑1 TATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCC < 1:4714064/35‑1 TATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCC > 1:6887600/1‑35 TATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCC > 1:4324398/1‑35 TATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCC < 1:3587975/35‑1 ATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCT > 1:4202482/1‑35 ATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCT < 1:4840682/35‑1 TTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTT < 1:5651787/35‑1 TTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGGGCCTT > 1:3877072/1‑35 TGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTA < 1:7367283/35‑1 TGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTA > 1:1305654/1‑35 GTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAG < 1:3956288/35‑1 TGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGG < 1:2035358/35‑1 GCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGT < 1:2401756/35‑1 GCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGT < 1:289200/35‑1 GCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGT < 1:1694775/35‑1 CAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTA > 1:6597890/1‑35 AGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAA > 1:5989327/1‑35 AGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAA < 1:6124386/35‑1 AGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAA < 1:2278043/35‑1 AGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAA < 1:6829418/35‑1 AGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAA < 1:7566763/35‑1 AGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAA < 1:7578476/35‑1 AGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAA > 1:1812243/1‑35 AGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAA < 1:7705304/35‑1 GTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAAC > 1:4791922/1‑35 TGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACA < 1:4794626/35‑1 TGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACA > 1:2405169/1‑35 TGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACA > 1:2059547/1‑35 GTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACAT < 1:535398/35‑1 GTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACAT < 1:2341186/35‑1 GTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACAT < 1:7211545/35‑1 GTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACAT < 1:7316383/35‑1 GTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACAT < 1:4355181/35‑1 TTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATT < 1:4262370/35‑1 TTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATT < 1:1875968/35‑1 TTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATT < 1:7028852/35‑1 TTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATT < 1:2079480/35‑1 TTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATT > 1:6188812/1‑35 TTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATT < 1:5362141/35‑1 TGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTT < 1:4310290/35‑1 TGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTT > 1:5697568/1‑35 GTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTA > 1:6744358/1‑35 GTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTA < 1:221817/35‑1 TGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAG > 1:2065634/1‑35 GCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGT < 1:766835/35‑1 GCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGT < 1:213345/35‑1 GCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGT < 1:6436945/35‑1 CCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTT < 1:5645160/35‑1 TGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTG > 1:1557028/1‑35 TGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTG < 1:91533/35‑1 TGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTG < 1:91534/35‑1 TGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTG < 1:2611035/35‑1 GTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGG < 1:23187/35‑1 TTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGC < 1:814630/35‑1 TTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGC < 1:6751302/35‑1 TAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCT < 1:7306834/35‑1 AGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTA > 1:906397/1‑35 AGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTA > 1:2404032/1‑35 AGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTA < 1:6798011/35‑1 AGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTA > 1:1822952/1‑35 AGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTA > 1:3811920/1‑35 AGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTA < 1:6721942/35‑1 GGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAA < 1:4627188/35‑1 GGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAA < 1:7254612/35‑1 GGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAA > 1:4150967/1‑35 GGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAA > 1:6325466/1‑35 GAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAAT > 1:464784/1‑35 AAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATG > 1:1264829/1‑35 AAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATG > 1:6297505/1‑35 AAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATG < 1:4987403/35‑1 AAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATG < 1:4062523/35‑1 AAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATG < 1:3882335/35‑1 AGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGT < 1:4567246/35‑1 AGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGT < 1:5632597/35‑1 AGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGT > 1:5586838/1‑35 GGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTA < 1:7105350/35‑1 GGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTA > 1:5301915/1‑35 GTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAA < 1:3092062/35‑1 GTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAA > 1:2486932/1‑35 GTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAA > 1:337512/1‑35 GTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAA > 1:647874/1‑35 TGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAA < 1:6224496/35‑1 TGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAA < 1:2523118/35‑1 TGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAA < 1:1473443/35‑1 TGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAA < 1:5443454/35‑1 TGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAA < 1:2859558/35‑1 CCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGA < 1:4259432/35‑1 CCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGA < 1:4153938/35‑1 CCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGA > 1:5922380/1‑35 CCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGA < 1:7713402/35‑1 CCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGA > 1:4920837/1‑35 TTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/687825‑687859‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGA > NC_000913/689045‑689078 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |