| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 3,651,293 | Δ2,422 bp | [yhiS]–yhiS | [yhiS], insH‑11, yhiS | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 3651293 | 3653714 | 2422 | 175 [0] | [0] 172 | [yhiS]–yhiS | [yhiS],insH‑11,yhiS |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3651292 | 0 (0.000) | 162 (2.380) | 52/64 | 0.0 | 100% | pseudogene (2/746 nt) | yhiS | putative uncharacterized protein YhiS |
| ? | NC_000913 | 3653715 = | 0 (0.000) | intergenic (+2/‑246) | yhiS/slp | putative uncharacterized protein YhiS/starvation lipoprotein | |||||
Only 100 of 172 total aligned reads displayed.
TTATCAAATCATTACCAGAATATAATACCATAATATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAA > NC_000913/3653681‑3653749 | tagcataaaacaaatgatgaataaggaattttata < 1:3001474‑M2/1‑1 (MQ=255) agcataaaacaaatgatgaataaggaattttatat > 1:6280048‑M2/34‑35 (MQ=255) gcataaaacaagtgatgaataaggaattttatAtt > 1:7599875‑M2/33‑35 (MQ=255) gcataaaacaaatgatgaataaggaattttatAtt < 1:4203728‑M2/3‑1 (MQ=255) gcataaaacaaatgatgaataaggaattttatAtt < 1:2708379‑M2/3‑1 (MQ=255) cataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTg > 1:2861320‑M2/32‑35 (MQ=255) ataaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGa < 1:6714605‑M2/5‑1 (MQ=255) taaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGat < 1:797976‑M2/6‑1 (MQ=255) taaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGat > 1:251403‑M2/30‑35 (MQ=255) taaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGat > 1:678493‑M2/30‑35 (MQ=255) taaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGat > 1:1477813‑M2/30‑35 (MQ=255) taaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGat > 1:3081665‑M2/30‑35 (MQ=255) aaaacaaatgatgaataaggaattttatATTGatt < 1:2054672‑M2/7‑1 (MQ=255) aaacaaatgatgaataaggaattttatATTGatta < 1:2457678‑M2/8‑1 (MQ=255) aaacaaatgatgaataaggaattttatATTGatta > 1:5197816‑M2/28‑35 (MQ=255) aaacaaatgatgaataaggaattttatATTGatta < 1:5318110‑M2/8‑1 (MQ=255) aaacaaatgatgaataaggaattttatATTGatta < 1:7334765‑M2/8‑1 (MQ=255) aaacaaatgatgaataaggaattttatATTGatta < 1:2832240‑M2/8‑1 (MQ=255) aaacaaatgatgaataaggaattttatATTGatta > 1:1314120‑M2/28‑35 (MQ=255) aaacaaatgatgaataaggaattttatATTGatta < 1:6502552‑M2/8‑1 (MQ=255) aaacaaatgatgaataaggaattttatATTGatta < 1:6517249‑M2/8‑1 (MQ=255) aaacaaatgatgaataaggaattttatATTGatta < 1:708162‑M2/8‑1 (MQ=255) aacaaatgatgaataaggaattttatATTGattat < 1:1714034‑M2/9‑1 (MQ=255) aacaaatgatgaataaggaattttatATTGattat < 1:4903475‑M2/9‑1 (MQ=255) aacaaatgatgaataaggaattttatATTGattat < 1:4764390‑M2/9‑1 (MQ=255) acaaatgatgaataaggaattttatATTGattatt < 1:3672500‑M2/10‑1 (MQ=255) acaaatgatgaataaggaattttatATTGattatt < 1:402614‑M2/10‑1 (MQ=255) caaatgatgaataaggaattttatATTGAttatta < 1:600821‑M2/11‑1 (MQ=255) caaatgatgaataaggaattttatATTGAttatta < 1:1707484‑M2/11‑1 (MQ=255) caaatgatgaataaggaattttatATTGAttatta > 1:727862‑M2/25‑35 (MQ=255) aaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAg < 1:1874466‑M2/12‑1 (MQ=255) aaatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAg > 1:3957926‑M2/24‑35 (MQ=255) aatgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGc > 1:5813987‑M2/23‑35 (MQ=255) tgatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCAc > 1:2004227‑M2/21‑35 (MQ=255) gatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACt < 1:56010‑M2/16‑1 (MQ=255) gatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACt < 1:6831933‑M2/16‑1 (MQ=255) gatgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACt > 1:1133448‑M2/20‑35 (MQ=255) atgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACtt < 1:1211339‑M2/17‑1 (MQ=255) atgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACtt < 1:5872831‑M2/17‑1 (MQ=255) tgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACttt > 1:2379835‑M2/18‑35 (MQ=255) tgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACttt > 1:5783540‑M2/18‑35 (MQ=255) tgaataaggaattttatATTGATTATTAGCACttt < 1:4277344‑M2/18‑1 (MQ=255) gaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTta < 1:2899997‑M2/19‑1 (MQ=255) gaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTta > 1:531761‑M2/17‑35 (MQ=255) gaataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTta < 1:339346‑M2/19‑1 (MQ=255) aataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTtat < 1:1056013‑M2/20‑1 (MQ=255) aataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTtat > 1:7198601‑M2/16‑35 (MQ=255) aataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTtat < 1:2000929‑M2/20‑1 (MQ=255) aataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTtat < 1:1808012‑M2/20‑1 (MQ=255) aataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTtat > 1:3606521‑M2/16‑35 (MQ=255) aataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTtat > 1:6104752‑M2/16‑35 (MQ=255) ataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTtata < 1:32891‑M2/21‑1 (MQ=255) ataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTtata < 1:2192594‑M2/21‑1 (MQ=255) ataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTtata > 1:3418392‑M2/15‑35 (MQ=255) ataaggaattttatATTGATTATTAGCACTTtata > 1:3083440‑M2/15‑35 (MQ=255) taaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATaa < 1:1925756‑M2/22‑1 (MQ=255) taaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATaa > 1:7251646‑M2/14‑35 (MQ=255) taaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATaa > 1:5242202‑M2/14‑35 (MQ=255) aaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAAt < 1:6447025‑M2/23‑1 (MQ=255) aaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAAt < 1:2011100‑M2/23‑1 (MQ=255) aaggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAAt < 1:5387790‑M2/23‑1 (MQ=255) aggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATc > 1:7447276‑M2/12‑35 (MQ=255) aggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATc < 1:6627396‑M2/24‑1 (MQ=255) aggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATc > 1:3770234‑M2/12‑35 (MQ=255) aggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATc < 1:7770563‑M2/24‑1 (MQ=255) ggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCa < 1:6974297‑M2/25‑1 (MQ=255) ggaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCa > 1:35400‑M2/11‑35 (MQ=255) gaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCAt < 1:2267312‑M2/26‑1 (MQ=255) gaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCAt > 1:5189528‑M2/10‑35 (MQ=255) gaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCAt < 1:7616048‑M2/26‑1 (MQ=255) gaattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCAt < 1:6355388‑M2/26‑1 (MQ=255) aattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCAtt < 1:7008863‑M2/27‑1 (MQ=255) aattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCAtt < 1:1184782‑M2/27‑1 (MQ=255) aattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCAtt < 1:770355‑M2/27‑1 (MQ=255) aattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCAtt < 1:986940‑M2/27‑1 (MQ=255) aattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCAtt < 1:5900594‑M2/27‑1 (MQ=255) aattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCAtt < 1:2126270‑M2/27‑1 (MQ=255) aattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCAtt < 1:3474994‑M2/27‑1 (MQ=255) aattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCAtt < 1:3661029‑M2/27‑1 (MQ=255) aattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCAtt < 1:3769021‑M2/27‑1 (MQ=255) aattttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCAtt < 1:241327‑M2/27‑1 (MQ=255) attttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTg < 1:6472829‑M2/28‑1 (MQ=255) attttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTg < 1:1893760‑M2/28‑1 (MQ=255) attttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTg < 1:1692491‑M2/28‑1 (MQ=255) attttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTg > 1:6969565‑M2/8‑35 (MQ=255) tttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGaa < 1:2946370‑M2/30‑1 (MQ=255) ttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAAt > 1:6247241‑M2/5‑35 (MQ=255) ttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAAt < 1:3441486‑M2/31‑1 (MQ=255) ttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAAt > 1:4621610‑M2/5‑35 (MQ=255) ttatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAAt < 1:1214745‑M2/31‑1 (MQ=255) tatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATa < 1:2404215‑M2/32‑1 (MQ=255) tatATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATa > 1:7794724‑M2/4‑35 (MQ=255) atATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATaa > 1:2676870‑M2/3‑35 (MQ=255) atATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATaa > 1:7094187‑M2/3‑35 (MQ=255) atATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATaa < 1:5071205‑M2/33‑1 (MQ=255) tATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATaaa > 1:4546179‑M2/2‑35 (MQ=255) tATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATaaa > 1:7794210‑M2/2‑35 (MQ=255) tATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATaaa > 1:5649649‑M2/2‑35 (MQ=255) tATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATaaa > 1:1637490‑M2/2‑35 (MQ=255) atTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATaaaa > 1:1575052/1‑35 (MQ=255) | TTATCAAATCATTACCAGAATATAATACCATAATATTGATTATTAGCACTTTATAATCATTGAATAAAA > NC_000913/3653681‑3653749 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |