Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NC_000913	3423686–3424234	3428528–3424238	5–4843	18 [12]	[13] 20	[rrfD]–[rrsD]	[rrfD],rrlD,alaU,ileU,[rrsD]

TCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATG  >  NC_000913/3423651‑3423695                                   |           tCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTa            >  1:7704344/1‑35 (MQ=255) tCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTa            <  1:1764366/35‑1 (MQ=255) tCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTa            <  1:1814197/35‑1 (MQ=255) tCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTa            >  1:4714751/1‑35 (MQ=255) tCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTa            >  1:4518847/1‑35 (MQ=255) tCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTa            >  1:103648/1‑35 (MQ=255)  cAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTAc           >  1:3119239/1‑35 (MQ=255)   aGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTAct          <  1:5918955/35‑1 (MQ=255)   aGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTAct          >  1:4037019/1‑35 (MQ=255)     cACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTActct        <  1:3798906/35‑1 (MQ=255)     cACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTActct        <  1:2354604/35‑1 (MQ=255)       cGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCg      <  1:4594962/35‑1 (MQ=255)        gCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGc     <  1:1726783/35‑1 (MQ=40)         cTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCa    <  1:3761645/35‑1 (MQ=40)         cTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCa    <  1:342265/35‑1 (MQ=40)          tAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCAt   <  1:7476019/35‑1 (MQ=37)           aaaTTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATg  <  1:2823444/35‑1 (MQ=33)           aaaTTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATg  <  1:7094974/35‑1 (MQ=33)                                   |           TCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATG  >  NC_000913/3423651‑3423695

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑