Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NC_000913	3423686–3424234	3428528–3424238	5–4843	18 [12]	[13] 20	[rrfD]–[rrsD]	[rrfD],rrlD,alaU,ileU,[rrsD]

CCCATCTGGGCACATCCGATGGCAAGAGGCCCGAGGGTCCCCC  >  NC_000913/3428521‑3428563         |                                   cccATCTGGGCACATCCGATGGCAAGAGGCCCGAg          <  1:531133/35‑1 (MQ=33)  ccATCTGGGCACATCCGATGGCAAGAGGCCCGAgg         >  1:4905714/1‑35 (MQ=37)  ccATCTGGGCACATCCGATGGCAAGAGGCCCGAgg         >  1:2879588/1‑35 (MQ=37)  ccATCTGGGCACATCCGATGGCAAGAGGCCCGAgg         >  1:48522/1‑35 (MQ=37)     tCTGGGCACATCCGATGGCAAGAGGCCCGAGGGTc      >  1:2989121/1‑35 (MQ=40)      cTGGGCACATCCGATGGCAAGAGGCCCGAGGGTcc     <  1:4695150/35‑1 (MQ=255)      cTGGGCACATCCGATGGCAAGAGGCCCGAGGGTcc     <  1:4028215/35‑1 (MQ=255)       tGGGCACATCCGATGGCAAGAGGCCCGAGGGTccc    >  1:4442846/1‑35 (MQ=40)       tGGGCACATCCGATGGCAAGAGGCCCGAGGGTccc    >  1:7400389/1‑35 (MQ=40)       tGGGCACATCCGATGGCAAGAGGCCCGAGGGTccc    <  1:2134142/35‑1 (MQ=255)       tGGGCACATCCGATGGCAAGAGGCCCGAGGGTccc    <  1:1588276/35‑1 (MQ=255)        gggCACATCCGATGGCAAGAGGCCCGAGGGTcccc   >  1:4566833/1‑35 (MQ=40)        gggCACATCCGATGGCAAGAGGCCCGAGGGTcccc   <  1:364555/35‑1 (MQ=40)         ggCACATCCGATGGCAAGAGGCCCGAGGGTccccc  >  1:3737537/1‑35 (MQ=40)         ggCACATCCGATGGCAAGAGGCCCGAGGGTccccc  >  1:1119728/1‑35 (MQ=40)         ggCACATCCGATGGCAAGAGGCCCGAGGGTccccc  <  1:297748/35‑1 (MQ=255)         ggCACATCCGATGGCAAGAGGCCCGAGGGTccccc  >  1:5276374/1‑35 (MQ=40)         ggCACATCCGATGGCAAGAGGCCCGAGGGTccccc  >  1:5592335/1‑35 (MQ=40)         ggCACATCCGATGGCAAGAGGCCCGAGGGTccccc  >  1:1358384/1‑35 (MQ=40)         ggCACATCCGAGGGCAAGAGGCCCGAGGGTccccc  >  1:5592417/1‑35 (MQ=255)         |                                   CCCATCTGGGCACATCCGATGGCAAGAGGCCCGAGGGTCCCCC  >  NC_000913/3428521‑3428563

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑