Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NC_000913	1400303	1482259	81957	17 [15]	[15] 18	[abgT]–[azoR]	[abgT],abgB,abgA,abgR,mcaS,smrA,dgcM,zntB,fnrS,ynaL,dbpA,ttcA,intR,xisR,rcbA,ralA,ralR,recT,recE,racC,ydaE,kilR,sieB,ydaF,ydaG,racR,ydaS,ydaT,ydaU,ydaV,ydaW,rzpR,rzoR,trkG,ynaK,ydaY,ynaA,lomR,insH‑5,lomR,stfR,tfaR,pinR,ynaE,ynaM,ttcC,uspF,ompN,micC,ydbK,ydbJ,hslJ,ldhA,ydbH,ynbE,ydbL,feaR,feaB,tynA,paaZ,paaA,paaB,paaC,paaD,paaE,paaF,paaG,paaH,paaI,paaJ,paaK,paaX,paaY,ynbG,ydbA,insD‑2,insC‑2,ydbA,insI‑2,ydbA,pdxI,ydbD,ynbA,ynbB,ynbC,ynbD,[azoR]

TTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCA  >  NC_000913/1482255‑1482294      |                                   ctATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTg       >  1:4813305/2‑35 (MQ=255) ctATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTg       <  1:4411857/34‑1 (MQ=255)  tATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGc      >  1:2161703/1‑35 (MQ=255)   aTGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCg     <  1:7862157/35‑1 (MQ=255)   aTGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCg     <  1:7862114/35‑1 (MQ=255)   aTGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCg     >  1:3114826/1‑35 (MQ=255)    tGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGt    <  1:2961676/35‑1 (MQ=255)    tGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGt    <  1:4769042/35‑1 (MQ=255)    tGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGt    <  1:5902786/35‑1 (MQ=255)    tGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGt    <  1:5914859/35‑1 (MQ=255)    tGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGt    <  1:6558688/35‑1 (MQ=255)    tGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGt    <  1:6914769/35‑1 (MQ=255)    tGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGt    <  1:1686015/35‑1 (MQ=255)    tGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGt    >  1:1129828/1‑35 (MQ=255)     gCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTc   >  1:7835513/1‑35 (MQ=255)      cAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCa  >  1:2478322/1‑35 (MQ=255)      cAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCa  <  1:6581750/35‑1 (MQ=255)      cAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCCTTTGCGTct  >  1:2194080/1‑34 (MQ=38)      |                                   TTATGCAGAAACAATGCTGTCGATGGCTGCTTTTGCGTCA  >  NC_000913/1482255‑1482294

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑