| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 687,860 | Δ1,185 bp | IS5‑mediated | insH‑3 | insH‑3 |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 687860 | 689044 | 1185 | 106 [0] | [0] 105 | insH‑3 | insH‑3 |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 687859 | 0 (0.000) | 100 (1.230) | 60/96 | 0.0 | 100% | noncoding (1187/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 689045 = | 0 (0.000) | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region | |||||
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
TTATCGTCTGCAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/687810‑687859‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATT > NC_000913/689045‑689093 TTATCGTCTGCAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGC > 1:871350/1‑50 TCGTCTGCAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTT < 1:3957885/50‑1 TCGTCTGCAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTT < 1:2823818/50‑1 TCGTCTGCAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCT < 1:2544239/49‑1 CGTCTGCAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCT > 1:2141789/1‑48 GTCTGCAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAG < 1:6161601/50‑1 GTCTGCAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAG > 1:4986580/1‑50 TCTGCAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGG > 1:3754953/1‑50 TCTGCAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGG < 1:3024416/50‑1 GCAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAA > 1:497291/1‑50 GCAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAA > 1:4138722/1‑50 GCAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAA > 1:2965499/1‑50 CAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAAC < 1:3875138/50‑1 CAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAA > 1:1389923/1‑49 CAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAA > 1:2511643/1‑49 CAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAA < 1:3700668/49‑1 CAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTA < 1:2764073/48‑1 CAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTA < 1:499410/48‑1 AACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACA < 1:6245998/50‑1 AACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACA < 1:5461884/50‑1 AACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACA > 1:3410210/1‑50 ACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACAT > 1:4244274/1‑50 TTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATT > 1:6152256/1‑49 TTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATT > 1:5425795/1‑49 TTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATT > 1:2951314/1‑48 TATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAG > 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TGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTG < 1:3286110/49‑1 TGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTG < 1:1685415/49‑1 CAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCT < 1:3121635/50‑1 CAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCT < 1:6357263/50‑1 CAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGC > 1:6004370/1‑49 CAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGC > 1:1485182/1‑49 AGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTA < 1:2772289/50‑1 AGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCT > 1:1700282/1‑49 GTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTA > 1:5204645/1‑49 TGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAA > 1:5271606/1‑50 TGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAA > 1:1015603/1‑50 TTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATG < 1:5238356/50‑1 TTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATG < 1:2586239/50‑1 TTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATG < 1:2594353/50‑1 TTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATG > 1:4886008/1‑50 TGTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATG > 1:1411699/1‑49 GTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGT < 1:47877/49‑1 GTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGT < 1:1100403/49‑1 GTGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGT < 1:445281/49‑1 TGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAA < 1:5203950/50‑1 TGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAA < 1:4844640/50‑1 TGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTA < 1:6239927/49‑1 TGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTA < 1:5735961/49‑1 TGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTA < 1:541317/49‑1 TGCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTA < 1:3482640/49‑1 GCCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTA > 1:2283527/1‑48 CCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAA < 1:623659/49‑1 CCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAA < 1:613649/49‑1 CCTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAA < 1:4506964/49‑1 CTGTTAGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGA < 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AGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTG > 1:1920661/1‑50 AGGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTG > 1:2701472/1‑50 GGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGC < 1:4100109/50‑1 GGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGC < 1:2230470/50‑1 GGGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTG < 1:3179796/49‑1 GGAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCT < 1:783707/50‑1 GAAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTG > 1:1282568/1‑50 AAGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGT < 1:1327475/50‑1 AGGTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTT > 1:1383338/1‑50 GTGCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTT < 1:3012574/50‑1 GCCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTAT > 1:3691501/1‑50 CCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATT < 1:807496/50‑1 CCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTAT < 1:3806931/49‑1 CCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTAT < 1:2684638/49‑1 CCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTAT < 1:1591358/49‑1 CCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTAT < 1:3014097/49‑1 TTATCGTCTGCAACTTTATTGTGCAGTGTTGTGCCTGTTAGGGAAGGTGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/687810‑687859‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cCTTAGGTAACATTTAGTTTGGCTAAATGTAAAGATATTGCTGTTTTATT > NC_000913/689045‑689093 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |