| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 603,467 | Δ5,885 bp | [ybdG]–insL‑2 | [ybdG], nfsB, ybdF, ybdJ, ybdK, sokE, hokE, insL‑2 | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 603467 | 609351 | 5885 | 101 [0] | [0] 101 | [ybdG]–insL‑2 | [ybdG],nfsB,ybdF,ybdJ,ybdK,sokE,hokE,insL‑2 |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 603466 | 0 (0.000) | 99 (1.240) | 62/94 | 0.0 | 100% | coding (1198/1248 nt) | ybdG | miniconductance mechanosensitive channel YbdG |
| ? | NC_000913 | 609352 = | 0 (0.000) | intergenic (+175/+107) | insL‑2/entD | IS186/IS421 transposase/phosphopantetheinyl transferase EntD | |||||
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
ACTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGACTGATGAAGTCGCAGACCAAACTCTTCGACAATCGCAAATATGTGATCG > NC_000913/603418‑603515 | aCTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAg > 1:1045950‑M1/1‑49 (MQ=255)aCTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAg > 1:2166868‑M1/1‑49 (MQ=255) cTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgt < 1:2808393‑M1/50‑3 (MQ=255) cTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAg < 1:2256332‑M1/49‑2 (MQ=255) tGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgt > 1:3992607‑M1/1‑47 (MQ=255) tGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgt > 1:2090120‑M1/1‑47 (MQ=255) gCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaa > 1:2728944‑M1/1‑46 (MQ=255) cTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaat < 1:3629142‑M1/50‑6 (MQ=255) cTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaat > 1:4616827‑M1/1‑45 (MQ=255) cTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaat > 1:6104441‑M1/1‑45 (MQ=255) cTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgta < 1:5106341‑M1/48‑4 (MQ=255) cTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgta < 1:361554‑M1/48‑4 (MQ=255) ttAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatc > 1:5261794‑M1/1‑44 (MQ=255) tAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatcc > 1:181592‑M1/1‑43 (MQ=255) aaaTGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccc > 1:6236921‑M1/1‑42 (MQ=255) aaaTGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccc > 1:4332543‑M1/1‑42 (MQ=255) aaaTGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatcc < 1:542995‑M1/49‑8 (MQ=255) aaaTGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatcc < 1:2660001‑M1/49‑8 (MQ=255) aaaTGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatc < 1:2912630‑M1/48‑7 (MQ=255) aaTGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatcccc < 1:1936811‑M1/50‑10 (MQ=255) aaTGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatcccc > 1:4384321‑M1/1‑41 (MQ=255) aaTGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatcccc > 1:492001‑M1/1‑41 (MQ=255) aaTGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatcccc < 1:4170504‑M1/50‑10 (MQ=255) aTGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccg > 1:762457‑M1/1‑40 (MQ=255) tGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgc < 1:2122928‑M1/50‑12 (MQ=255) gCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgca > 1:4343689‑M1/1‑38 (MQ=255) gCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgca > 1:5333856‑M1/1‑38 (MQ=255) gCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgca > 1:1653198‑M1/1‑38 (MQ=255) cACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgca > 1:312300‑M1/1‑37 (MQ=255) cACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgca > 1:4727635‑M1/1‑37 (MQ=255) cACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgca > 1:1004799‑M1/1‑37 (MQ=255) aCCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcata > 1:4361923‑M1/1‑36 (MQ=255) cccGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatat < 1:6334846‑M1/50‑16 (MQ=255) cccGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatat < 1:6088568‑M1/50‑16 (MQ=255) cccGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatat < 1:3009199‑M1/50‑16 (MQ=255) cccGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatat < 1:3013921‑M1/50‑16 (MQ=255) cccGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatat < 1:5920284‑M1/50‑16 (MQ=255) ccGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatc > 1:3585757‑M1/1‑34 (MQ=255) cGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatcc < 1:3087865‑M1/50‑18 (MQ=255) gCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccg > 1:2701020‑M1/1‑32 (MQ=255) ccAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccgg > 1:4306486‑M1/1‑31 (MQ=255) ccAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccgg < 1:5672343‑M1/50‑20 (MQ=255) ccAGAGAGCGAATATCATTGCCGGCTGGCGAgtaatccccgcatatccgg > 1:5124529‑M1/1‑31 (MQ=255) cAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggt < 1:5891428‑M1/50‑21 (MQ=255) aagagagcGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggt > 1:889310‑M1/2‑30 (MQ=255) agagagCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggtt > 1:5780804‑M1/1‑29 (MQ=255) agagagCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggtt < 1:693022‑M1/50‑22 (MQ=255) agagagCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggtt < 1:5187861‑M1/50‑22 (MQ=255) agagagCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggtt > 1:4095609‑M1/1‑29 (MQ=255) gagagCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcgtatccggttg < 1:4270979‑M1/50‑23 (MQ=255) gagCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtc < 1:6423612‑M1/50‑25 (MQ=255) gagCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtc < 1:4269135‑M1/50‑25 (MQ=255) gagCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgt > 1:2088764‑M1/1‑26 (MQ=255) agCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtca < 1:2414837‑M1/50‑26 (MQ=255) agCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtca < 1:6026962‑M1/50‑26 (MQ=255) agCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtca < 1:4559241‑M1/50‑26 (MQ=255) agCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgt > 1:3738799‑M1/1‑25 (MQ=255) gCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcag < 1:2226075‑M1/50‑27 (MQ=255) cGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcagg < 1:3257031‑M1/50‑28 (MQ=255) cGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcagg < 1:5904269‑M1/50‑28 (MQ=255) gAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggt > 1:3936273‑M1/1‑22 (MQ=255) aaTATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtc < 1:3274111‑M1/50‑30 (MQ=255) aaTATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtc < 1:3786963‑M1/50‑30 (MQ=255) atatCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtca < 1:809755‑M1/50‑31 (MQ=255) atatCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggt > 1:215023‑M1/1‑20 (MQ=255) atatCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggt > 1:2732559‑M1/1‑20 (MQ=255) atatCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggt > 1:2391673‑M1/1‑20 (MQ=255) tatCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcag < 1:6309070‑M1/50‑32 (MQ=255) tatCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcag > 1:2242988‑M1/1‑19 (MQ=255) atCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcag > 1:4210158‑M1/1‑18 (MQ=255) atCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcag > 1:3892696‑M1/1‑18 (MQ=255) atCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcag > 1:5153054‑M1/1‑18 (MQ=255) tCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcagga < 1:4789271‑M1/50‑34 (MQ=255) cATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggat > 1:3492676‑M1/1‑16 (MQ=255) aTTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatg < 1:766489‑M1/50‑36 (MQ=255) aTTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatg > 1:168262‑M1/1‑15 (MQ=255) aTTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggat < 1:2840226‑M1/49‑35 (MQ=255) aTTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggat < 1:1887062‑M1/49‑35 (MQ=255) ttGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatgg < 1:2304709‑M1/50‑37 (MQ=255) ttGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatgg > 1:1849849‑M1/1‑14 (MQ=255) ttGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatgg < 1:2091193‑M1/50‑37 (MQ=255) ttGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatgg < 1:4502676‑M1/50‑37 (MQ=255) gCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggt < 1:2435857‑M1/49‑38 (MQ=255) gCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggt < 1:3411931‑M1/49‑38 (MQ=255) ccGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaa < 1:6027648‑M1/50‑40 (MQ=255) ccGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggta < 1:1592416‑M1/49‑39 (MQ=255) ccGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggt > 1:3737086‑M1/1‑11 (MQ=255) cGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaag > 1:3007266‑M1/1‑10 (MQ=255) gTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaaggc < 1:859113‑M1/50‑43 (MQ=255) gTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaaggc < 1:1462653‑M1/50‑43 (MQ=255) ttGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaaggca > 1:529258‑M1/1‑7 (MQ=255) ttGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaaggca < 1:1270052‑M1/50‑44 (MQ=255) ttGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaaggca < 1:6103108‑M1/50‑44 (MQ=255) tGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaaggcac > 1:48528‑M1/1‑6 (MQ=255) tGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaaggcac > 1:2955908‑M1/1‑6 (MQ=255) ggCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaaggcacc > 1:3402629‑M1/1‑5 (MQ=255) ggCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaaggcacc > 1:5597915‑M1/1‑5 (MQ=255) cGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaaggcacctg < 1:4565485‑M1/50‑48 (MQ=255) gAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaaggcacctgc > 1:3080202‑M1/1‑2 (MQ=255) agtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaaggcacctgct > 1:3540247‑M1/1‑1 (MQ=255) | ACTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGACTGATGAAGTCGCAGACCAAACTCTTCGACAATCGCAAATATGTGATCG > NC_000913/603418‑603515 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |