| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 603,467 | Δ5,885 bp | [ybdG]–insL‑2 | [ybdG], nfsB, ybdF, ybdJ, ybdK, sokE, hokE, insL‑2 | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 603467 | 609351 | 5885 | 101 [0] | [0] 101 | [ybdG]–insL‑2 | [ybdG],nfsB,ybdF,ybdJ,ybdK,sokE,hokE,insL‑2 |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 603466 | 0 (0.000) | 99 (1.240) | 62/94 | 0.0 | 100% | coding (1198/1248 nt) | ybdG | miniconductance mechanosensitive channel YbdG |
| ? | NC_000913 | 609352 = | 0 (0.000) | intergenic (+175/+107) | insL‑2/entD | IS186/IS421 transposase/phosphopantetheinyl transferase EntD | |||||
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
GGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCT > NC_000913/609303‑609400 | actgcttaaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgag > 1:1045950‑M2/50‑50 (MQ=255)actgcttaaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgag > 1:2166868‑M2/50‑50 (MQ=255) ctgcttaaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgag < 1:2256332‑M2/1‑1 (MQ=255) ctgcttaaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGt < 1:2808393‑M2/2‑1 (MQ=255) tgcttaaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGt > 1:3992607‑M2/48‑49 (MQ=255) tgcttaaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGt > 1:2090120‑M2/48‑49 (MQ=255) gcttaaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTaa > 1:2728944‑M2/47‑50 (MQ=255) cttaaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTa < 1:5106341‑M2/3‑1 (MQ=255) cttaaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTa < 1:361554‑M2/3‑1 (MQ=255) cttaaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAAt > 1:4616827‑M2/46‑50 (MQ=255) cttaaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAAt > 1:6104441‑M2/46‑50 (MQ=255) cttaaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAAt < 1:3629142‑M2/5‑1 (MQ=255) ttaaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATc > 1:5261794‑M2/45‑50 (MQ=255) taaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATcc > 1:181592‑M2/44‑50 (MQ=255) aaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATccc > 1:4332543‑M2/43‑50 (MQ=255) aaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATccc > 1:6236921‑M2/43‑50 (MQ=255) aaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATcc < 1:2660001‑M2/7‑1 (MQ=255) aaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATcc < 1:542995‑M2/7‑1 (MQ=255) aaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATc < 1:2912630‑M2/6‑1 (MQ=255) aatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATcccc < 1:4170504‑M2/9‑1 (MQ=255) aatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATcccc > 1:492001‑M2/42‑50 (MQ=255) aatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATcccc > 1:4384321‑M2/42‑50 (MQ=255) aatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATcccc < 1:1936811‑M2/9‑1 (MQ=255) atgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCg > 1:762457‑M2/41‑50 (MQ=255) tgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGc < 1:2122928‑M2/11‑1 (MQ=255) gcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCa > 1:5333856‑M2/39‑50 (MQ=255) gcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCa > 1:1653198‑M2/39‑50 (MQ=255) gcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCa > 1:4343689‑M2/39‑50 (MQ=255) cacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCa > 1:1004799‑M2/38‑49 (MQ=255) cacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCa > 1:312300‑M2/38‑49 (MQ=255) cacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCa > 1:4727635‑M2/38‑49 (MQ=255) acccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCata > 1:4361923‑M2/37‑50 (MQ=255) cccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCatat < 1:6334846‑M2/15‑1 (MQ=255) cccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCatat < 1:3009199‑M2/15‑1 (MQ=255) cccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCatat < 1:3013921‑M2/15‑1 (MQ=255) cccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCatat < 1:6088568‑M2/15‑1 (MQ=255) cccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCatat < 1:5920284‑M2/15‑1 (MQ=255) ccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATc > 1:3585757‑M2/35‑50 (MQ=255) cgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATcc < 1:3087865‑M2/17‑1 (MQ=255) gccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCg > 1:2701020‑M2/33‑50 (MQ=255) ccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCgg > 1:4306486‑M2/32‑50 (MQ=255) ccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCgg < 1:5672343‑M2/19‑1 (MQ=255) ccagagagcgaatatcattgccggctggcgaGTAATCCCCGCATATCCgg > 1:5124529‑M2/32‑50 (MQ=255) cagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGt < 1:5891428‑M2/20‑1 (MQ=255) aagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGt > 1:889310‑M2/31‑50 (MQ=255) agagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGtt > 1:5780804‑M2/30‑50 (MQ=255) agagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGtt < 1:693022‑M2/21‑1 (MQ=255) agagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGtt < 1:5187861‑M2/21‑1 (MQ=255) agagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGtt > 1:4095609‑M2/30‑50 (MQ=255) gagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCGTATCCGGTTg < 1:4270979‑M2/22‑1 (MQ=255) gagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtc < 1:6423612‑M2/24‑1 (MQ=255) gagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtc < 1:4269135‑M2/24‑1 (MQ=255) gagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgt > 1:2088764‑M2/27‑49 (MQ=255) agcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtca < 1:2414837‑M2/25‑1 (MQ=255) agcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtca < 1:6026962‑M2/25‑1 (MQ=255) agcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtca < 1:4559241‑M2/25‑1 (MQ=255) agcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgt > 1:3738799‑M2/26‑48 (MQ=255) gcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcag < 1:2226075‑M2/26‑1 (MQ=255) cgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcagg < 1:3257031‑M2/27‑1 (MQ=255) cgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcagg < 1:5904269‑M2/27‑1 (MQ=255) gaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggt > 1:3936273‑M2/23‑50 (MQ=255) aatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggtc < 1:3274111‑M2/29‑1 (MQ=255) aatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggtc < 1:3786963‑M2/29‑1 (MQ=255) atatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggtca < 1:809755‑M2/30‑1 (MQ=255) atatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggt > 1:215023‑M2/21‑48 (MQ=255) atatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggt > 1:2732559‑M2/21‑48 (MQ=255) atatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggt > 1:2391673‑M2/21‑48 (MQ=255) tatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggtcag < 1:6309070‑M2/31‑1 (MQ=255) tatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggtcag > 1:2242988‑M2/20‑50 (MQ=255) atcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggtcag > 1:4210158‑M2/19‑49 (MQ=255) atcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggtcag > 1:3892696‑M2/19‑49 (MQ=255) atcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggtcag > 1:5153054‑M2/19‑49 (MQ=255) tcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGa < 1:4789271‑M2/33‑1 (MQ=255) cattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGAt > 1:3492676‑M2/17‑50 (MQ=255) attgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGAt < 1:2840226‑M2/34‑1 (MQ=255) attgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGAt < 1:1887062‑M2/34‑1 (MQ=255) attgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATg < 1:766489‑M2/35‑1 (MQ=255) attgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATg > 1:168262‑M2/16‑50 (MQ=255) ttgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATgg < 1:2304709‑M2/36‑1 (MQ=255) ttgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATgg > 1:1849849‑M2/15‑50 (MQ=255) ttgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATgg < 1:2091193‑M2/36‑1 (MQ=255) ttgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATgg < 1:4502676‑M2/36‑1 (MQ=255) gccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGt < 1:2435857‑M2/37‑1 (MQ=255) gccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGt < 1:3411931‑M2/37‑1 (MQ=255) ccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGt > 1:3737086‑M2/12‑48 (MQ=255) ccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTaa < 1:6027648‑M2/39‑1 (MQ=255) ccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTa < 1:1592416‑M2/38‑1 (MQ=255) cggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAg > 1:3007266‑M2/11‑50 (MQ=255) gttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGc < 1:859113‑M2/42‑1 (MQ=255) gttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGc < 1:1462653‑M2/42‑1 (MQ=255) ttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCa > 1:529258‑M2/8‑50 (MQ=255) ttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCa < 1:1270052‑M2/43‑1 (MQ=255) ttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCa < 1:6103108‑M2/43‑1 (MQ=255) tggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCAc > 1:48528‑M2/7‑50 (MQ=255) tggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCAc > 1:2955908‑M2/7‑50 (MQ=255) ggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCAcc > 1:3402629‑M2/6‑50 (MQ=255) ggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCAcc > 1:5597915‑M2/6‑50 (MQ=255) cgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTg < 1:4565485‑M2/47‑1 (MQ=255) gaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGc > 1:3080202‑M2/3‑50 (MQ=255) aGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCt > 1:3540247‑M2/2‑50 (MQ=255) | GGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCT > NC_000913/609303‑609400 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |