| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 389,898 | Δ9,908 bp | yaiT–[yaiZ] | yaiT, insF‑2, insE‑2, yaiT, iprA, ampH, sbmA, yaiW, yaiY, [yaiZ] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 389898 | 399805 | 9908 | 93 [0] | [0] 94 | yaiT–[yaiZ] | yaiT,insF‑2,insE‑2,yaiT,iprA,ampH,sbmA,yaiW,yaiY,[yaiZ] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 389897 | 0 (0.000) | 90 (1.080) | 53/98 | 0.0 | 100% | intergenic (‑170/‑354) | hemB/yaiT | porphobilinogen synthase/putative autotransporter YaiT |
| ? | NC_000913 | 399806 = | 0 (0.000) | intergenic (+1/+23) | yaiZ/ddlA | DUF2754 domain‑containing protein YaiZ/D‑alanine‑‑D‑alanine ligase A | |||||
GGTTGATTATTCGTCGTCGCGATGAAGAAACTGAAAACGCCCAATAAGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGTTATC > NC_000913/399759‑399855 | atagaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGaa > 1:3137653‑M2/48‑50 (MQ=255)atagaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGaa > 1:2273099‑M2/48‑50 (MQ=255)atagaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGa < 1:3168101‑M2/2‑1 (MQ=255) tagaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGaa > 1:1126595‑M2/47‑49 (MQ=255) tagaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGaa > 1:5600749‑M2/47‑49 (MQ=255) tagaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGaa > 1:6243279‑M2/47‑49 (MQ=255) tagaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAat < 1:6105532‑M2/4‑1 (MQ=255) tagaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAat < 1:734209‑M2/4‑1 (MQ=255) tagaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAat < 1:3526956‑M2/4‑1 (MQ=255) tagaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaaacttGAat < 1:1982171‑M2/4‑1 (MQ=255) agaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAata > 1:5674019‑M2/46‑50 (MQ=255) agaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAata > 1:1050458‑M2/46‑50 (MQ=255) gaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAatat > 1:2053626‑M2/45‑50 (MQ=255) gaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAatat < 1:613999‑M2/6‑1 (MQ=255) gaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAatat < 1:1821417‑M2/6‑1 (MQ=255) gaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAata < 1:5081910‑M2/5‑1 (MQ=255) gaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAata < 1:3970752‑M2/5‑1 (MQ=255) gaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAata < 1:1099741‑M2/5‑1 (MQ=255) aaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAAtatt < 1:3045809‑M2/7‑1 (MQ=255) aaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAAtatt < 1:3643556‑M2/7‑1 (MQ=255) aaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAAtatt < 1:953599‑M2/7‑1 (MQ=255) acagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAAtattat > 1:4361860‑M2/42‑50 (MQ=255) acagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAAtattat < 1:293657‑M2/9‑1 (MQ=255) cagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATc > 1:5418101‑M2/41‑50 (MQ=255) cagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATc < 1:1211283‑M2/10‑1 (MQ=255) aataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGc > 1:4655209‑M2/37‑50 (MQ=255) aataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGc > 1:2297437‑M2/37‑50 (MQ=255) aataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGc < 1:548629‑M2/14‑1 (MQ=255) aataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGc < 1:4170342‑M2/14‑1 (MQ=255) ataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCg > 1:2857219‑M2/36‑50 (MQ=255) taattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGt > 1:4640167‑M2/35‑50 (MQ=255) aattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGt > 1:1073183‑M2/34‑49 (MQ=255) aattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGt > 1:2944435‑M2/34‑49 (MQ=255) aattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGt > 1:5778342‑M2/34‑49 (MQ=255) ttttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTaa < 1:3368658‑M2/19‑1 (MQ=255) ttttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTa > 1:4923415‑M2/32‑49 (MQ=255) ttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTaaaa > 1:2834712‑M2/30‑50 (MQ=255) ttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTaaaa > 1:1440187‑M2/30‑50 (MQ=255) tatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTaaaa < 1:3131749‑M2/21‑1 (MQ=255) tatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTaaaa < 1:2216152‑M2/21‑1 (MQ=255) atattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAata > 1:1834134‑M2/28‑50 (MQ=255) atattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAata > 1:5259861‑M2/28‑50 (MQ=255) atattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAat < 1:3545618‑M2/22‑1 (MQ=255) tattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAatat < 1:2584635‑M2/24‑1 (MQ=255) tattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAatat > 1:2506216‑M2/27‑50 (MQ=255) tattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAatat < 1:3198387‑M2/24‑1 (MQ=255) attcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAatat > 1:3431322‑M2/26‑49 (MQ=255) ttcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATAtt < 1:4147953‑M2/25‑1 (MQ=255) tcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTa > 1:2049918‑M2/24‑49 (MQ=255) cactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACa > 1:4127922‑M2/23‑50 (MQ=255) actgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACAt > 1:849843‑M2/22‑50 (MQ=255) actgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACAt > 1:542396‑M2/22‑50 (MQ=255) actgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACAt < 1:2357076‑M2/29‑1 (MQ=255) ctgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACAtt < 1:818791‑M2/30‑1 (MQ=255) gaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATtgt > 1:1099036‑M2/19‑50 (MQ=255) aaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATtgtg > 1:746790‑M2/18‑50 (MQ=255) aaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATtgtg > 1:972793‑M2/18‑50 (MQ=255) aaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATtgtg > 1:4226848‑M2/18‑50 (MQ=255) aaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATtgtg < 1:2010810‑M2/33‑1 (MQ=255) aaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATtg < 1:1912653‑M2/31‑1 (MQ=255) aaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTgg < 1:562375‑M2/34‑1 (MQ=255) aatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGt < 1:316835‑M2/35‑1 (MQ=255) atatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGtt < 1:199150‑M2/36‑1 (MQ=255) atatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGtt > 1:5614465‑M2/15‑50 (MQ=255) atatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGtt > 1:3274940‑M2/15‑50 (MQ=255) atatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGtt > 1:3088097‑M2/15‑50 (MQ=255) atatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGtt > 1:5243524‑M2/15‑50 (MQ=255) atatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGtt < 1:4452849‑M2/36‑1 (MQ=255) tttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGtttt > 1:5880115‑M2/12‑49 (MQ=255) tttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGtttt < 1:6315360‑M2/38‑1 (MQ=255) tttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGtttt < 1:4115242‑M2/38‑1 (MQ=255) tttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCa < 1:3928289‑M2/40‑1 (MQ=255) taatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAAt < 1:2828039‑M2/42‑1 (MQ=255) taatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATg > 1:3726457‑M2/8‑50 (MQ=255) taatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATg > 1:5587060‑M2/8‑50 (MQ=255) taatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATg > 1:1997090‑M2/8‑50 (MQ=255) aatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATg < 1:2602285‑M2/43‑1 (MQ=255) aatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGc > 1:393050‑M2/7‑50 (MQ=255) atcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGc < 1:1396608‑M2/44‑1 (MQ=255) atcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCg > 1:2189498‑M2/6‑50 (MQ=255) atcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCg > 1:4760812‑M2/6‑50 (MQ=255) atcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCg < 1:3990901‑M2/45‑1 (MQ=255) cttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGt > 1:3673518‑M2/4‑49 (MQ=255) cttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGt > 1:3844149‑M2/4‑49 (MQ=255) cttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGt > 1:5839971‑M2/4‑49 (MQ=255) cttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGt > 1:486632‑M2/4‑49 (MQ=255) tGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGTTAt > 1:5202773‑M2/2‑50 (MQ=255) tGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGTTAt > 1:4953660‑M2/2‑50 (MQ=255) tGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGTTAt > 1:901378‑M2/2‑50 (MQ=255) tGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGTTAt > 1:1466529‑M2/2‑50 (MQ=255) gAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGtt < 1:4226928/47‑1 (MQ=255) gAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGTTAt < 1:4350955/49‑1 (MQ=255) gAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGTTAt < 1:1855115/49‑1 (MQ=255) gAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGTTATc > 1:4945303/1‑50 (MQ=255) | GGTTGATTATTCGTCGTCGCGATGAAGAAACTGAAAACGCCCAATAAGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGTTATC > NC_000913/399759‑399855 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |