| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 2,165,151 | Δ12,060 bp | yegP–gatY | 17 genes yegP, yegQ, cyaR, ogrK, yegZ, yegR, yegS, gatR, insE‑5, insF‑5, gatR, gatD, gatC, gatB, gatA, gatZ, gatY |
|
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 2165151 | 2177210 | 12060 | 99 [0] | [0] 101 | yegP–gatY | yegP,yegQ,cyaR,ogrK,yegZ,yegR,yegS,gatR,insE‑5,insF‑5,gatR,gatD,gatC,gatB,gatA,gatZ,gatY |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2165150 | 0 (0.000) | 97 (1.170) | 55/98 | 0.0 | 100% | intergenic (+152/‑39) | baeR/yegP | DNA‑binding transcriptional activator BaeR/DUF1508 domain‑containing protein YegP |
| ? | NC_000913 | 2177211 = | 0 (0.000) | intergenic (‑7/+301) | gatY/fbaB | tagatose‑1,6‑bisphosphate aldolase 2 subunit GatY/fructose‑bisphosphate aldolase class I | |||||
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
GCTGTGCGTTGTTCAGCATCTGCTTTGTCGATACCACGTACATTTTCATATCCTGTCGTTTGTTTTCGATTTCAAAATATAATGAAATTATTTGTTTTT > NC_000913/2177162‑2177260 | aggcatcagaaaatcgctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaa > 1:2493319‑M2/50‑50 (MQ=255) gcatcagaaaatcgctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATc < 1:2219109‑M2/3‑1 (MQ=255) atcagaaaatcgctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCt < 1:3853505‑M2/5‑1 (MQ=255) atcagaaaatcgctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCt > 1:2020245‑M2/46‑50 (MQ=255) atcagaaaatcgctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCt < 1:1967752‑M2/5‑1 (MQ=255) atcagaaaatcgctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCt < 1:1235594‑M2/5‑1 (MQ=255) tcagaaaatcgctcatactttaatcggtaagcagcacctttagaATCCTg < 1:5153319‑M2/6‑1 (MQ=255) tcagaaaatcgctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTg > 1:6208316‑M2/45‑50 (MQ=255) tcagaaaatcgctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTg < 1:4288506‑M2/6‑1 (MQ=255) tcagaaaatcgctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTg < 1:3524754‑M2/6‑1 (MQ=255) agaaaatcgctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTc < 1:46410‑M2/8‑1 (MQ=255) agaaaatcgctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTc < 1:5679088‑M2/8‑1 (MQ=255) gaaaatcgctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCg > 1:1455691‑M2/42‑50 (MQ=255) aaaatcgctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCgt > 1:4710631‑M2/41‑50 (MQ=255) aaaatcgctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCgt > 1:4998801‑M2/41‑50 (MQ=255) aaatcgctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCgtt > 1:3730170‑M2/40‑50 (MQ=255) aaatcgctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCgtt < 1:417168‑M2/11‑1 (MQ=255) tcgctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCgtttgt < 1:5253341‑M2/14‑1 (MQ=255) tcgctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCgtttgt < 1:1816894‑M2/14‑1 (MQ=255) tcgctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCgtctgt > 1:5469924‑M2/37‑50 (MQ=255) cgctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCgtttgtt > 1:1065933‑M2/36‑50 (MQ=255) gctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCgtttgttt < 1:390973‑M2/16‑1 (MQ=255) gctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCgtttgttt < 1:4173103‑M2/16‑1 (MQ=255) gctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCgtttgttt < 1:4459191‑M2/16‑1 (MQ=255) gctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCgtttgtt < 1:666150‑M2/15‑1 (MQ=255) gctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCgtttgtt < 1:1039504‑M2/15‑1 (MQ=255) gctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCgtttgtt < 1:4143765‑M2/15‑1 (MQ=255) ctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCGTTTGtttt < 1:3100202‑M2/17‑1 (MQ=255) ctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCGTTTGtttt < 1:658817‑M2/17‑1 (MQ=255) ctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCGTTTGtttt > 1:2906590‑M2/34‑50 (MQ=255) ctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCGTTTGtttt < 1:6025174‑M2/17‑1 (MQ=255) ctcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCGTTTGtttt < 1:364226‑M2/17‑1 (MQ=255) tcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCGTTTGTTTTc > 1:4813096‑M2/33‑50 (MQ=255) tcatactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCGTTTGTTTTc > 1:5518802‑M2/33‑50 (MQ=255) atactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCGTTTGTTTTc < 1:4126019‑M2/18‑1 (MQ=255) atactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCGTTTGTTTTc < 1:332‑M2/18‑1 (MQ=255) atactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCGTTTGTTTTc < 1:4267576‑M2/18‑1 (MQ=255) atactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCGTTTGTTTTCGa > 1:4930002‑M2/31‑50 (MQ=255) atactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCGTTTGTTTTCGa < 1:509098‑M2/20‑1 (MQ=255) atactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCGTTTGTTTTCGa > 1:785855‑M2/31‑50 (MQ=255) tactttaatcggtaaacagcgcctttagaATCCTGTCGTTTGTTTTCGAt < 1:105877‑M2/21‑1 (MQ=255) tactttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCGTTTGTTTTCGAt < 1:4591646‑M2/21‑1 (MQ=255) actttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCGTTTGTTTTCGAtt > 1:5597033‑M2/29‑50 (MQ=255) actttaatcggtaaacagcaactttagaATCCTGTCGTTTGTTTTCGAtt > 1:4408557‑M2/29‑50 (MQ=255) ctttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCGTTTGTTTTCGAttt < 1:873627‑M2/23‑1 (MQ=255) ctttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCGTTTGTTTTCGAttt < 1:3984603‑M2/23‑1 (MQ=255) ctttaatcggtaaacagcacctttagaATCCTGTCGTTTGTTTTCGAttt < 1:4255060‑M2/23‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |