| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 2,165,151 | Δ12,060 bp | yegP–gatY | 17 genes yegP, yegQ, cyaR, ogrK, yegZ, yegR, yegS, gatR, insE‑5, insF‑5, gatR, gatD, gatC, gatB, gatA, gatZ, gatY |
|
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 2165151 | 2177210 | 12060 | 99 [0] | [0] 101 | yegP–gatY | yegP,yegQ,cyaR,ogrK,yegZ,yegR,yegS,gatR,insE‑5,insF‑5,gatR,gatD,gatC,gatB,gatA,gatZ,gatY |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2165150 | 0 (0.000) | 97 (1.170) | 55/98 | 0.0 | 100% | intergenic (+152/‑39) | baeR/yegP | DNA‑binding transcriptional activator BaeR/DUF1508 domain‑containing protein YegP |
| ? | NC_000913 | 2177211 = | 0 (0.000) | intergenic (‑7/+301) | gatY/fbaB | tagatose‑1,6‑bisphosphate aldolase 2 subunit GatY/fructose‑bisphosphate aldolase class I | |||||
CAGGCATCAGAAAATCGCTCATACTTTAATCGGTAAACAGCACCTTTAGATGCTGTTTTCGATACACAATTTCAATCAAGGAGTCATTATGGCTGGTTG > NC_000913/2165101‑2165199 | caggcaTCAGAAAATCGCTCATACTTTAATCGGTAAACAGCACCTTTAGa < 1:3244649/50‑1 (MQ=255)caggcaTCAGAAAATCGCTCATACTTTAATCGGTAAACAGCACCTTTAGa < 1:3023195/50‑1 (MQ=255) aGGCATCAGAAAATCGCTCATACTTTAATCGGTAAACAGCACCTTTAGAa > 1:2493319‑M1/1‑49 (MQ=255) gCATCAGAAAATCGCTCATACTTTAATCGGTAAACAGCACCTTTAGAatc < 1:2219109‑M1/50‑4 (MQ=255) aTCAGAAAATCGCTCATACTTTAATCGGTAAACAGCACCTTTAGAatcct < 1:1235594‑M1/50‑6 (MQ=255) aTCAGAAAATCGCTCATACTTTAATCGGTAAACAGCACCTTTAGAatcct < 1:1967752‑M1/50‑6 (MQ=255) aTCAGAAAATCGCTCATACTTTAATCGGTAAACAGCACCTTTAGAatcct > 1:2020245‑M1/1‑45 (MQ=255) aTCAGAAAATCGCTCATACTTTAATCGGTAAACAGCACCTTTAGAatcct < 1:3853505‑M1/50‑6 (MQ=255) tCAGAAAATCGCTCATACTTTAATCGGTAAGCAGCACCTTTAGAatcctg < 1:5153319‑M1/50‑7 (MQ=255) tCAGAAAATCGCTCATACTTTAATCGGTAAACAGCACCTTTAGAatcctg < 1:4288506‑M1/50‑7 (MQ=255) tCAGAAAATCGCTCATACTTTAATCGGTAAACAGCACCTTTAGAatcctg > 1:6208316‑M1/1‑44 (MQ=255) tCAGAAAATCGCTCATACTTTAATCGGTAAACAGCACCTTTAGAatcctg < 1:3524754‑M1/50‑7 (MQ=255) aGAAAATCGCTCATACTTTAATCGGTAAACAGCACCTTTAGAatcctgtc < 1:5679088‑M1/50‑9 (MQ=255) aGAAAATCGCTCATACTTTAATCGGTAAACAGCACCTTTAGAatcctgtc < 1:46410‑M1/50‑9 (MQ=255) gAAAATCGCTCATACTTTAATCGGTAAACAGCACCTTTAGAatcctgtcg > 1:1455691‑M1/1‑41 (MQ=255) aaaaTCGCTCATACTTTAATCGGTAAACAGCACCTTTAGAatcctgtcgt > 1:4710631‑M1/1‑40 (MQ=255) aaaaTCGCTCATACTTTAATCGGTAAACAGCACCTTTAGAatcctgtcgt > 1:4998801‑M1/1‑40 (MQ=255) aaaTCGCTCATACTTTAATCGGTAAACAGCACCTTTAGAatcctgtcgtt < 1:417168‑M1/50‑12 (MQ=255) aaaTCGCTCATACTTTAATCGGTAAACAGCACCTTTAGAatcctgtcgtt > 1:3730170‑M1/1‑39 (MQ=255) tCGCTCATACTTTAATCGGTAAACAGCACCTTTAGAatcctgtcgtttgt < 1:5253341‑M1/50‑15 (MQ=255) tCGCTCATACTTTAATCGGTAAACAGCACCTTTAGAatcctgtcgtttgt < 1:1816894‑M1/50‑15 (MQ=255) tCGCTCATACTTTAATCGGTAAACAGCACCTTTAGAatcctgtcgtctgt > 1:5469924‑M1/1‑36 (MQ=255) cGCTCATACTTTAATCGGTAAACAGCACCTTTAGAatcctgtcgtttgtt > 1:1065933‑M1/1‑35 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |