| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 1,388,889 | Δ9,734 bp | ycjG–[uspE] | ycjG, mpaA, ymjC, ymjD, ycjY, pgrR, mppA, ynaI, insH‑4, ynaJ, [uspE] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 1388889 | 1398622 | 9734 | 78 [0] | [0] 79 | ycjG–[uspE] | ycjG,mpaA,ymjC,ymjD,ycjY,pgrR,mppA,ynaI,insH‑4,ynaJ,[uspE] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1388888 | 0 (0.000) | 77 (1.080) | 50/96 | 0.0 | 100% | intergenic (‑77/‑42) | tpx/ycjG | lipid hydroperoxide peroxidase/L‑Ala‑D/L‑Glu epimerase |
| ? | NC_000913 | 1398623 = | 0 (0.000) | intergenic (‑1/+151) | uspE/fnr | universal stress protein with a role cellular motility/DNA‑binding transcriptional dual regulator FNR | |||||
ACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1388840‑1388888‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGAT > NC_000913/1398623‑1398670 ACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTA > 1:4901761/1‑50ACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTA < 1:2072550/50‑1ACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATT < 1:1152287/49‑1 CGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTA > 1:5061380/1‑49 GTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACA < 1:3177401/50‑1 GTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTA > 1:4291195/1‑48 GTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTA > 1:3449510/1‑48 GTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTA > 1:1854136/1‑48 TCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAG > 1:4953601/1‑50 CACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGG > 1:665833/1‑50 ACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGG > 1:2886628/1‑50 ACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGG > 1:4014074/1‑50 ACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGG > 1:1621805/1‑50 ACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGG < 1:5330805/49‑1 ACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTC > 1:1258265/1‑50 ACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTC > 1:3613899/1‑50 CCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCT > 1:1143902/1‑50 CCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCT > 1:2186368/1‑50 CCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCT > 1:4592734/1‑50 CTAGTTTATGCTAACTGTGAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTC < 1:264938/50‑1 CTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTC > 1:1367984/1‑50 GTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTT < 1:799340/50‑1 TTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTA < 1:2824085/50‑1 TATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTAC < 1:4851374/49‑1 ATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAA > 1:1449383/1‑50 TGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAA > 1:5260905/1‑49 TGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAA < 1:1016147/49‑1 TGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAA > 1:1755958/1‑49 TGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAA > 1:1646551/1‑49 GCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAAC > 1:528126/1‑49 GCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAAC > 1:1202550/1‑49 CTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAA > 1:1358188/1‑50 CTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAA > 1:2707894/1‑50 AACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACT > 1:2829206/1‑50 ACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTG > 1:4055124/1‑50 ACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTG > 1:4330731/1‑50 ACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACT < 1:3889909/49‑1 ACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAAC < 1:3728412/48‑1 CTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGT < 1:3098973/50‑1 CTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGT < 1:1459157/50‑1 CTGTCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGT > 1:4773344/1‑50 TCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAA < 1:4316420/50‑1 TCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCA < 1:2329701/49‑1 TCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTC < 1:1083884/48‑1 TCAATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTC < 1:674173/48‑1 AATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACG > 1:3606350/1‑50 AATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACG > 1:2251014/1‑50 AATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAAC < 1:3754112/49‑1 AATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAAC < 1:3061523/49‑1 ATAACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGC < 1:4252954/50‑1 AACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAG > 1:4374012/1‑50 AACACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAG > 1:2738495/1‑50 ACAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTT > 1:1338707/1‑50 CAGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTG > 1:76424/1‑50 AGCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTG > 1:5110033/1‑49 GCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTA < 1:2205943/50‑1 GCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTA < 1:5427516/50‑1 GCAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTA < 1:3041106/50‑1 CAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAA > 1:4055833/1‑50 CAAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAA < 1:2303492/50‑1 AAACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAAT < 1:1726187/50‑1 AACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATT < 1:4429885/50‑1 AACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATT < 1:5410169/50‑1 ACGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTA < 1:3479316/50‑1 CGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTA > 1:3746848/1‑49 CGCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTA > 1:973154/1‑49 GCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAA < 1:3182957/50‑1 GCTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAA < 1:2683224/50‑1 CTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAA < 1:4267710/50‑1 CTATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAA < 1:1485623/50‑1 TATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAA > 1:3836759/1‑47 TATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAA > 1:5280658/1‑47 ATTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAA > 1:2726343/1‑46 TTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGAT < 1:5027159/50‑1 TTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGAT < 1:2564183/50‑1 TTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGAT < 1:695370/50‑1 TTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGAT < 1:1970766/50‑1 TTACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGA < 1:3508459/49‑1 ACGTCACACCTAGTTTATGCTAACTGTCAATAACACAGCAAACGCTATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1388840‑1388888‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGAT > NC_000913/1398623‑1398670 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |