| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 1,388,889 | Δ9,734 bp | ycjG–[uspE] | ycjG, mpaA, ymjC, ymjD, ycjY, pgrR, mppA, ynaI, insH‑4, ynaJ, [uspE] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 1388889 | 1398622 | 9734 | 78 [0] | [0] 79 | ycjG–[uspE] | ycjG,mpaA,ymjC,ymjD,ycjY,pgrR,mppA,ynaI,insH‑4,ynaJ,[uspE] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1388888 | 0 (0.000) | 77 (1.080) | 50/96 | 0.0 | 100% | intergenic (‑77/‑42) | tpx/ycjG | lipid hydroperoxide peroxidase/L‑Ala‑D/L‑Glu epimerase |
| ? | NC_000913 | 1398623 = | 0 (0.000) | intergenic (‑1/+151) | uspE/fnr | universal stress protein with a role cellular motility/DNA‑binding transcriptional dual regulator FNR | |||||
CGTCCTGGTTAGGATCGATAACAACGAGCATGTTCTGATACATAGCCATACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGATT > NC_000913/1398574‑1398671 | acgtcacacctagtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctatta < 1:2072550‑M2/1‑1 (MQ=255)acgtcacacctagtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctatta > 1:4901761‑M2/50‑50 (MQ=255) cgtcacacctagtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctatta > 1:5061380‑M2/49‑49 (MQ=255) gtcacacctagtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctatta > 1:3449510‑M2/48‑48 (MQ=255) gtcacacctagtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctatta > 1:4291195‑M2/48‑48 (MQ=255) gtcacacctagtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctatta > 1:1854136‑M2/48‑48 (MQ=255) gtcacacctagtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACa < 1:3177401‑M2/3‑1 (MQ=255) tcacacctagtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAg > 1:4953601‑M2/47‑50 (MQ=255) cacacctagtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAgg > 1:665833‑M2/46‑50 (MQ=255) acacctagtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAggg > 1:4014074‑M2/45‑50 (MQ=255) acacctagtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAggg > 1:2886628‑M2/45‑50 (MQ=255) acacctagtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAggg > 1:1621805‑M2/45‑50 (MQ=255) acacctagtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAgg < 1:5330805‑M2/5‑1 (MQ=255) acctagtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGtc > 1:1258265‑M2/43‑50 (MQ=255) acctagtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGtc > 1:3613899‑M2/43‑50 (MQ=255) cctagtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGtct > 1:4592734‑M2/42‑50 (MQ=255) cctagtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGtct > 1:1143902‑M2/42‑50 (MQ=255) cctagtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGtct > 1:2186368‑M2/42‑50 (MQ=255) ctagtttatgctaactgtgaataacacagcaaacgctattACAGGGtctc < 1:264938‑M2/10‑1 (MQ=255) ctagtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGtctc > 1:1367984‑M2/41‑50 (MQ=255) gtttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCtt < 1:799340‑M2/13‑1 (MQ=255) tttatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTa < 1:2824085‑M2/14‑1 (MQ=255) tatgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTac < 1:4851374‑M2/15‑1 (MQ=255) atgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTacaa > 1:1449383‑M2/34‑50 (MQ=255) tgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTacaa > 1:5260905‑M2/33‑49 (MQ=255) tgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTacaa < 1:1016147‑M2/17‑1 (MQ=255) tgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTacaa > 1:1755958‑M2/33‑49 (MQ=255) tgctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTacaa > 1:1646551‑M2/33‑49 (MQ=255) gctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTacaac > 1:528126‑M2/32‑49 (MQ=255) gctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTacaac > 1:1202550‑M2/32‑49 (MQ=255) ctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTAcaacaa > 1:2707894‑M2/31‑50 (MQ=255) ctaactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTAcaacaa > 1:1358188‑M2/31‑50 (MQ=255) aactgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACt > 1:2829206‑M2/29‑50 (MQ=255) actgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACaacaac < 1:3728412‑M2/21‑1 (MQ=255) actgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACt < 1:3889909‑M2/22‑1 (MQ=255) actgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTg > 1:4330731‑M2/28‑50 (MQ=255) actgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTg > 1:4055124‑M2/28‑50 (MQ=255) ctgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGt < 1:3098973‑M2/24‑1 (MQ=255) ctgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGt < 1:1459157‑M2/24‑1 (MQ=255) ctgtcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGt > 1:4773344‑M2/27‑50 (MQ=255) tcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTc < 1:1083884‑M2/25‑1 (MQ=255) tcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTc < 1:674173‑M2/25‑1 (MQ=255) tcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCaa < 1:4316420‑M2/27‑1 (MQ=255) tcaataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCa < 1:2329701‑M2/26‑1 (MQ=255) aataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAAc < 1:3061523‑M2/28‑1 (MQ=255) aataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAAc < 1:3754112‑M2/28‑1 (MQ=255) aataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACg > 1:2251014‑M2/22‑50 (MQ=255) aataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACg > 1:3606350‑M2/22‑50 (MQ=255) ataacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGc < 1:4252954‑M2/30‑1 (MQ=255) aacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAg > 1:2738495‑M2/19‑50 (MQ=255) aacacagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAg > 1:4374012‑M2/19‑50 (MQ=255) acagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGttt > 1:1338707‑M2/16‑50 (MQ=255) cagcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTg > 1:76424‑M2/15‑50 (MQ=255) agcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTg > 1:5110033‑M2/14‑49 (MQ=255) gcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTa < 1:3041106‑M2/38‑1 (MQ=255) gcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTa < 1:5427516‑M2/38‑1 (MQ=255) gcaaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTa < 1:2205943‑M2/38‑1 (MQ=255) caaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTaa > 1:4055833‑M2/12‑50 (MQ=255) caaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTaa < 1:2303492‑M2/39‑1 (MQ=255) aaacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAAt < 1:1726187‑M2/40‑1 (MQ=255) aacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAAtt < 1:5410169‑M2/41‑1 (MQ=255) aacgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAAtt < 1:4429885‑M2/41‑1 (MQ=255) acgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTa < 1:3479316‑M2/42‑1 (MQ=255) cgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTa > 1:3746848‑M2/8‑49 (MQ=255) cgctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTa > 1:973154‑M2/8‑49 (MQ=255) gctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTaaa < 1:3182957‑M2/44‑1 (MQ=255) gctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTaaa < 1:2683224‑M2/44‑1 (MQ=255) ctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTaaaa < 1:4267710‑M2/45‑1 (MQ=255) ctattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTaaaa < 1:1485623‑M2/45‑1 (MQ=255) tattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTaa > 1:3836759‑M2/5‑47 (MQ=255) tattACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTaa > 1:5280658‑M2/5‑47 (MQ=255) attACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTaa > 1:2726343‑M2/4‑46 (MQ=255) ttACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGa < 1:3508459‑M2/47‑1 (MQ=255) ttACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGAt < 1:5027159‑M2/48‑1 (MQ=255) ttACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGAt < 1:2564183‑M2/48‑1 (MQ=255) ttACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGAt < 1:695370‑M2/48‑1 (MQ=255) ttACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGAt < 1:1970766‑M2/48‑1 (MQ=255) aCAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGAtt < 1:2023848/49‑1 (MQ=255) aCAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGAtt < 1:76561/49‑1 (MQ=255) | CGTCCTGGTTAGGATCGATAACAACGAGCATGTTCTGATACATAGCCATACAGGGTCTCCTTACAACAACTGTCAACGCAGTTTGTAATTAAAAGATT > NC_000913/1398574‑1398671 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |