Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
MC JC | NC_000913 | 1,299,499 | Δ1,199 bp | insH21 | insH21 |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 1299499 | 1300697 | 1199 | 123 [0] | [0] 123 | insH21 | insH21 |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 1299498 | 0 (0.000) | 108 (1.620) | 65/90 | 0.0 | 100% | intergenic (+253/‑33) | ychE/insH21 | putative inner membrane protein/IS5 transposase and trans‑activator |
? | NC_000913 | 1300698 = | 0 (0.000) | intergenic (+151/‑484) | insH21/oppA | IS5 transposase and trans‑activator/oligopeptide ABC transporter periplasmic binding protein |
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
ATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAG > NC_000913/1299449‑1299547 | atTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAA < 1:2496883‑M1/50‑1 (MQ=255) ttGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAa > 1:3979485‑M1/1‑49 (MQ=255) ttGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAa > 1:4021512‑M1/1‑49 (MQ=255) tGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAa > 1:5249239‑M1/1‑48 (MQ=255) tGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAa > 1:3357022‑M1/1‑48 (MQ=255) gAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAat < 1:828271‑M1/49‑3 (MQ=255) gAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAat < 1:3554455‑M1/49‑3 (MQ=255) aaaTGATATTATTAATTTCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAata < 1:2802713‑M1/49‑4 (MQ=255) aaaTGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataa < 1:4278828‑M1/50‑5 (MQ=255) aaaTGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataa > 1:5413874‑M1/1‑46 (MQ=255) aaaTGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataa < 1:339453‑M1/50‑5 (MQ=255) aaaTGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataa > 1:1189922‑M1/1‑46 (MQ=255) aaaTGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataa < 1:1179995‑M1/50‑5 (MQ=255) aaaTGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAata < 1:3946606‑M1/49‑4 (MQ=255) aaaTGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAata < 1:384344‑M1/49‑4 (MQ=255) aaTGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataat < 1:5506880‑M1/50‑6 (MQ=255) aaTGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataat < 1:442685‑M1/50‑6 (MQ=255) aTGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataata < 1:1009705‑M1/50‑7 (MQ=255) aTGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataata < 1:4856584‑M1/50‑7 (MQ=255) aTGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataat > 1:1298004‑M1/1‑44 (MQ=255) tGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataa > 1:482992‑M1/1‑43 (MQ=255) tGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataa > 1:4576348‑M1/1‑43 (MQ=255) tGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataa < 1:3762733‑M1/50‑8 (MQ=255) gATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataat > 1:95345‑M1/1‑42 (MQ=255) atatTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatc < 1:137576‑M1/50‑10 (MQ=255) atatTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatc < 1:2030390‑M1/50‑10 (MQ=255) atatTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataat > 1:2509917‑M1/1‑41 (MQ=255) atatTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataat < 1:2265563‑M1/49‑9 (MQ=255) atatTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataat < 1:2746251‑M1/49‑9 (MQ=255) attattAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaa > 1:4067277‑M1/1‑39 (MQ=255) ttattaATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaat > 1:849497‑M1/1‑38 (MQ=255) tattaATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaatt > 1:1708353‑M1/1‑37 (MQ=255) tattaATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaatt > 1:2641619‑M1/1‑37 (MQ=255) attaATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaatt < 1:5084525‑M1/49‑14 (MQ=255) ttaATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgt > 1:582401‑M1/1‑35 (MQ=255) ttaATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattg < 1:29003‑M1/49‑15 (MQ=255) aaTTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgtt > 1:1691332‑M1/1‑33 (MQ=255) aaTTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgtt > 1:513144‑M1/1‑33 (MQ=255) aaTTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgtt > 1:2600448‑M1/1‑33 (MQ=255) aTTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaa < 1:2132734‑M1/50‑19 (MQ=255) aTTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgtta < 1:1627213‑M1/49‑18 (MQ=255) aTTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgtta > 1:5218178‑M1/1‑32 (MQ=255) aTTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgtta > 1:259358‑M1/1‑32 (MQ=255) ttCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaa > 1:2903514‑M1/1‑31 (MQ=255) ttCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaa < 1:1514296‑M1/50‑20 (MQ=255) ttCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaa > 1:1076243‑M1/1‑31 (MQ=255) tCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaat > 1:481443‑M1/1‑30 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaat < 1:1672990‑M1/49‑21 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaat > 1:2238645‑M1/1‑29 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaat < 1:3687309‑M1/49‑21 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaat < 1:3789475‑M1/49‑21 (MQ=255) cACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaatta < 1:4775600‑M1/50‑23 (MQ=255) cACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaatta < 1:4720525‑M1/50‑23 (MQ=255) cACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaatt < 1:3308955‑M1/49‑22 (MQ=255) aCTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAatactaatcaattgttaaattat < 1:2009898‑M1/50‑24 (MQ=255) aCTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattat > 1:4274585‑M1/1‑27 (MQ=255) aCTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattat > 1:1083241‑M1/1‑27 (MQ=255) gCCTTTGGTAGAGGAGAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgt > 1:456101‑M1/1‑24 (MQ=255) gCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgt > 1:3664475‑M1/1‑24 (MQ=255) gCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgt > 1:5145346‑M1/1‑24 (MQ=255) gCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgt > 1:4708446‑M1/1‑24 (MQ=255) ccTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtg < 1:4522734‑M1/50‑28 (MQ=255) ccTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgt < 1:298645‑M1/49‑27 (MQ=255) ccTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgt < 1:4946709‑M1/49‑27 (MQ=255) ccTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattg < 1:2152757‑M1/48‑26 (MQ=255) cTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtg > 1:209190‑M1/1‑22 (MQ=255) cTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtg > 1:5367945‑M1/1‑22 (MQ=255) tttGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgca > 1:1836655‑M1/1‑21 (MQ=255) tGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatt > 1:101619‑M1/1‑19 (MQ=255) tGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatt > 1:5280919‑M1/1‑19 (MQ=255) ggTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatt < 1:1861546‑M1/49‑32 (MQ=255) gTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttc < 1:3009803‑M1/50‑34 (MQ=255) gTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcattt < 1:4733839‑M1/49‑33 (MQ=255) gTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcattt < 1:5000504‑M1/49‑33 (MQ=255) agagGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcac > 1:5535455‑M1/1‑15 (MQ=255) gagGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcact < 1:5186679‑M1/50‑37 (MQ=255) gagGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcac > 1:1600671‑M1/1‑14 (MQ=255) gagGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcac > 1:2402513‑M1/1‑14 (MQ=255) agGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcacta < 1:1057265‑M1/50‑38 (MQ=255) agGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcacta > 1:507203‑M1/1‑13 (MQ=255) ggAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactac > 1:319707‑M1/1‑12 (MQ=255) gAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactact > 1:4006761‑M1/1‑11 (MQ=255) gAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactact < 1:324802‑M1/50‑40 (MQ=255) aaaGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactg > 1:4394816‑M1/1‑10 (MQ=255) aaGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactg > 1:5369077‑M1/1‑9 (MQ=255) gTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaa > 1:4612706‑M1/1‑7 (MQ=255) tGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaac > 1:3612001‑M1/1‑6 (MQ=255) tGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaac < 1:781604‑M1/50‑45 (MQ=255) gCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaact > 1:5295357‑M1/1‑5 (MQ=255) cTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaact < 1:3184781‑M1/49‑46 (MQ=255) cTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaact < 1:307504‑M1/49‑46 (MQ=255) cTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaact < 1:3633089‑M1/49‑46 (MQ=255) tAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactg > 1:247058‑M1/1‑3 (MQ=255) tAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactg > 1:3286049‑M1/1‑3 (MQ=255) aaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgt > 1:3260041‑M1/1‑2 (MQ=255) aaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgt > 1:5574557‑M1/1‑2 (MQ=255) aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaa > 1:5290008‑M1/1‑1 (MQ=255) aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgta < 1:3768600‑M1/49‑49 (MQ=255) aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgt < 1:2537983‑M1/48‑48 (MQ=255) aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgt < 1:2371805‑M1/48‑48 (MQ=255) | ATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAG > NC_000913/1299449‑1299547 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |