| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 389,898 | Δ9,908 bp | yaiT–[yaiZ] | yaiT, insF‑2, insE‑2, yaiT, iprA, ampH, sbmA, yaiW, yaiY, [yaiZ] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 389898 | 399805 | 9908 | 111 [0] | [0] 113 | yaiT–[yaiZ] | yaiT,insF‑2,insE‑2,yaiT,iprA,ampH,sbmA,yaiW,yaiY,[yaiZ] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 389897 | 0 (0.000) | 108 (1.490) | 64/98 | 0.0 | 100% | intergenic (‑170/‑354) | hemB/yaiT | porphobilinogen synthase/putative autotransporter YaiT |
| ? | NC_000913 | 399806 = | 0 (0.000) | intergenic (+1/+23) | yaiZ/ddlA | DUF2754 domain‑containing protein YaiZ/D‑alanine‑‑D‑alanine ligase A | |||||
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
TAATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATTTTTTGGAGTTTGGTTGCGCTGCTA > NC_000913/389849‑389945 | tAATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCtt > 1:1585432/1‑49 (MQ=255)tAATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCtt < 1:5414882/49‑1 (MQ=255) aaTAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTg < 1:4998153‑M1/49‑2 (MQ=255) aaTAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTg > 1:3118814‑M1/1‑48 (MQ=255) aTAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaa > 1:942104‑M1/1‑47 (MQ=255) aTAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaa > 1:1260878‑M1/1‑47 (MQ=255) tAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaat < 1:1479506‑M1/50‑5 (MQ=255) tAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaat < 1:5353897‑M1/50‑5 (MQ=255) tAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaa > 1:3546049‑M1/1‑46 (MQ=255) aGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaata > 1:3449351‑M1/1‑45 (MQ=255) aGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaata > 1:2654470‑M1/1‑45 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |