Missing coverage evidence...
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*	*	÷	NC_000913	3423698–3424234	3426808–3424653	420–3111	25 [16]	[16] 20	[rrfD]–rrlD	[rrfD],rrlD

ATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACA  >  NC_000913/3423648‑3423708                                                  |            atatCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg             >  1:1169540/1‑50 (MQ=255) atatCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg             >  1:1573346/1‑50 (MQ=255) atatCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg             >  1:5089779/1‑50 (MQ=255) atatCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg             >  1:3656051/1‑50 (MQ=255) atatCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg             >  1:2421124/1‑50 (MQ=255)  tatCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg             >  1:4851957/1‑49 (MQ=255)  tatCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg             >  1:3168106/1‑49 (MQ=255)   atCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg             >  1:130870/1‑48 (MQ=255)    tCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATggg             >  1:4669700/1‑47 (MQ=255)    tCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGgag          <  1:904525/50‑1 (MQ=255)    tCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGga           <  1:525307/49‑1 (MQ=255)     cAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGgaga         >  1:5394045/1‑50 (MQ=255)     cAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGgaga         >  1:2685511/1‑50 (MQ=255)      aGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGgaga         <  1:925016/49‑1 (MQ=255)      aGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAc        <  1:3064294/50‑1 (MQ=255)        cACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAccc      >  1:1823952/1‑50 (MQ=255)        cACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAccc      <  1:517039/50‑1 (MQ=255)        cACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAccc      >  1:4604098/1‑50 (MQ=255)        cACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAccc      <  1:2872341/50‑1 (MQ=255)          cGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCca    >  1:5145744/1‑50 (MQ=40)          cGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCca    >  1:408311/1‑50 (MQ=40)          cGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCca    <  1:1871110/50‑1 (MQ=40)           gCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCcac   <  1:2515011/50‑1 (MQ=38)            cTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCcaca  >  1:1660634/1‑50 (MQ=38)            cTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCcaca  <  1:5567229/50‑1 (MQ=38)                                                  |            ATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACA  >  NC_000913/3423648‑3423708

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑