| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 2,320,144 | Δ16,489 bp | [atoS]–[yfaA] | [atoS], atoC, atoD, atoA, atoE, atoB, yfaP, yfaQ, yfaS, yfaT, [yfaA] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 2320144 | 2336632 | 16489 | 83 [0] | [0] 82 | [atoS]–[yfaA] | [atoS],atoC,atoD,atoA,atoE,atoB,yfaP,yfaQ,yfaS,yfaT,[yfaA] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2320143 | 0 (0.000) | 77 (1.080) | 55/96 | 0.0 | 100% | coding (101/1827 nt) | atoS | sensory histidine kinase AtoS |
| ? | NC_000913 | 2336633 = | 0 (0.000) | coding (12/1689 nt) | yfaA | DUF2138 domain‑containing protein YfaA | |||||
TTGCGCCAAAACCTACAAGACCATAGAACCGCCAGCCTTTCGCCTTTTTTTCACCACTCATTGCCACATTCCTTGTGTATAGCCAGCCATTTTTTACG > NC_000913/2336584‑2336681 | tgatggcaatcctgatggtcattgtcccaacgcttactattggttatatt > 1:4739966‑M2/50‑50 (MQ=255) gatggcaatcctgatggtcattgtcccaacgcttactattggttatattt > 1:3564535‑M2/49‑50 (MQ=255) atggcaatcctgatggtcattgtcccaacgcttactattggttatattt < 1:5144300‑M2/2‑1 (MQ=255) atggcaatcctgatggtcattgtcccaacgcttactattggttatatt < 1:1026172‑M2/1‑1 (MQ=255) atggcaatcctgatggtcattgtcccaacgcttactattggttatatt < 1:4350570‑M2/1‑1 (MQ=255) atggcaatcctgatggtcattgtcccaacgcttactattggttatatTTc < 1:4901831‑M2/3‑1 (MQ=255) atggcaatcctgatggtcattgtcccaacgcttactattggttatatTTc < 1:4613491‑M2/3‑1 (MQ=255) atggcaatcctgatggtcattgtcccaacgcttactattggttatatTTc < 1:1315427‑M2/3‑1 (MQ=255) tggcaatcctgatggtcattgtcccaacgcttactattggttatatTTca < 1:3343248‑M2/4‑1 (MQ=255) gcaatcctgatggtcattgtcccaacgcttactattggttatatTTcacc < 1:661913‑M2/6‑1 (MQ=255) gcaatcctgatggtcattgtcccaacgcttactattggttatatTTcacc < 1:2523284‑M2/6‑1 (MQ=255) gcaatcctgatggtcattgtcccaacgcttactattggttatatTTcac > 1:1008007‑M2/45‑49 (MQ=255) gcaatcctgatggtcattgtcccaacgcttactattggttatatTTcac > 1:1809036‑M2/45‑49 (MQ=255) caatcctgatggtcattgtcccaacgcttactattggttatatTTcacca < 1:23095‑M2/7‑1 (MQ=255) caatcctgatggtcattgtcccaacgcttactattggttatatTTcacca < 1:5430373‑M2/7‑1 (MQ=255) aatcctgatggtcattgtcccaacgcttactattggttatatTTcaccac < 1:4094398‑M2/8‑1 (MQ=255) aatcctgatggtcattgtcccaacgcttactattggttatatTTcaccac > 1:2814073‑M2/43‑50 (MQ=255) aatcctgatggtcattgtcccaacgcttactattggttatatTTcaccac > 1:2876715‑M2/43‑50 (MQ=255) aatcctgatggtcattgtcccaacgcttactattggttatatTTcaccac > 1:3963650‑M2/43‑50 (MQ=255) tcctgatggtcattgtcccaacgcttactattggttatatTTCACCACTc < 1:4999149‑M2/10‑1 (MQ=255) ctgatggtcattgtcccaacgcttactattggttatatTTCACCACTCa < 1:4941932‑M2/11‑1 (MQ=255) ctgatggtcattgtcccaacgcttactattggttatatTTCACCACTCAt < 1:4645241‑M2/12‑1 (MQ=255) ctgatggtcattgtcccaacgcttactattggttatatTTCACCACTCAt < 1:131387‑M2/12‑1 (MQ=255) ctgatggtcattgtcccaacgcttactattggttatatTTCACCACTCAt < 1:263375‑M2/12‑1 (MQ=255) ctgatggtcattgtcccaacgcttactattggttatatTTCACCACTCAt > 1:2648219‑M2/39‑50 (MQ=255) tgatggtcattgtcccaacgcttactattggttatatTTCACCACTCAtt > 1:2147931‑M2/38‑50 (MQ=255) gatggtcattgtcccaacgcttactattggttatatTTCACCACTCATTg > 1:4450902‑M2/37‑50 (MQ=255) atggtcattgtcccaacgcttactattggttatatTTCACCACTCAtt < 1:1838912‑M2/13‑1 (MQ=255) atggtcattgtcccaacgcttactattggttatatTTCACCACTCATTg < 1:4433391‑M2/14‑1 (MQ=255) atggtcattgtcccaacgcttactattggttatatTTCACCACTCATTg < 1:5059924‑M2/14‑1 (MQ=255) atggtcattgtcccaacgcttactattggttatatTTCACCACTCATTGc < 1:539724‑M2/15‑1 (MQ=255) atggtcattgtcccaacgcttactattggttatatTTCACCACTCATTGc < 1:1151904‑M2/15‑1 (MQ=255) tggtcattgtcccaacgcttactattggttatatTTCACCACTCATTGc > 1:4358874‑M2/35‑49 (MQ=255) gtcattgtcccaacgcttactattggttatatTTCACCACTCATTGCcac < 1:1653475‑M2/18‑1 (MQ=255) gtcattgtcccaacgcttactattggttatatTTCACCACTCATTGCca > 1:5276959‑M2/33‑49 (MQ=255) gtcattgtcccaacgcttactattggttatatTTCACCACTCATTGCca > 1:2153992‑M2/33‑49 (MQ=255) gtcattgtcccaacgcttactattggttatacTTCACCACTCATTGCcac < 1:2081331‑M2/18‑1 (MQ=255) attgtcccaacgcttactattggttatatTTCACCACTCATTGCCACAtt > 1:4611002‑M2/30‑50 (MQ=255) attgtcccaacgcttactattggttatatTTCACCACTCATTGCCACAtt < 1:835068‑M2/21‑1 (MQ=255) tgtcccaacgcttactattggttatatTTCACCACTCATTGCCACATTcc > 1:1175211‑M2/28‑50 (MQ=255) gtcccaacgcttactattggttatatTTCACCACTCATTGCCACATTcc < 1:1276828‑M2/23‑1 (MQ=255) tcccaacgcttactattggttatatTTCACCACTCATTGCCACATTCCtt < 1:5355751‑M2/25‑1 (MQ=255) tcccaacgcttactattggttatatTTCACCACTCATTGCCACATTCCt < 1:4907209‑M2/24‑1 (MQ=255) cccaacgcttactattggttatatTTCACCACTCATTGCCACATTCCTtg > 1:4158742‑M2/25‑50 (MQ=255) ccaacgcttactattggttatatTTCACCACTCATTGCCACATTCCTtg < 1:2524776‑M2/26‑1 (MQ=255) ccaacgcttactattggttatatTTCACCACTCATTGCCACATTCCTtg < 1:1480205‑M2/26‑1 (MQ=255) caacgcttactattggttatatTTCACCACTCATTGCCACATTCCTtgtg > 1:4427136‑M2/23‑50 (MQ=255) aacgcttactattggttatatTTCACCACTCATTGCCACATTCCTtgtg > 1:184858‑M2/22‑49 (MQ=255) acgcttactattggttatatTTCACCACTCATTGCCACATTCCTTGTGta < 1:5549244‑M2/30‑1 (MQ=255) cgcttactattggttatatTTCACCACTCATTGCCACATTCCTTGTGtat < 1:3063018‑M2/31‑1 (MQ=255) gcttactattggttatatTTCACCACTCATTGCCACATTCCTTGTGtata < 1:4054061‑M2/32‑1 (MQ=255) gcttactattggttatatTTCACCACTCATTGCCACATTCCTTGTGtata < 1:2265085‑M2/32‑1 (MQ=255) gcttactattggttatatTTCACCACTCATTGCCACATTCCTTGTGta > 1:5483807‑M2/19‑48 (MQ=255) gcttactattggttatatTTCACCACTCATTGCCACATTCCTTGTGta > 1:3819578‑M2/19‑48 (MQ=255) cttactattggttatatTTCACCACTCATTGCCACATTCCTTGTGTATag < 1:266392‑M2/33‑1 (MQ=255) cttactattggttatatTTCACCACTCATTGCCACATTCCTTGTGTATag > 1:2734197‑M2/18‑50 (MQ=255) ttactattggttatatTTCACCACTCATTGCCACATTCCTTGTGTATagc > 1:3504177‑M2/17‑50 (MQ=255) ttactattggttatatTTCACCACTCATTGCCACATTCCTTGTGTATagc > 1:4681240‑M2/17‑50 (MQ=255) tactattggttatatTTCACCACTCATTGCCACATTCCTTGTGTATagc > 1:2521562‑M2/16‑49 (MQ=255) actattggttatatTTCACCACTCATTGCCACATTCCTTGTGTATagc < 1:1735174‑M2/34‑1 (MQ=255) actattggttatatTTCACCACTCATTGCCACATTCCTTGTGTATagc > 1:4039944‑M2/15‑48 (MQ=255) actattggttatatTTCACCACTCATTGCCACATTCCTTGTGTATagc > 1:164827‑M2/15‑48 (MQ=255) ctattggttatatTTCACCACTCATTGCCACATTCCTTGTGTATagcca < 1:2691224‑M2/36‑1 (MQ=255) tattggttatatTTCACCACTCATTGCCACATTCCTTGTGTATagccagc > 1:1574541‑M2/13‑50 (MQ=255) attggttatatTTCACCACTCATTGCCACATTCCTTGTGTATagccagc > 1:5056530‑M2/12‑49 (MQ=255) ttggttatatTTCACCACTCATTGCCACATTCCTTGTGTATAgccagcca > 1:1614655‑M2/11‑50 (MQ=255) tggttatatTTCACCACTCATTGCCACATTCCTTGTGTATAGCCAGCCAt > 1:5091024‑M2/10‑50 (MQ=255) ggttatatTTCACCACTCATTGCCACATTCCTTGTGTATAGCCAGCCAt < 1:143872‑M2/41‑1 (MQ=255) gttatatTTCACCACTCATTGCCACATTCCTTGTGTATAGCCAGCCAtt < 1:4474829‑M2/42‑1 (MQ=255) ttatatTTCACCACTCATTGCCACATTCCTTGTGTATAGCCAGCCAtttt > 1:5278920‑M2/7‑50 (MQ=255) ttatatTTCACCACTCATTGCCACATTCCTTGTGTATAGCCAGCCAtttt < 1:2398848‑M2/44‑1 (MQ=255) ttatatTTCACCACTCATTGCCACATTCCTTGTGTATAGCCAGCCAtttt > 1:2135995‑M2/7‑50 (MQ=255) atatTTCACCACTCATTGCCACATTCCTTGTGTATAGCCAGCCAttttt < 1:3096632‑M2/45‑1 (MQ=255) atatTTCACCACTCATTGCCACATTCCTTGTGTATAGCCAGCCAttttt < 1:4050531‑M2/45‑1 (MQ=255) tatTTCACCACTCATTGCCACATTCCTTGTGTATAGCCAGCCATTTTTTa < 1:3067389‑M2/47‑1 (MQ=255) tatTTCACCACTCATTGCCACATTCCTTGTGTATAGCCAGCCATTTTTTa > 1:3237825‑M2/4‑50 (MQ=255) tatTTCACCACTCATTGCCACATTCCTTGTGTATAGCCAGCCATTTTTTa > 1:1546963‑M2/4‑50 (MQ=255) tTTCACCACTCATTGCCACATTCCTTGTGTATAGCCAGCCATTTTTTACg > 1:5021820‑M2/2‑50 (MQ=255) tTTCACCACTCATTGCCACATTCCTTGTGTATAGCCAGCCATTTTTTACg < 1:2138899‑M2/49‑1 (MQ=255) tTTCACCACTCATTGCCACATTCCTTGTGTATAGCCAGCCATTTTTTACg > 1:2736343‑M2/2‑50 (MQ=255) tTTCACCACTCATTGCCACATTCCTTGTGTATAGCCAGCCATTTTTTACg > 1:3523282‑M2/2‑50 (MQ=255) tTTCACCACTCATTGCCACATTCCTTGTGTATAGCCAGCCATTTTTTACg > 1:4127735‑M2/2‑50 (MQ=255) | TTGCGCCAAAACCTACAAGACCATAGAACCGCCAGCCTTTCGCCTTTTTTTCACCACTCATTGCCACATTCCTTGTGTATAGCCAGCCATTTTTTACG > NC_000913/2336584‑2336681 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |