| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 380111 | 0 (0.000) | 50 (0.720) +CGAGAT |
29/86 | 0.4 | 70.0% | coding (732/774 nt) | yaiO | outer membrane protein YaiO |
| ? | NC_000913 | 4070444 = | 49 (0.620) | intergenic (‑43/+71) | yihR/yihS | putative aldose 1‑epimerase YihR/sulfoquinovose isomerase | |||||
ACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTGATGTCAAACCCAAAAACTGCACCGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGAAAA > NC_000913/4070395‑4070491 | aCGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTGATGTCAAACCCAAAAACTGCACCg < 1:3780758/50‑1 (MQ=255) cagaatttccaggtcagacgggctgcaagttgcagaccgttacgagatg > 1:3770927‑M2/49‑49 (MQ=255) cGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTGATGTCAAACCCAAAAACTGCACCg > 1:1063059/1‑49 (MQ=255) gACATACAGCCTCCCGTGAGGCTGATGTCAAACCCAAAAACTGCACCGGa > 1:5830649/1‑50 (MQ=255) gACATACAGCCTCCCGTGAGGCTGATGTCAAACCCAAAAACTGCACCGGa > 1:2321622/1‑50 (MQ=255) agaatttccaggtcagacgggctgcaagttgcagaccgttacgagatGGa > 1:1027402‑M2/48‑50 (MQ=255) agaatttccaggtcagacgggctgcaagttgcagaccgttacgagatGGa > 1:3332222‑M2/48‑50 (MQ=255) agaatttccaggtcagacgggctgcaagttgcagaccgttacgagatGGa > 1:2157290‑M2/48‑50 (MQ=255) agaatttccaggtcagacgggctgcaagttgcagaccgttacgagatGGa > 1:96968‑M2/48‑50 (MQ=255) gaatttccaggtcagacgggctgcaagttgcagaccgttacgagatGGAc < 1:2273977‑M2/4‑1 (MQ=255) aCATACAGCCTCCCGTGAGGCTGATGTCAAACCCAAAAACTGCACCGGAc < 1:5961043/50‑1 (MQ=255) aCATACAGCCTCCCGTGAGGCTGATGTCAAACCCAAAAACTGCACCGGAc > 1:2791045/1‑50 (MQ=255) aCATACAGCCTCCCGTGAGGCTGATGTCAAACCCAAAAACTGCACCGGAc < 1:3042880/50‑1 (MQ=255) aCATACAGCCTCCCGTGAGGCTGATGTCAAACCCAAAAACTGCACCGGAc > 1:3861764/1‑50 (MQ=255) aatttccaggtcagacgggctgcaagttgcagaccgttacgagatGGACg > 1:4980224‑M2/46‑50 (MQ=255) aTACAGCCTCCCGTGAGGCTGATGTCAAACCCAAAAACTGCACCGGACgg > 1:1602468/1‑50 (MQ=255) aTACAGCCTCCCGTGAGGCTGATGTCAAACCCAAAAACTGCACCGGACgg > 1:4047409/1‑50 (MQ=255) aTACAGCCTCCCGTGAGGCTGATGTCAAACCCAAAAACTGCACCGGACgg > 1:3585448/1‑50 (MQ=255) tttccaggtcagacgggctgcaagttgcagaccgttacgagatGGACGGt < 1:4716970‑M2/7‑1 (MQ=255) tttccaggtcagacgggctgcaagttgcagaccgttacgagatGGACGGt > 1:4137148‑M2/44‑50 (MQ=255) ttccaggtcagacgggctgcaagttgcagaccgttacgagatGGACGGTc > 1:1948829‑M2/43‑50 (MQ=255) tccaggtcagacgggctgcaagttgcagaccgttacgagatGGACGGTcc > 1:2102950‑M2/42‑50 (MQ=255) cAGCCTCCCGTGAGGCTGATGTCAAACCCAAAAACTGCACCGGACGGTcc > 1:4233853/1‑50 (MQ=255) ccaggtcagacgggctgcaagttgcagaccgttacgagatGGACGGTccc > 1:3888399‑M2/41‑50 (MQ=255) ccaggtcagacgggctgcaagttgcagaccgttacgagatGGACGGTcc < 1:5250687‑M2/9‑1 (MQ=255) aGCCTCCCGTGAGGCTGATGTCAAACCCAAAAACTGCACCGGACGGTccc > 1:567135/1‑50 (MQ=255) caggtcagacgggctgcaagttgcagaccgttacgagatGGACGGTccc < 1:4992474‑M2/10‑1 (MQ=255) caggtcagacgggctgcaagttgcagaccgttacgagatGGACGGTccc < 1:4490221‑M2/10‑1 (MQ=255) ccTCCCGTGAGGCTGATGTCAAACCCAAAAACTGCACCGGACGGTCCCCt > 1:5403013/1‑50 (MQ=255) aggtcagacgggctgcaagttgcagaccgttacgagatGGACGGTCCCCt > 1:1589125‑M2/39‑50 (MQ=255) aggtcagacgggctgcaagttgcagaccgttacgagatGGACGGTCCCCt < 1:2187263‑M2/12‑1 (MQ=255) ggtcagacgggctgcaagttgcagaccgttacgagatGGACGGTCCCCTc > 1:932491‑M2/38‑50 (MQ=255) ggtcagacgggctgcaagttgcagaccgttacgagatGGACGGTCCCCTc > 1:4494591‑M2/38‑50 (MQ=255) ggtcagacgggctgcaagttgcagaccgttacgagatGGACGGTCCCCTc < 1:5261671‑M2/13‑1 (MQ=255) cTCCCGTGAGGCTGATGTCAAACCCAAAAACTGCACCGGACGGTCCCCTc < 1:272581/50‑1 (MQ=255) cTCCCGTGAGGCTGATGTCAAACCCAAAAACTGCACCGGACGGTCCCCTc < 1:3280993/50‑1 (MQ=255) cTCCCGTGAGGCTGATGTCAAACCCAAAAACTGCACCGGACGGTCCCCTc > 1:5732106/1‑50 (MQ=255) gtcagacgggctgcaagttgcagaccgttacgagatGGACGGTCCCCTCg > 1:2868597‑M2/37‑50 (MQ=255) cccGTGAGGCTGATGTCAAACCCAAAAACTGCACCGGACGGTCCCCTCGc > 1:3864733/1‑50 (MQ=255) cccGTGAGGCTGATGTCAAACCCAAAAACTGCACCGGACGGTCCCCTCGc > 1:962801/1‑50 (MQ=255) agacgggctgcaagttgcagaccgttacgagatGGACGGTCCCCTCGccc > 1:4580154‑M2/34‑50 (MQ=255) agacgggctgcaagttgcagaccgttacgagatGGACGGTCCCCTCGccc > 1:5040287‑M2/34‑50 (MQ=255) agacgggctgcaagttgcagaccgttacgagatGGACGGTCCCCTCGccc > 1:2895984‑M2/34‑50 (MQ=255) gacgggctgcaagttgcagaccgttacgagatGGACGGTCCCCTCGcccc > 1:1865954‑M2/33‑50 (MQ=255) acgggctgcaagttgcagaccgttacgagatGGACGGTCCCCTCgccccc < 1:4685526‑M2/19‑2 (MQ=255) acgggctgcaagttgcagaccgttacgagatGGACGGTCCCCTCgccccc < 1:531210‑M2/19‑2 (MQ=255) cgggctgcaagttgcagaccgttacgagatGGACGGTCCCCTcgccccct < 1:4295636‑M2/20‑3 (MQ=255) gggctgcaagttgcagaccgttacgagatGGACGGTCCCCTCGCCCCctt < 1:4898934‑M2/21‑1 (MQ=255) aGGCTGATGTCAAACCCAAAAACTGCACCGGACGGTCCCCTCGCCCCttt > 1:4856017/1‑50 (MQ=255) aGGCTGATGTCAAACCCAAAAACTGCACCGGACGGTCCCCTCGCCCCttt < 1:1037771/50‑1 (MQ=255) ggctgcaagttgcagaccgttacgagatGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTg > 1:4804067‑M2/29‑50 (MQ=255) ggctgcaagttgcagaccgttacgagatGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTg < 1:5491681‑M2/22‑1 (MQ=255) ggctgcaagttgcagaccgttacgagatGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTg > 1:3523766‑M2/29‑50 (MQ=255) gctgcaagttgcagaccgttacgagatGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTgg > 1:2176446‑M2/28‑50 (MQ=255) gCTGATGTCAAACCCAAAAACTGCACCGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTgg < 1:2630382/50‑1 (MQ=255) gCTGATGTCAAACCCAAAAACTGCACCGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTgg < 1:5476635/50‑1 (MQ=255) gCTGATGTCAAACCCAAAAACTGCACCGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTgg < 1:2992186/50‑1 (MQ=255) ctgcaagttgcagaccgttacgagatGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTggg > 1:495453‑M2/27‑50 (MQ=255) ctgcaagttgcagaccgttacgagatGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTggg > 1:3943108‑M2/27‑50 (MQ=255) cTGATGTCAAACCCAAAAACTGCACCGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTggg < 1:4942381/50‑1 (MQ=255) cTGATGTCAAACCCAAAAACTGCACCGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTggg < 1:2914303/50‑1 (MQ=255) tGATGTCAAACCCAAAAACTGCACCGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTggg > 1:4659227/1‑49 (MQ=255) caagttgcagtcagttacgagatGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGgag < 1:5417306‑M2/27‑1 (MQ=255) aTGTCAAACCCAAAAACTGCACCGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTgggg < 1:4901831/48‑1 (MQ=255) aTGTCAAACCCAAAAACTGCACCGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGgag < 1:5605674/50‑1 (MQ=255) aTGTCAAACCCAAAAACTGCACCGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGga < 1:1709822/49‑1 (MQ=255) aTGTCAAACCCAAAAACTGCACCGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGga < 1:2358851/49‑1 (MQ=255) aTGTCAAACCCAAAAACTGCACCGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGga < 1:2526934/49‑1 (MQ=255) aagttgcagaccgttacgagatGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGga > 1:610060‑M2/23‑48 (MQ=255) aagttgcagaccgttacgagatGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGga > 1:4162667‑M2/23‑48 (MQ=255) tgcagaccgttacgagatGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGt > 1:4390809‑M2/19‑50 (MQ=255) aaaCCCAAAAACTGCACCGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAggg < 1:2380823/49‑1 (MQ=255) aaaCCCAAAAACTGCACCGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGt > 1:2182751/1‑50 (MQ=255) aaaCCCAAAAACTGCACCGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGt > 1:4556616/1‑50 (MQ=255) gcagaccgttacgagatGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGt < 1:994598‑M2/32‑1 (MQ=255) gcagaccgttacgagatGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGt < 1:2947852‑M2/32‑1 (MQ=255) cccAAAAACTGCACCGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAg < 1:149719/50‑1 (MQ=255) agaccgttacgagatGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAg < 1:5976833‑M2/35‑1 (MQ=255) agaccgttacgagatGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAg > 1:4077113‑M2/16‑50 (MQ=255) agaccgttacgagatGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAg > 1:3189415‑M2/16‑50 (MQ=255) gaccgttacgagatGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAgg < 1:3917618‑M2/36‑1 (MQ=255) gaccgttacgagatGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAgg < 1:3730890‑M2/36‑1 (MQ=255) gaccgttacgagatGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAgg < 1:5509616‑M2/36‑1 (MQ=255) ccAAAAACTGCACCGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAgg < 1:5092156/50‑1 (MQ=255) ccAAAAACTGCACCGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAgg > 1:1939829/1‑50 (MQ=255) ccAAAAACTGCACCGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAgg < 1:366335/50‑1 (MQ=255) cAAAAACTGCACCGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAggg < 1:4342669/50‑1 (MQ=255) cAAAAACTGCACCGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAgg > 1:2551759/1‑49 (MQ=255) ccgttacgagatGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTagggt < 1:2492137‑M2/38‑2 (MQ=255) cgttacgagatGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTtagggtg < 1:2169019‑M2/39‑3 (MQ=255) cgttacgagatGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTagggt > 1:3383385‑M2/12‑48 (MQ=255) aaaaCTGCACCGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTACGgag < 1:5955314/50‑1 (MQ=255) aaCTGCACCGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGagag > 1:4868274/1‑50 (MQ=255) aaCTGCACCGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGagag < 1:5652036/50‑1 (MQ=255) cTGCACCGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAggg < 1:5508278/50‑1 (MQ=255) cTGCACCGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAggg < 1:1462785/50‑1 (MQ=255) tGCACCGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAggg > 1:5673846/1‑49 (MQ=255) aCCGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGaaa < 1:477389/50‑1 (MQ=255) ccGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGaaaa > 1:1034665/1‑50 (MQ=255) | ACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTGATGTCAAACCCAAAAACTGCACCGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGAAAA > NC_000913/4070395‑4070491 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |