| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 380111 | 0 (0.000) | 74 (0.840) +CGAGATGGACG |
45/76 | 0.0 | 60.6% | coding (732/774 nt) | yaiO | outer membrane protein YaiO |
| ? | NC_000913 | 624576 = | 125 (1.100) | intergenic (‑66/‑309) | fepB/entC | ferric enterobactin ABC transporter periplasmic binding protein/isochorismate synthase EntC | |||||
AGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/380064‑380111‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGG > NC_000913/624576‑624614 ||||||||||| AGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACG < 1:7466760/50‑1AGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAC > 1:6257845/1‑49 GGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAC > 1:5369653/1‑48 GGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAC > 1:7960781/1‑48 GAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAG < 1:6437315/50‑1 AATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGA < 1:7768365/50‑1 AATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAC > 1:373759/1‑46 AATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAC > 1:6734151/1‑46 AATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAC > 1:3022632/1‑46 ATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGAT > 1:5455219/1‑50 ATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGAT < 1:2854453/50‑1 ATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGAT < 1:4325494/50‑1 TCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATG < 1:6377569/50‑1 AGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGA > 1:7343863/1‑50 AGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGA < 1:4864575/50‑1 AATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACG > 1:4285899/1‑50 ATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGG > 1:462110/1‑50 ATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGG < 1:4386438/50‑1 ATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGG > 1:3760077/1‑50 TTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGT > 1:5290485/1‑50 TTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGT < 1:7266858/50‑1 TTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTC > 1:3119517/1‑50 TCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCC > 1:4217531/1‑50 TCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCC > 1:5871690/1‑50 TCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCC > 1:6261536/1‑50 CAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCC < 1:217263/50‑1 CAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCC < 1:1415310/50‑1 AGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCT > 1:1142415/1‑50 AGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCT < 1:616575/50‑1 GGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTC < 1:7058269/50‑1 GGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTC > 1:1353303/1‑50 GGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTC < 1:6747682/50‑1 GGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTC < 1:2850605/50‑1 GGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTC < 1:6007719/50‑1 GGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGAAGGTCCCCTC < 1:6557806/50‑1 CAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCC > 1:6973721/1‑50 AGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCC > 1:7747810/1‑50 AGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCC > 1:5902212/1‑50 AGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCC < 1:901284/50‑1 AGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCC < 1:690954/49‑1 ACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCc > 1:6695763/1‑49 ACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCc > 1:6722964/1‑49 CGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCct > 1:6373139/1‑48 CGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCct > 1:3820385/1‑48 GGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTT > 1:6899083/1‑50 GGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTT > 1:242564/1‑50 GGCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTG > 1:5372240/1‑50 GCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGG < 1:131329/50‑1 GCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGG > 1:8215449/1‑50 GCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGG > 1:1418989/1‑50 GCTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGG < 1:1696110/50‑1 CTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGG < 1:4581164/50‑1 CTGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGG > 1:759023/1‑50 TGCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGG > 1:429494/1‑49 GCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGG > 1:5237993/1‑48 GCAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGG > 1:150324/1‑48 CAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAG < 1:2851935/50‑1 CAAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGG < 1:2485266/48‑1 AAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGA < 1:1348575/50‑1 AAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGA > 1:5815610/1‑48 AAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGA > 1:225124/1‑48 AAGTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGA > 1:645045/1‑48 GTTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGG < 1:5660934/50‑1 TTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGG < 1:5124178/50‑1 TTGCAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGG > 1:6201397/1‑50 CAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTA < 1:5633292/50‑1 CAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTT < 1:1783351/49‑1 CAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTT < 1:4259590/49‑1 CAGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGT > 1:4425914/1‑48 AGACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAG > 1:3931495/1‑50 GACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGG > 1:4596749/1‑50 ACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGG > 1:3422209/1‑50 ACCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGG < 1:1449510/50‑1 CCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGT < 1:4059910/50‑1 CCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGT < 1:6756697/50‑1 CCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGT > 1:7949865/1‑50 CCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGT < 1:782224/50‑1 CCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGT < 1:4428604/50‑1 CCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGT > 1:44536/1‑50 CCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGT < 1:7692428/50‑1 CCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGT > 1:1678730/1‑50 CCGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGT < 1:5751541/50‑1 CGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTG < 1:6996185/50‑1 CGTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGT > 1:3014711/1‑49 GTTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCACCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGT > 1:4980972/1‑48 TTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAG > 1:5183198/1‑50 TTACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAG < 1:6660147/50‑1 TACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGCGAGG > 1:8558333/1‑50 ACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGG < 1:433434/49‑1 ACGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGG < 1:3476691/49‑1 CGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGG > 1:5506552/1‑50 CGAGATGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGG < 1:34014/49‑1 ||||||||||| AGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/380064‑380111‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGG > NC_000913/624576‑624614 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |