| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 380111 | 0 (0.000) | 74 (0.840) +CGAGATGGACG |
45/76 | 0.0 | 60.6% | coding (732/774 nt) | yaiO | outer membrane protein YaiO |
| ? | NC_000913 | 624576 = | 125 (1.100) | intergenic (‑66/‑309) | fepB/entC | ferric enterobactin ABC transporter periplasmic binding protein/isochorismate synthase EntC | |||||
GAAGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAAAATCATCGGTTGGGGTGTCGTACCACACTTTACCTGCCGTCAGCCCG > NC_000913/380062‑380159 | gAAGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTa > 1:3356189/1‑50 (MQ=255)gAAGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTa > 1:2376286/1‑50 (MQ=255)gAAGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTa < 1:1764361/50‑1 (MQ=255) aGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcg < 1:7466760‑M1/50‑3 (MQ=255) aGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAc > 1:6257845‑M1/1‑48 (MQ=255) ggAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAc > 1:5369653‑M1/1‑47 (MQ=255) ggAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAc > 1:7960781‑M1/1‑47 (MQ=255) gAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgag < 1:6437315‑M1/50‑5 (MQ=255) aaTCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgaga < 1:7768365‑M1/50‑6 (MQ=255) aaTCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAc > 1:6734151‑M1/1‑45 (MQ=255) aaTCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAc > 1:3022632‑M1/1‑45 (MQ=255) aaTCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAc > 1:373759‑M1/1‑45 (MQ=255) aTCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagat > 1:5455219‑M1/1‑44 (MQ=255) aTCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagat < 1:2854453‑M1/50‑7 (MQ=255) aTCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagat < 1:4325494‑M1/50‑7 (MQ=255) tCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatg < 1:6377569‑M1/50‑8 (MQ=255) aGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatgga < 1:4864575‑M1/50‑10 (MQ=255) aGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatgga > 1:7343863‑M1/1‑41 (MQ=255) aaTTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacg > 1:4285899‑M1/1‑39 (MQ=255) aTTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacgg > 1:462110‑M1/1‑38 (MQ=255) aTTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacgg > 1:3760077‑M1/1‑38 (MQ=255) aTTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacgg < 1:4386438‑M1/50‑13 (MQ=255) tttCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggt < 1:7266858‑M1/50‑14 (MQ=255) tttCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggt > 1:5290485‑M1/1‑37 (MQ=255) ttCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtc > 1:3119517‑M1/1‑36 (MQ=255) tCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcc > 1:4217531‑M1/1‑35 (MQ=255) tCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcc > 1:6261536‑M1/1‑35 (MQ=255) tCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcc > 1:5871690‑M1/1‑35 (MQ=255) cAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccc < 1:217263‑M1/50‑18 (MQ=255) cAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccc < 1:1415310‑M1/50‑18 (MQ=255) aGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccct < 1:616575‑M1/50‑19 (MQ=255) aGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccct > 1:1142415‑M1/1‑32 (MQ=255) ggTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctc > 1:1353303‑M1/1‑31 (MQ=255) ggTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctc < 1:6747682‑M1/50‑20 (MQ=255) ggTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctc < 1:6007719‑M1/50‑20 (MQ=255) ggTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctc < 1:2850605‑M1/50‑20 (MQ=255) ggTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctc < 1:7058269‑M1/50‑20 (MQ=255) ggTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggaaggtcccctc < 1:6557806‑M1/50‑20 (MQ=255) cAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcc > 1:6973721‑M1/1‑28 (MQ=255) aGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccc < 1:901284‑M1/50‑24 (MQ=255) aGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccc > 1:5902212‑M1/1‑27 (MQ=255) aGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccc > 1:7747810‑M1/1‑27 (MQ=255) aGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcc < 1:690954‑M1/49‑23 (MQ=255) aCGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccccc > 1:6722964‑M1/1‑25 (MQ=255) aCGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccccc > 1:6695763‑M1/1‑25 (MQ=255) cGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccccct > 1:6373139‑M1/1‑24 (MQ=255) cGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccccct > 1:3820385‑M1/1‑24 (MQ=255) gggCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccccctt > 1:242564‑M1/1‑23 (MQ=255) gggCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccccctt > 1:6899083‑M1/1‑23 (MQ=255) ggCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttg > 1:5372240‑M1/1‑22 (MQ=255) gCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttgg > 1:8215449‑M1/1‑21 (MQ=255) gCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttgg < 1:131329‑M1/50‑30 (MQ=255) gCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttgg < 1:1696110‑M1/50‑30 (MQ=255) gCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttgg > 1:1418989‑M1/1‑21 (MQ=255) cTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggg < 1:4581164‑M1/50‑31 (MQ=255) cTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggg > 1:759023‑M1/1‑20 (MQ=255) tGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggg > 1:429494‑M1/1‑19 (MQ=255) gCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggg > 1:150324‑M1/1‑18 (MQ=255) gCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggg > 1:5237993‑M1/1‑18 (MQ=255) cAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggag < 1:2851935‑M1/50‑34 (MQ=255) cAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttgggg < 1:2485266‑M1/48‑32 (MQ=255) aaGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggaga < 1:1348575‑M1/50‑35 (MQ=255) aaGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttgggga > 1:5815610‑M1/1‑16 (MQ=255) aaGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttgggga > 1:225124‑M1/1‑16 (MQ=255) aaGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttgggga > 1:645045‑M1/1‑16 (MQ=255) gTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagg < 1:5660934‑M1/50‑37 (MQ=255) ttGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagaggg < 1:5124178‑M1/50‑38 (MQ=255) ttGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagaggg > 1:6201397‑M1/1‑13 (MQ=255) cAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggtta < 1:5633292‑M1/50‑41 (MQ=255) cAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggtt < 1:4259590‑M1/49‑40 (MQ=255) cAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggtt < 1:1783351‑M1/49‑40 (MQ=255) cAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggt > 1:4425914‑M1/1‑10 (MQ=255) aGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttag > 1:3931495‑M1/1‑9 (MQ=255) gACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagg > 1:4596749‑M1/1‑8 (MQ=255) aCCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttaggg < 1:1449510‑M1/50‑44 (MQ=255) aCCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttaggg > 1:3422209‑M1/1‑7 (MQ=255) ccGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggt < 1:5751541‑M1/50‑45 (MQ=255) ccGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggt < 1:4059910‑M1/50‑45 (MQ=255) ccGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggt > 1:7949865‑M1/1‑6 (MQ=255) ccGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggt < 1:782224‑M1/50‑45 (MQ=255) ccGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggt > 1:1678730‑M1/1‑6 (MQ=255) ccGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggt < 1:7692428‑M1/50‑45 (MQ=255) ccGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggt > 1:44536‑M1/1‑6 (MQ=255) ccGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggt < 1:4428604‑M1/50‑45 (MQ=255) ccGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggt < 1:6756697‑M1/50‑45 (MQ=255) cGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggtg < 1:6996185‑M1/50‑46 (MQ=255) cGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggt > 1:3014711‑M1/1‑5 (MQ=255) gTTAcgagatggacggtcccctcgcacccttggggagagggttagggt > 1:4980972‑M1/1‑4 (MQ=255) ttAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggtgag < 1:6660147‑M1/50‑48 (MQ=255) ttAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggtgag > 1:5183198‑M1/1‑3 (MQ=255) tAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggcgagg > 1:8558333‑M1/1‑2 (MQ=255) acgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggtgagg < 1:433434‑M1/49‑49 (MQ=255) acgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggtgagg < 1:3476691‑M1/49‑49 (MQ=255) | GAAGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAAAATCATCGGTTGGGGTGTCGTACCACACTTTACCTGCCGTCAGCCCG > NC_000913/380062‑380159 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |