| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 1,299,499 | Δ1,199 bp | insH21 | insH21 | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 1299499 | 1300697 | 1199 | 96 [0] | [0] 97 | insH21 | insH21 |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1299498 | 0 (0.000) | 84 (0.800) | 55/90 | 0.0 | 100% | intergenic (+253/‑33) | ychE/insH21 | putative inner membrane protein/IS5 transposase and trans‑activator |
| ? | NC_000913 | 1300698 = | 0 (0.000) | intergenic (+151/‑484) | insH21/oppA | IS5 transposase and trans‑activator/oligopeptide ABC transporter periplasmic binding protein | |||||
ATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAG > NC_000913/1299449‑1299547 | atTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAA < 1:7158197‑M1/50‑1 (MQ=255) ttGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAa > 1:4226656‑M1/1‑49 (MQ=255) ttGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAa > 1:2946277‑M1/1‑49 (MQ=255) tGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAa > 1:3239067‑M1/1‑48 (MQ=255) tGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAa > 1:7545153‑M1/1‑48 (MQ=255) gAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAat > 1:641237‑M1/1‑47 (MQ=255) gAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAat < 1:1023665‑M1/49‑3 (MQ=255) gAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAat > 1:5203259‑M1/1‑47 (MQ=255) aaaTGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataa > 1:6763271‑M1/1‑46 (MQ=255) aaaTGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataa > 1:6532730‑M1/1‑46 (MQ=255) aaaTGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataa > 1:1125943‑M1/1‑46 (MQ=255) aaaTGAGATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataa < 1:7560059‑M1/50‑5 (MQ=255) aaTGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataat < 1:7114273‑M1/50‑6 (MQ=255) tGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataa < 1:5823538‑M1/50‑8 (MQ=255) gATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataat > 1:2954477‑M1/1‑42 (MQ=255) atatTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatc < 1:6868467‑M1/50‑10 (MQ=255) atatTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatc < 1:2219689‑M1/50‑10 (MQ=255) atatTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatc < 1:1295203‑M1/50‑10 (MQ=255) atatTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatc < 1:6276803‑M1/50‑10 (MQ=255) atatTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataat > 1:738029‑M1/1‑41 (MQ=255) atatTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataat > 1:6690115‑M1/1‑41 (MQ=255) tattatTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatca < 1:4736436‑M1/50‑11 (MQ=255) ttattaATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaat < 1:5487643‑M1/50‑13 (MQ=255) attaATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattg > 1:8506755‑M1/1‑36 (MQ=255) attaATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattg > 1:5599677‑M1/1‑36 (MQ=255) attaATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaatt < 1:5177114‑M1/49‑14 (MQ=255) ttaATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgt < 1:5644698‑M1/50‑16 (MQ=255) ttaATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgt > 1:1644873‑M1/1‑35 (MQ=255) taATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgt > 1:5379859‑M1/1‑34 (MQ=255) taATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgt > 1:3430723‑M1/1‑34 (MQ=255) taATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgt > 1:6050538‑M1/1‑34 (MQ=255) aaTTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgtt < 1:3415729‑M1/49‑17 (MQ=255) aaTTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgtt < 1:4263620‑M1/49‑17 (MQ=255) aTTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgtta < 1:1351095‑M1/49‑18 (MQ=255) aTTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgtta > 1:7129309‑M1/1‑32 (MQ=255) ttCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaa < 1:2814985‑M1/50‑20 (MQ=255) ttCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaa < 1:3151662‑M1/50‑20 (MQ=255) ttCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaa > 1:7511260‑M1/1‑31 (MQ=255) ttCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaa < 1:4755846‑M1/50‑20 (MQ=255) tCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaat > 1:4035104‑M1/1‑30 (MQ=255) tCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaat > 1:1728425‑M1/1‑30 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaat > 1:6861258‑M1/1‑29 (MQ=255) ccACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaat < 1:2864944‑M1/49‑21 (MQ=255) cACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaactgttaaatta < 1:6559880‑M1/50‑23 (MQ=255) aCTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattat < 1:1643466‑M1/50‑24 (MQ=255) aCTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattat < 1:2148802‑M1/50‑24 (MQ=255) cTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattatt < 1:7702250‑M1/50‑25 (MQ=255) ccTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtg < 1:5619012‑M1/50‑28 (MQ=255) ccTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtg > 1:2981260‑M1/1‑23 (MQ=255) ccTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtg < 1:4070208‑M1/50‑28 (MQ=255) ccTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgt < 1:3177678‑M1/49‑27 (MQ=255) ccTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgt < 1:5814122‑M1/49‑27 (MQ=255) ccTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattg < 1:6774989‑M1/48‑26 (MQ=255) ccTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattg < 1:7202331‑M1/48‑26 (MQ=255) cTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgc < 1:459325‑M1/50‑29 (MQ=255) ttGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcat > 1:3169737‑M1/1‑20 (MQ=255) tGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcat < 1:1825722‑M1/49‑31 (MQ=255) tGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgca < 1:6296469‑M1/48‑30 (MQ=255) tGGTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgca < 1:1101508‑M1/48‑30 (MQ=255) gTAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcattt > 1:1368509‑M1/1‑17 (MQ=255) tAGAGGAAAGTTCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttca > 1:6589000‑M1/1‑16 (MQ=255) tAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttca < 1:5919736‑M1/50‑35 (MQ=255) tAGAGGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttca > 1:5870704‑M1/1‑16 (MQ=255) agagGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcac > 1:2593296‑M1/1‑15 (MQ=255) gagGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcact < 1:8605556‑M1/50‑37 (MQ=255) gagGAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcac < 1:7957986‑M1/49‑36 (MQ=255) ggAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactac < 1:4605556‑M1/50‑39 (MQ=255) ggAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactac < 1:6585309‑M1/50‑39 (MQ=255) ggAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactac > 1:8056585‑M1/1‑12 (MQ=255) gAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactact < 1:7464463‑M1/50‑40 (MQ=255) gAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactact > 1:5428454‑M1/1‑11 (MQ=255) gAAAGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactact < 1:4510867‑M1/50‑40 (MQ=255) aaaGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactg > 1:697062‑M1/1‑10 (MQ=255) aaaGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactg < 1:2677320‑M1/50‑41 (MQ=255) aaaGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactg > 1:3182250‑M1/1‑10 (MQ=255) aaGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactg > 1:6970974‑M1/1‑9 (MQ=255) aaGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactg > 1:2279102‑M1/1‑9 (MQ=255) aGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactgg > 1:1086671‑M1/1‑8 (MQ=255) aGTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactgg > 1:8114374‑M1/1‑8 (MQ=255) gTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactgctggaa < 1:602024‑M1/50‑44 (MQ=255) gTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaa < 1:5957674‑M1/50‑44 (MQ=255) gTGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaa > 1:3358289‑M1/1‑7 (MQ=255) tGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaac < 1:8476815‑M1/50‑45 (MQ=255) tGCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaac < 1:4030304‑M1/50‑45 (MQ=255) gCTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaact > 1:1839555‑M1/1‑5 (MQ=255) cTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactg > 1:3438923‑M1/1‑4 (MQ=255) cTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactg > 1:6772623‑M1/1‑4 (MQ=255) cTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactg > 1:3473660‑M1/1‑4 (MQ=255) cTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaact < 1:3225946‑M1/49‑46 (MQ=255) tAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactg > 1:5689197‑M1/1‑3 (MQ=255) aaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgt > 1:7264970‑M1/1‑2 (MQ=255) aaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgt > 1:1736330‑M1/1‑2 (MQ=255) aaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgt > 1:6483808‑M1/1‑2 (MQ=255) aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaa > 1:2808208‑M1/1‑1 (MQ=255) aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaa < 1:7323283‑M1/50‑50 (MQ=255) aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgt < 1:755381‑M1/48‑48 (MQ=255) | ATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAG > NC_000913/1299449‑1299547 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |