| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 1,299,499 | Δ1,199 bp | insH21 | insH21 | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 1299499 | 1300697 | 1199 | 96 [0] | [0] 97 | insH21 | insH21 |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1299498 | 0 (0.000) | 84 (0.800) | 55/90 | 0.0 | 100% | intergenic (+253/‑33) | ychE/insH21 | putative inner membrane protein/IS5 transposase and trans‑activator |
| ? | NC_000913 | 1300698 = | 0 (0.000) | intergenic (+151/‑484) | insH21/oppA | IS5 transposase and trans‑activator/oligopeptide ABC transporter periplasmic binding protein | |||||
GACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAAT > NC_000913/1300649‑1300747 | ttgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaa > 1:2946277‑M2/50‑50 (MQ=255)ttgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaa > 1:4226656‑M2/50‑50 (MQ=255) tgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaa > 1:7545153‑M2/49‑49 (MQ=255) tgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaa > 1:3239067‑M2/49‑49 (MQ=255) gaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaat > 1:5203259‑M2/48‑49 (MQ=255) gaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaat > 1:641237‑M2/48‑49 (MQ=255) gaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaat < 1:1023665‑M2/2‑1 (MQ=255) aaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataa > 1:6532730‑M2/47‑50 (MQ=255) aaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataa > 1:6763271‑M2/47‑50 (MQ=255) aaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataa > 1:1125943‑M2/47‑50 (MQ=255) aaatgagattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataa < 1:7560059‑M2/4‑1 (MQ=255) aatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataat < 1:7114273‑M2/5‑1 (MQ=255) tgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataa < 1:5823538‑M2/7‑1 (MQ=255) gatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataat > 1:2954477‑M2/43‑50 (MQ=255) atattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataat > 1:6690115‑M2/42‑49 (MQ=255) atattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataat > 1:738029‑M2/42‑49 (MQ=255) atattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATc < 1:6868467‑M2/9‑1 (MQ=255) atattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATc < 1:6276803‑M2/9‑1 (MQ=255) atattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATc < 1:2219689‑M2/9‑1 (MQ=255) atattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATc < 1:1295203‑M2/9‑1 (MQ=255) tattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCa < 1:4736436‑M2/10‑1 (MQ=255) ttattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAAt < 1:5487643‑M2/12‑1 (MQ=255) attaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAAtt < 1:5177114‑M2/13‑1 (MQ=255) attaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTg > 1:5599677‑M2/37‑50 (MQ=255) attaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTg > 1:8506755‑M2/37‑50 (MQ=255) ttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGt < 1:5644698‑M2/15‑1 (MQ=255) ttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGt > 1:1644873‑M2/36‑50 (MQ=255) taattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGt > 1:6050538‑M2/35‑49 (MQ=255) taattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGt > 1:5379859‑M2/35‑49 (MQ=255) taattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGt > 1:3430723‑M2/35‑49 (MQ=255) aattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGtt < 1:4263620‑M2/16‑1 (MQ=255) aattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGtt < 1:3415729‑M2/16‑1 (MQ=255) attccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTa > 1:7129309‑M2/33‑49 (MQ=255) attccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTa < 1:1351095‑M2/17‑1 (MQ=255) ttccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTaaa < 1:4755846‑M2/19‑1 (MQ=255) ttccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTaaa > 1:7511260‑M2/32‑50 (MQ=255) ttccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTaaa < 1:2814985‑M2/19‑1 (MQ=255) ttccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTaaa < 1:3151662‑M2/19‑1 (MQ=255) tccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAat > 1:1728425‑M2/31‑50 (MQ=255) tccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAat > 1:4035104‑M2/31‑50 (MQ=255) ccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAat < 1:2864944‑M2/20‑1 (MQ=255) ccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAat > 1:6861258‑M2/30‑49 (MQ=255) cactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAACTGTTAAatta < 1:6559880‑M2/22‑1 (MQ=255) actgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAattat < 1:1643466‑M2/23‑1 (MQ=255) actgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAattat < 1:2148802‑M2/23‑1 (MQ=255) ctgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAattatt < 1:7702250‑M2/24‑1 (MQ=255) cctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATtgtg < 1:4070208‑M2/27‑1 (MQ=255) cctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATtgtg > 1:2981260‑M2/24‑50 (MQ=255) cctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATtgtg < 1:5619012‑M2/27‑1 (MQ=255) cctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATtgt < 1:3177678‑M2/26‑1 (MQ=255) cctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATtgt < 1:5814122‑M2/26‑1 (MQ=255) cctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATtg < 1:7202331‑M2/25‑1 (MQ=255) cctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATtg < 1:6774989‑M2/25‑1 (MQ=255) ctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGc < 1:459325‑M2/28‑1 (MQ=255) ttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAt > 1:3169737‑M2/21‑50 (MQ=255) tggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCa < 1:1101508‑M2/29‑1 (MQ=255) tggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCa < 1:6296469‑M2/29‑1 (MQ=255) tggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAt < 1:1825722‑M2/30‑1 (MQ=255) gtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAttt > 1:1368509‑M2/18‑49 (MQ=255) tagaggaaagttctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCa > 1:6589000‑M2/17‑50 (MQ=255) tagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCa > 1:5870704‑M2/17‑50 (MQ=255) tagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCa < 1:5919736‑M2/34‑1 (MQ=255) agaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCac > 1:2593296‑M2/16‑50 (MQ=255) gaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCact < 1:8605556‑M2/36‑1 (MQ=255) gaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCac < 1:7957986‑M2/35‑1 (MQ=255) ggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCactac > 1:8056585‑M2/13‑50 (MQ=255) ggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCactac < 1:6585309‑M2/38‑1 (MQ=255) ggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCactac < 1:4605556‑M2/38‑1 (MQ=255) gaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCactact > 1:5428454‑M2/12‑50 (MQ=255) gaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCactact < 1:4510867‑M2/39‑1 (MQ=255) gaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCactact < 1:7464463‑M2/39‑1 (MQ=255) aaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTg < 1:2677320‑M2/40‑1 (MQ=255) aaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTg > 1:3182250‑M2/11‑50 (MQ=255) aaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTg > 1:697062‑M2/11‑50 (MQ=255) aagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTg > 1:2279102‑M2/10‑49 (MQ=255) aagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTg > 1:6970974‑M2/10‑49 (MQ=255) agtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTgg > 1:1086671‑M2/9‑49 (MQ=255) agtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTgg > 1:8114374‑M2/9‑49 (MQ=255) gtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTGCTGGaa < 1:602024‑M2/43‑1 (MQ=255) gtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGaa > 1:3358289‑M2/8‑50 (MQ=255) gtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGaa < 1:5957674‑M2/43‑1 (MQ=255) tgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAAc < 1:4030304‑M2/44‑1 (MQ=255) tgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAAc < 1:8476815‑M2/44‑1 (MQ=255) gctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACt > 1:1839555‑M2/6‑50 (MQ=255) ctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACt < 1:3225946‑M2/45‑1 (MQ=255) ctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTg > 1:3473660‑M2/5‑50 (MQ=255) ctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTg > 1:6772623‑M2/5‑50 (MQ=255) ctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTg > 1:3438923‑M2/5‑50 (MQ=255) taaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTg > 1:5689197‑M2/4‑49 (MQ=255) aaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGt > 1:7264970‑M2/3‑49 (MQ=255) aaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGt > 1:1736330‑M2/3‑49 (MQ=255) aaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGt > 1:6483808‑M2/3‑49 (MQ=255) aATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGt < 1:755381‑M2/47‑1 (MQ=255) aATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTaa > 1:2808208‑M2/2‑50 (MQ=255) aATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTaa < 1:7323283‑M2/49‑1 (MQ=255) ataataatCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAAt > 1:5050817/1‑50 (MQ=255) ataataatCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAAt < 1:6113554/50‑1 (MQ=255) | GACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAAT > NC_000913/1300649‑1300747 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |