| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 1,509,562 | Δ46,201 bp | [hicB]–maeA | 43 genes [hicB], ydcR, ydcS, ydcT, ydcU, ydcV, patD, yncL, ortT, ydcY, ydcZ, mnaT, curA, mcbR, yncD, yncE, ansP, yncG, yncH, rhsE, ydcD, yncO, yncI, ydcC, pptA, yddH, nhoA, yddE, narV, narW, narY, narZ, narU, yddJ, yddK, yddL, yddG, fdnG, fdnH, fdnI, yddM, adhP, maeA |
|
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 1509562 | 1555762 | 46201 | 119 [0] | [0] 121 | [hicB]–maeA | [hicB],ydcR,ydcS,ydcT,ydcU,ydcV,patD,yncL,ortT,ydcY,ydcZ,mnaT,curA,mcbR,yncD,yncE,ansP,yncG,yncH,rhsE,ydcD,yncO,yncI,ydcC,pptA,yddH,nhoA,yddE,narV,narW,narY,narZ,narU,yddJ,yddK,yddL,yddG,fdnG,fdnH,fdnI,yddM,adhP,maeA |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1509561 | 0 (0.000) | 119 (1.040) | 63/98 | 0.0 | 100% | coding (54/417 nt) | hicB | antitoxin of the HicA‑HicB toxin‑antitoxin system |
| ? | NC_000913 | 1555763 = | 0 (0.000) | intergenic (‑94/+63) | maeA/sra | malate dehydrogenase, NAD‑requiring/30S ribosomal subunit protein S22 | |||||
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
TTATCCCGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTTTTGTGGATATCCCTGAAGCGTTGACCCAGGGCGAAACTGTCGCTGAAG > NC_000913/1509513‑1509610 | ttATCCCGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTa < 1:6580958‑M1/50‑2 (MQ=255) tATCCCGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTa > 1:7721951‑M1/1‑48 (MQ=255) tATCCCGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTa > 1:4140577‑M1/1‑48 (MQ=255) tATCCCGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTa > 1:5390375‑M1/1‑48 (MQ=255) aTCCCGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaa > 1:1294325‑M1/1‑47 (MQ=255) aTCCCGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaa < 1:2099811‑M1/49‑3 (MQ=255) tCCCGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaac < 1:6387898‑M1/50‑5 (MQ=255) tCCCGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaac < 1:4083859‑M1/50‑5 (MQ=255) tCCCGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaac < 1:1122970‑M1/50‑5 (MQ=255) tCCCGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaa < 1:8619128‑M1/49‑4 (MQ=255) tCCCGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaa < 1:4578819‑M1/49‑4 (MQ=255) cccGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaac > 1:3507400‑M1/1‑45 (MQ=255) cccGTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaac > 1:3978734‑M1/1‑45 (MQ=255) gTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaa < 1:1907258‑M1/50‑9 (MQ=255) gTCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaa < 1:5021093‑M1/50‑9 (MQ=255) tCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaa > 1:5883650‑M1/1‑41 (MQ=255) tCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaa < 1:5553708‑M1/50‑10 (MQ=255) tCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaa < 1:533738‑M1/50‑10 (MQ=255) tCACTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaa < 1:2521904‑M1/50‑10 (MQ=255) aCTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaaca < 1:726859‑M1/50‑12 (MQ=255) aCTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaaca > 1:5241833‑M1/1‑39 (MQ=255) aCTCTTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaaca > 1:3718180‑M1/1‑39 (MQ=255) ctctTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacac < 1:2644726‑M1/50‑13 (MQ=255) tctTACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacac > 1:473151‑M1/1‑37 (MQ=255) ttACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccat > 1:2047517‑M1/1‑35 (MQ=255) ttACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacacc < 1:7162459‑M1/48‑14 (MQ=255) ttACACCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacacc < 1:5518014‑M1/48‑14 (MQ=255) acacCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccatt < 1:4184009‑M1/49‑17 (MQ=255) acacCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccatt < 1:549754‑M1/49‑17 (MQ=255) acacCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccat < 1:4882406‑M1/48‑16 (MQ=255) acacCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccat < 1:7298125‑M1/48‑16 (MQ=255) acacCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccat < 1:7775091‑M1/48‑16 (MQ=255) cacCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgc < 1:3196303‑M1/50‑19 (MQ=255) cacCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgc > 1:3235759‑M1/1‑32 (MQ=255) cacCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgc > 1:6493353‑M1/1‑32 (MQ=255) cacCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgc < 1:5962144‑M1/50‑19 (MQ=255) cacCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattg < 1:5789779‑M1/49‑18 (MQ=255) acCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcg < 1:2738437‑M1/50‑20 (MQ=255) acCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcg > 1:4458022‑M1/1‑31 (MQ=255) acCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcg < 1:4423809‑M1/50‑20 (MQ=255) acCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcg < 1:4262048‑M1/50‑20 (MQ=255) acCCGCGCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcg < 1:3011211‑M1/50‑20 (MQ=255) cgcgCCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcag < 1:5034642‑M1/50‑23 (MQ=255) gcgcCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcagg > 1:6295957‑M1/1‑27 (MQ=255) gcgcCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcagg < 1:7322239‑M1/50‑24 (MQ=255) cgcCGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggc < 1:4142941‑M1/50‑25 (MQ=255) ccGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaa > 1:1466803‑M1/1‑24 (MQ=255) cGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaat < 1:8040103‑M1/50‑28 (MQ=255) cGGAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaat < 1:1731132‑M1/50‑28 (MQ=255) gAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatgg > 1:3015875‑M1/1‑21 (MQ=255) gAAGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatgg > 1:7169708‑M1/1‑21 (MQ=255) aaGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggt < 1:5756955‑M1/50‑31 (MQ=255) aaGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggt > 1:6887486‑M1/1‑20 (MQ=255) aaGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggt < 1:1467818‑M1/50‑31 (MQ=255) aaGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggt > 1:8602993‑M1/1‑20 (MQ=255) aaGGCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggt > 1:8573562‑M1/1‑20 (MQ=255) ggCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgt > 1:2262701‑M1/1‑18 (MQ=255) ggCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgt > 1:7285882‑M1/1‑18 (MQ=255) ggCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgt < 1:2588325‑M1/50‑33 (MQ=255) gCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtt < 1:7005148‑M1/50‑34 (MQ=255) gCGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtt > 1:8585180‑M1/1‑17 (MQ=255) cGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgttt < 1:1677695‑M1/50‑35 (MQ=255) cGGTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtt > 1:3239962‑M1/1‑16 (MQ=255) ggTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgttta < 1:531178‑M1/50‑36 (MQ=255) ggTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgttt > 1:744233‑M1/1‑15 (MQ=255) ggTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgttt > 1:5840911‑M1/1‑15 (MQ=255) ggTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgttt > 1:5651270‑M1/1‑15 (MQ=255) gTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaa > 1:1860980‑M1/1‑14 (MQ=255) gTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaa > 1:4521455‑M1/1‑14 (MQ=255) gTTATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaa > 1:1048081‑M1/1‑14 (MQ=255) ttATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaat > 1:5557410‑M1/1‑13 (MQ=255) ttATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaat < 1:3180928‑M1/50‑38 (MQ=255) ttATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaat > 1:7683377‑M1/1‑13 (MQ=255) ttATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaat > 1:4647014‑M1/1‑13 (MQ=255) ttATATGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaat > 1:6553417‑M1/1‑13 (MQ=255) tataTGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaatc > 1:5016271‑M1/1‑12 (MQ=255) tataTGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaatc > 1:695169‑M1/1‑12 (MQ=255) atatGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggtaatggtgtttaatcg > 1:6059904‑M1/1‑11 (MQ=255) atatGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaatcg > 1:3031722‑M1/1‑11 (MQ=255) atatGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaatc < 1:1119670‑M1/49‑39 (MQ=255) tatGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaatcgt < 1:887484‑M1/50‑41 (MQ=255) tatGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaatcgt > 1:5004991‑M1/1‑10 (MQ=255) tGGTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaatcgtca > 1:1414817‑M1/1‑8 (MQ=255) gTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaatcgtcatt < 1:2309259‑M1/50‑45 (MQ=255) gTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaatcgtcatt < 1:3971401‑M1/50‑45 (MQ=255) gTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaatcgtcatt > 1:5598571‑M1/1‑6 (MQ=255) gTTTCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaatcgtcat < 1:1060274‑M1/49‑44 (MQ=255) tttCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaatcgtcattg < 1:4762155‑M1/50‑46 (MQ=255) tttCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaatcgtcattg < 1:6148276‑M1/50‑46 (MQ=255) tttCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaatcgtcattg < 1:7941662‑M1/50‑46 (MQ=255) tttCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaatcgtcattg < 1:6178894‑M1/50‑46 (MQ=255) tttCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaatcgtcatt > 1:2669606‑M1/1‑5 (MQ=255) tttCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaatcgtcatt > 1:6728627‑M1/1‑5 (MQ=255) ttCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaatcgtcatt > 1:5124266‑M1/1‑4 (MQ=255) tCTaaacaaaaacaccattgcgcaggcaatggtgtttaatcgtcattgag > 1:3386984‑M1/1‑3 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |