| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 380111 | 5 (0.050) | 86 (0.900) +CGAGAT |
47/86 | 0.2 | 62.3% | coding (732/774 nt) | yaiO | outer membrane protein YaiO |
| ? | NC_000913 | 4070444 = | 114 (1.040) | intergenic (‑43/+71) | yihR/yihS | putative aldose 1‑epimerase YihR/sulfoquinovose isomerase | |||||
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
GAAGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAAAATCATCGGTTGGGGTGTCGTACCACACTTTACCTGCCGTCAGCCC > NC_000913/380062‑380158 | gAAGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTa > 2:517062/1‑50 (MQ=255)gAAGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTa > 1:4484300/1‑50 (MQ=255)gAAGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTa < 1:1407008/50‑1 (MQ=255)gAAGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTa > 1:4237731/1‑50 (MQ=255)gAAGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTa < 1:2199869/50‑1 (MQ=255) aaGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAc > 2:1919574‑M1/1‑49 (MQ=255) aaGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAc < 1:377241‑M1/50‑2 (MQ=255) aGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGGCCGTTAcg < 1:5241902‑M1/50‑3 (MQ=255) aGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcg < 2:2667211‑M1/50‑3 (MQ=255) aGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcg < 1:377316‑M1/50‑3 (MQ=255) aGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAc > 2:2693242‑M1/1‑48 (MQ=255) aGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAc > 1:2727720‑M1/1‑48 (MQ=255) aGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAc > 2:4298689‑M1/1‑48 (MQ=255) ggAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcga < 1:3364308‑M1/50‑4 (MQ=255) ggAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAc > 1:483049‑M1/1‑47 (MQ=255) aTCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagat < 1:396634‑M1/50‑7 (MQ=255) tCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatg > 1:2856153‑M1/1‑43 (MQ=255) tCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatg < 1:3046151‑M1/50‑8 (MQ=255) cAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatg > 1:615456‑M1/1‑42 (MQ=255) aGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatgga < 1:4991860‑M1/50‑10 (MQ=255) aGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatgga > 2:3346249‑M1/1‑41 (MQ=255) aGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatgg < 1:1874043‑M1/49‑9 (MQ=255) gAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggac < 1:5101889‑M1/50‑11 (MQ=255) aaTTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacg > 2:1554820‑M1/1‑39 (MQ=255) tttCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggt < 1:78225‑M1/50‑14 (MQ=255) ttCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtc > 2:236205‑M1/1‑36 (MQ=255) tCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcc > 2:1848774‑M1/1‑35 (MQ=255) tCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtc < 2:3962744‑M1/49‑15 (MQ=255) ccAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcc < 2:4213361‑M1/49‑16 (MQ=255) cAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccc > 2:1074556‑M1/1‑33 (MQ=255) cAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccc > 1:2373280‑M1/1‑33 (MQ=255) cAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtccc < 1:4363534‑M1/49‑17 (MQ=255) aGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccct < 1:2257063‑M1/50‑19 (MQ=255) aGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccct > 2:1156583‑M1/1‑32 (MQ=255) aGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccct > 1:5064428‑M1/1‑32 (MQ=255) ggTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctc < 2:2578915‑M1/50‑20 (MQ=255) ggTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctc < 2:1987784‑M1/50‑20 (MQ=255) gTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcg > 2:3330543‑M1/1‑30 (MQ=255) gTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcg < 2:2206769‑M1/50‑21 (MQ=255) gTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcg < 1:5368011‑M1/50‑21 (MQ=255) gTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcg > 1:2707042‑M1/1‑30 (MQ=255) cAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcc > 1:4174887‑M1/1‑28 (MQ=255) cAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAAAATCATCGGTTGGGGTGTCg > 1:1360761/1‑49 (MQ=255) aGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccc > 2:4470581‑M1/1‑27 (MQ=255) aGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccc > 1:2593790‑M1/1‑27 (MQ=255) aGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccc > 2:3681604‑M1/1‑27 (MQ=255) aGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccc > 2:2386990‑M1/1‑27 (MQ=255) gACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccc < 2:162328‑M1/50‑25 (MQ=255) aCGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccccc < 2:3170934‑M1/50‑26 (MQ=255) aCGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccccc > 2:1959699‑M1/1‑25 (MQ=255) aCGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccccc > 1:2749295‑M1/1‑25 (MQ=255) aCGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccccc > 1:1286387‑M1/1‑25 (MQ=255) cGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccccct < 2:2610112‑M1/50‑27 (MQ=255) cGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccccct < 2:1267148‑M1/50‑27 (MQ=255) cGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccccct > 2:2499135‑M1/1‑24 (MQ=255) cGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccccct > 1:1125215‑M1/1‑24 (MQ=255) cGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccccct > 2:5139171‑M1/1‑24 (MQ=255) cGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccccct < 1:4291224‑M1/50‑27 (MQ=255) cGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccccct > 1:4537339‑M1/1‑24 (MQ=255) gggCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccccctt > 1:3146590‑M1/1‑23 (MQ=255) gggCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccccctt < 2:1747603‑M1/50‑28 (MQ=255) gggCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccccctt > 1:4860693‑M1/1‑23 (MQ=255) ggCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttg < 2:896657‑M1/50‑29 (MQ=255) ggCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttg < 2:2082997‑M1/50‑29 (MQ=255) ggCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttg < 2:5103575‑M1/50‑29 (MQ=255) gCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttgg < 2:2000795‑M1/50‑30 (MQ=255) gCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcacccttgg > 1:2381684‑M1/1‑21 (MQ=255) cTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggg < 2:5330460‑M1/50‑31 (MQ=255) cTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggg < 1:2042610‑M1/50‑31 (MQ=255) cTGCAAGTTGCAGACCGTTAAAATCATCGGTTGGGGTGTCGTACCACACt > 2:2634718/1‑50 (MQ=255) cTGCAAGTTGCAGACCGTTAAAATCATCGGTTGGGGTGTCGTACCACACt > 1:1185640/1‑50 (MQ=255) gCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggg > 2:4563526‑M1/1‑18 (MQ=255) cAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggag < 1:97267‑M1/50‑34 (MQ=255) cAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttgggga < 1:3500672‑M1/49‑33 (MQ=255) cAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttgggg < 1:3610228‑M1/48‑32 (MQ=255) cAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggg > 2:2357490‑M1/1‑17 (MQ=255) aaGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggaga < 2:1567863‑M1/50‑35 (MQ=255) aGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagag > 2:1282623‑M1/1‑15 (MQ=255) aGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagag < 1:3071731‑M1/50‑36 (MQ=255) aGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagag > 2:4684957‑M1/1‑15 (MQ=255) gTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagg < 1:2616831‑M1/50‑37 (MQ=255) gTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagg < 2:1096207‑M1/50‑37 (MQ=255) gTTGCAGACCGTTAAAATCATCGGTTGGGGTGTCGTACCACACTTTACCt < 1:2672503/50‑1 (MQ=255) ttGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagaggg < 1:3020577‑M1/50‑38 (MQ=255) ttGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagaggg < 2:3849442‑M1/50‑38 (MQ=255) ttGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagaggg > 2:4914388‑M1/1‑13 (MQ=255) tGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggt > 1:1556243‑M1/1‑12 (MQ=255) gCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggt > 1:994100‑M1/1‑11 (MQ=255) cAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggtt < 1:4677222‑M1/49‑40 (MQ=255) cAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggt > 1:1163044‑M1/1‑10 (MQ=255) aGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttag > 2:4897779‑M1/1‑9 (MQ=255) gACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagg < 1:906632‑M1/50‑43 (MQ=255) aCCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttaggg > 2:5050160‑M1/1‑7 (MQ=255) ccGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggt > 2:3834020‑M1/1‑6 (MQ=255) ccGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggt > 2:175063‑M1/1‑6 (MQ=255) cGTTAcgcgatggccggtcccctcgcccccttggggagagggttagggt > 2:2847607‑M1/1‑5 (MQ=255) cGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggt > 1:180016‑M1/1‑5 (MQ=255) gTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggt > 2:3204882‑M1/1‑4 (MQ=255) gTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggt > 2:5342612‑M1/1‑4 (MQ=255) ttAAAATCATCGGTTGGGGTGTCGTACCACACTTTACCTGCCGTCAGccc > 1:903256/1‑50 (MQ=255) | GAAGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAAAATCATCGGTTGGGGTGTCGTACCACACTTTACCTGCCGTCAGCCC > NC_000913/380062‑380158 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |