| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 389897 | 7 (0.060) | 151 (1.380) | 76/98 | 0.0 | 94.7% | intergenic (‑170/‑354) | hemB/yaiT | porphobilinogen synthase/putative autotransporter YaiT |
| ? | NC_000913 | 399806 = | 10 (0.090) | intergenic (+1/+23) | yaiZ/ddlA | DUF2754 domain‑containing protein YaiZ/D‑alanine‑‑D‑alanine ligase A | |||||
Only 100 of 161 total aligned reads displayed.
TTAATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATTTTTTGGAGTTTGGTTGCGCTGCTAT > NC_000913/389848‑389946 | ttAATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCtt > 2:3491538/1‑50 (MQ=255)ttAATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCtt > 2:2999276/1‑50 (MQ=255) tAATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCtt > 2:5110429/1‑49 (MQ=255) aaTAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCttt < 2:2484659/49‑1 (MQ=255) aaTAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTg > 1:1188024‑M1/1‑48 (MQ=255) aaTAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTg < 1:2356443‑M1/49‑2 (MQ=255) ttaGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaa < 1:5091588‑M1/49‑4 (MQ=255) aTAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaa > 2:2376357‑M1/1‑47 (MQ=255) aTAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaa < 2:2171559‑M1/50‑4 (MQ=255) aTAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTga < 1:1859274‑M1/49‑3 (MQ=255) tAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAAACTTgaat < 2:2365495‑M1/50‑5 (MQ=255) aGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaata > 1:2033002‑M1/1‑45 (MQ=255) gAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatat < 1:5209507‑M1/50‑7 (MQ=255) aaaCAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatat > 1:5039378‑M1/1‑43 (MQ=255) aaaCAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatat > 1:280615‑M1/1‑43 (MQ=255) aaCAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatatta > 2:2081233‑M1/1‑42 (MQ=255) aaCAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatatta > 1:693318‑M1/1‑42 (MQ=255) aaCAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatatta < 2:342524‑M1/50‑9 (MQ=255) aaCAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatatta > 2:1200143‑M1/1‑42 (MQ=255) aCAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattat > 1:1537898‑M1/1‑41 (MQ=255) aCAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattat > 1:4847674‑M1/1‑41 (MQ=255) aCAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattat > 1:1069015‑M1/1‑41 (MQ=255) aCAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattat > 2:1501202‑M1/1‑41 (MQ=255) aCAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAg < 2:2728403/50‑1 (MQ=255) aCAGCAATAATTTTAGATTCACTGAAAAGATTTTTAATCTTgaatattat < 2:260593‑M1/50‑10 (MQ=255) cAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatc < 1:2311517‑M1/50‑11 (MQ=255) cAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatc > 1:3918774‑M1/1‑40 (MQ=255) cAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatc < 2:4389941‑M1/50‑11 (MQ=255) aGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcg < 1:1044694‑M1/50‑12 (MQ=255) aGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcg > 1:1089222‑M1/1‑39 (MQ=255) aGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcg < 2:4320215‑M1/50‑12 (MQ=255) aGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcg < 1:2835114‑M1/50‑12 (MQ=255) gCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcgg > 2:1262765‑M1/1‑38 (MQ=255) gCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcgg > 1:888756‑M1/1‑38 (MQ=255) cAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcggg < 2:4623454‑M1/50‑14 (MQ=255) 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atatTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaat < 1:1996407‑M1/49‑23 (MQ=255) atatTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTtattat > 1:3202278/1‑50 (MQ=255) atTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatat > 2:4583760‑M1/1‑25 (MQ=255) ttCACTGAAAATGTTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatatta < 1:5220291‑M1/50‑27 (MQ=255) ttCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatatta < 1:2649464‑M1/50‑27 (MQ=255) ttCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatatta > 1:1680870‑M1/1‑24 (MQ=255) ttCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatatt < 1:2561559‑M1/49‑26 (MQ=255) ttCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatatt < 2:3972101‑M1/49‑26 (MQ=255) tCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatatta > 2:4986034‑M1/1‑23 (MQ=255) aCTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacat > 2:844985‑M1/1‑21 (MQ=255) aCTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattaca < 2:4517559‑M1/49‑29 (MQ=255) aCTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattaca < 1:4114255‑M1/49‑29 (MQ=255) aCTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcaggcgttaaaatattacat < 2:2103529‑M1/50‑30 (MQ=255) cTGAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacatt > 1:3019663‑M1/1‑20 (MQ=255) gAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgt > 2:1847553‑M1/1‑18 (MQ=255) gAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgt > 2:2019779‑M1/1‑18 (MQ=255) gAAAATATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgc > 2:5100222‑M1/1‑18 (MQ=255) aaaaTATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattg < 2:1746954‑M1/48‑32 (MQ=255) aaaaTATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattg < 1:4011632‑M1/48‑32 (MQ=255) aaaaTATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATTTTTTGGa < 1:3525339/48‑1 (MQ=255) aaaaTATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATTTTTTGGAGt > 1:2476766/1‑50 (MQ=255) aaaTATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtgg < 1:3197298‑M1/50‑35 (MQ=255) aaTATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggt < 1:2812114‑M1/50‑36 (MQ=255) aaTATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggt > 1:2891845‑M1/1‑15 (MQ=255) 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tttAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggttttca < 2:630902‑M1/49‑41 (MQ=255) ttAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggttttcaat > 2:2897018‑M1/1‑8 (MQ=255) ttAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggttttcaa < 1:3858244‑M1/49‑42 (MQ=255) tAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggttttcaatg > 2:3699269‑M1/1‑7 (MQ=255) tAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggttttcaatg > 2:2448197‑M1/1‑7 (MQ=255) tAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggttttcaatg > 1:5356249‑M1/1‑7 (MQ=255) tAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggttttcaat < 1:1035066‑M1/49‑43 (MQ=255) aaTCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggttttcaatgc > 1:4167787‑M1/1‑6 (MQ=255) aaTCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggttttcaatg < 2:4304923‑M1/49‑44 (MQ=255) aaTCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggtttgcaatg < 1:2867816‑M1/49‑44 (MQ=255) aTCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggttttcaatgcg > 2:1840019‑M1/1‑5 (MQ=255) aTCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggttttcaatgcg > 1:1049938‑M1/1‑5 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |