| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 389897 | 7 (0.060) | 151 (1.380) | 76/98 | 0.0 | 94.7% | intergenic (‑170/‑354) | hemB/yaiT | porphobilinogen synthase/putative autotransporter YaiT |
| ? | NC_000913 | 399806 = | 10 (0.090) | intergenic (+1/+23) | yaiZ/ddlA | DUF2754 domain‑containing protein YaiZ/D‑alanine‑‑D‑alanine ligase A | |||||
Only 100 of 168 total aligned reads displayed.
GGGTTGATTATTCGTCGTCGCGATGAAGAAACTGAAAACGCCCAATAAGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGTTATC > NC_000913/399758‑399855 | aatagaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttg > 1:1188024‑M2/49‑49 (MQ=255) atagaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGaa > 2:2376357‑M2/48‑50 (MQ=255) atagaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGa < 2:1946363‑M2/2‑1 (MQ=255) atagaaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGa < 1:1859274‑M2/2‑1 (MQ=255) ttGATTATTCGTCGTCGCGATGAAGAAACTGAAAACGCCCAATAAGAata < 1:2810011/50‑1 (MQ=255) aaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAatat > 1:5039378‑M2/44‑49 (MQ=255) aaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAatat > 2:1767254‑M2/44‑49 (MQ=255) aaacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAatat > 2:2680074‑M2/44‑49 (MQ=255) aacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAAtatta > 2:4409835‑M2/43‑50 (MQ=255) aacagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAAtatta < 2:342524‑M2/8‑1 (MQ=255) acagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAAtattat > 1:1069015‑M2/42‑50 (MQ=255) acagcaataattttagattcactgaaaagatttttaatcttGAAtattat < 2:260593‑M2/9‑1 (MQ=255) cagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATc < 1:4764480‑M2/10‑1 (MQ=255) cagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATc < 1:3007469‑M2/10‑1 (MQ=255) cagcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATc < 1:2311517‑M2/10‑1 (MQ=255) agcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCg > 2:23339‑M2/40‑50 (MQ=255) agcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCg < 1:2835114‑M2/11‑1 (MQ=255) agcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCg < 1:1044694‑M2/11‑1 (MQ=255) agcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCg > 1:1089222‑M2/40‑50 (MQ=255) ttCGTCGTCGCGATGAAGAAACTGAAAACGCCCAATAAGAATATTATCg < 1:142847/49‑1 (MQ=255) gcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCgg > 1:888756‑M2/39‑50 (MQ=255) gcaataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCgg > 2:1262765‑M2/39‑50 (MQ=255) caataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCggg < 2:4623454‑M2/13‑1 (MQ=255) aataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGc > 1:4556419‑M2/37‑50 (MQ=255) aataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGc < 1:69190‑M2/14‑1 (MQ=255) aataattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGc < 1:1571699‑M2/14‑1 (MQ=255) gtcgtcgCGATGAAGAAACTGAAAACGCCCAATAAGAATATTATCGGGc < 2:3658301/49‑1 (MQ=255) gtcgtcgCGATGAAGAAACTGAAAACGCCCAATAAGAATATTATCGGGc < 1:3315836/49‑1 (MQ=255) taattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGt > 1:2568305‑M2/35‑50 (MQ=255) aattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGt > 2:2179930‑M2/34‑49 (MQ=255) aattttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGt > 1:239494‑M2/34‑49 (MQ=255) attttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGtt > 2:2117517‑M2/33‑49 (MQ=255) attttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGtt > 1:1235494‑M2/33‑49 (MQ=255) attttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGtt > 2:1190514‑M2/33‑49 (MQ=255) ttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTaaaa > 1:5231824‑M2/30‑50 (MQ=255) ttatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTaaa < 1:4135494‑M2/20‑1 (MQ=255) tatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTaaaa > 2:701751‑M2/29‑49 (MQ=255) tatattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTaaaa < 2:2942111‑M2/21‑1 (MQ=255) atattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAata > 2:550621‑M2/28‑50 (MQ=255) atattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAat < 1:1996407‑M2/22‑1 (MQ=255) tattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAata < 1:3522353‑M2/23‑1 (MQ=255) tattcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAata < 1:5018729‑M2/23‑1 (MQ=255) attcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAatat > 1:5127620‑M2/26‑49 (MQ=255) attcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAatat > 2:4583760‑M2/26‑49 (MQ=255) ttcactgaaaatgtttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTa < 1:5220291‑M2/26‑1 (MQ=255) ttcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATAtt < 2:3972101‑M2/25‑1 (MQ=255) ttcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTa > 1:3621666‑M2/25‑50 (MQ=255) tcactgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTa > 2:4986034‑M2/24‑49 (MQ=255) actgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACa < 1:3683754‑M2/28‑1 (MQ=255) actgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACa < 1:4114255‑M2/28‑1 (MQ=255) actgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACa < 2:4517559‑M2/28‑1 (MQ=255) actgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACAt > 2:844985‑M2/22‑50 (MQ=255) actgaaaatatttttaatcttGAATATTATCAGGCGTTAAAATATTACAt < 2:2103529‑M2/29‑1 (MQ=255) ctgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACAtt > 1:4186445‑M2/21‑50 (MQ=255) ctgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACAtt > 1:204105‑M2/21‑50 (MQ=255) ctgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACAtt < 1:880547‑M2/30‑1 (MQ=255) ctgaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACAtt > 1:3019663‑M2/21‑50 (MQ=255) gaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACAttgc > 2:5100222‑M2/19‑49 (MQ=255) gaaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATtgt > 2:1847553‑M2/19‑50 (MQ=255) cTGAAAACGCCCAATAAGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATtgtg > 1:4237847/1‑50 (MQ=255) aaaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATtgt < 2:1697937‑M2/32‑1 (MQ=255) aaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTgg < 1:4005082‑M2/34‑1 (MQ=255) aaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTgg > 2:1493499‑M2/17‑50 (MQ=255) aaatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTgg < 1:3197298‑M2/34‑1 (MQ=255) aatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGt > 1:1711864‑M2/16‑50 (MQ=255) aatatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGt < 1:2812114‑M2/35‑1 (MQ=255) atatttttaatcttGCATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGtt > 1:5117679‑M2/15‑50 (MQ=255) atatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGtt > 2:4253271‑M2/15‑50 (MQ=255) tatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGttt > 1:2610625‑M2/14‑50 (MQ=255) tatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGttt > 2:449834‑M2/14‑50 (MQ=255) tatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGttt > 2:2863458‑M2/14‑50 (MQ=255) tatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGttt > 1:2622788‑M2/14‑50 (MQ=255) tatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGttt < 1:2710090‑M2/37‑1 (MQ=255) tatttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGttt > 2:2239526‑M2/14‑50 (MQ=255) atttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGtttt > 2:1327424‑M2/13‑50 (MQ=255) tttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGtttt > 2:4753379‑M2/12‑49 (MQ=255) tttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGtttt < 1:592686‑M2/38‑1 (MQ=255) tttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATAGTACATTGTGGtttt < 1:2212583‑M2/38‑1 (MQ=255) ttttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTc > 2:569591‑M2/11‑49 (MQ=255) tttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCa < 2:5139793‑M2/40‑1 (MQ=255) tttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCa < 1:1594415‑M2/40‑1 (MQ=255) ttaatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCaa < 1:3858244‑M2/41‑1 (MQ=255) taatcttGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAAt < 1:1035066‑M2/42‑1 (MQ=255) 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> 2:1653953‑M2/2‑50 (MQ=255) gAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGtt < 1:2364512/47‑1 (MQ=255) gAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGt < 1:1069284/46‑1 (MQ=255) gAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGTTa < 1:4818808/48‑1 (MQ=255) gAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGTTATc > 1:1911727/1‑50 (MQ=255) | GGGTTGATTATTCGTCGTCGCGATGAAGAAACTGAAAACGCCCAATAAGAATATTATCGGGCGTTAAAATATTACATTGTGGTTTTCAATGCGTTATC > NC_000913/399758‑399855 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |