| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 603466 | 12 (0.110) | 119 (1.130) | 65/94 | 0.0 | 92.4% | coding (1198/1248 nt) | ybdG | miniconductance mechanosensitive channel YbdG |
| ? | NC_000913 | 609352 = | 8 (0.080) | intergenic (+175/+107) | insL‑2/entD | IS186/IS421 transposase/phosphopantetheinyl transferase EntD | |||||
Only 100 of 137 total aligned reads displayed.
ACTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGACTGATGAAGTCGCAGACCAAACTCTTCGACAATCGCAAATATGTGATCG > NC_000913/603418‑603515 | aCTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAg > 2:3076302‑M1/1‑49 (MQ=255)aCTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAg > 2:2242552‑M1/1‑49 (MQ=255)aCTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAg > 2:4356755‑M1/1‑49 (MQ=255)aCTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGA < 1:2097051‑M1/49‑1 (MQ=255) cTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGACt > 2:745496/1‑50 (MQ=255) gCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaa > 2:704417‑M1/1‑46 (MQ=255) cTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaat > 1:2415481‑M1/1‑45 (MQ=255) cTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaat > 1:2154157‑M1/1‑45 (MQ=255) cTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaat < 1:3314283‑M1/50‑6 (MQ=255) cTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaat > 1:154581‑M1/1‑45 (MQ=255) cTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaa < 2:4237102‑M1/49‑5 (MQ=255) ttAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatc > 1:3864240‑M1/1‑44 (MQ=255) ttAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatc > 1:4384990‑M1/1‑44 (MQ=255) ttAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatc > 1:46675‑M1/1‑44 (MQ=255) tAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatcc > 1:2374574‑M1/1‑43 (MQ=255) aaaTGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccc > 1:3713244‑M1/1‑42 (MQ=255) aaaTGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccc > 1:2445108‑M1/1‑42 (MQ=255) aaaTGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatcc < 2:3764422‑M1/49‑8 (MQ=255) aaaTGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGACtgatg < 2:2566545/48‑1 (MQ=255) aTGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccg > 1:1491761‑M1/1‑40 (MQ=255) aTGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccg > 2:1711326‑M1/1‑40 (MQ=255) cccccgcCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcat < 2:4495784‑M1/48‑14 (MQ=255) cACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcat < 2:3984314‑M1/50‑14 (MQ=255) ccccgCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcata < 2:1581502‑M1/49‑15 (MQ=255) aCCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcata < 1:838562‑M1/50‑15 (MQ=255) aCCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcata > 1:2996364‑M1/1‑36 (MQ=255) aCCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcata > 1:1376623‑M1/1‑36 (MQ=255) aCCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcata > 2:2495095‑M1/1‑36 (MQ=255) cccGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatat < 1:3987315‑M1/50‑16 (MQ=255) cccGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatat > 2:4345629‑M1/1‑35 (MQ=255) ccGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatc < 2:1311117‑M1/50‑17 (MQ=255) ccGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGACTGATGAAGTCGCAGa < 2:4388480/50‑1 (MQ=255) cGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatcc > 1:842810‑M1/1‑33 (MQ=255) cGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatcc > 1:3685117‑M1/1‑33 (MQ=255) cGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatcc > 2:181733‑M1/1‑33 (MQ=255) cGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatcc < 2:3909445‑M1/50‑18 (MQ=255) cGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatcc < 2:4059469‑M1/50‑18 (MQ=255) gCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccg < 1:362588‑M1/50‑19 (MQ=255) gCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccg > 2:2905093‑M1/1‑32 (MQ=255) gCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccg < 2:309814‑M1/50‑19 (MQ=255) gCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccg > 1:304342‑M1/1‑32 (MQ=255) ccAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccgg < 2:4910550‑M1/50‑20 (MQ=255) ccAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccgg < 2:709704‑M1/50‑20 (MQ=255) ccAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccgg < 2:5284329‑M1/50‑20 (MQ=255) cAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggt > 2:4479543‑M1/1‑30 (MQ=255) cAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggt > 1:575848‑M1/1‑30 (MQ=255) cAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggt > 1:1956338‑M1/1‑30 (MQ=255) agagagCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggtt < 2:434016‑M1/50‑22 (MQ=255) agagagCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggtt < 2:1357778‑M1/50‑22 (MQ=255) agagagCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggtt < 1:2373265‑M1/50‑22 (MQ=255) agagagCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggtt > 1:326305‑M1/1‑29 (MQ=255) agagagCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggtt > 1:1539684‑M1/1‑29 (MQ=255) agagagCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatcaggct > 2:2526039‑M1/1‑29 (MQ=255) agagagCGAATATCAGTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggtt < 2:759649‑M1/50‑22 (MQ=255) gagagCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttg > 2:2701969‑M1/1‑28 (MQ=255) agagCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgt > 2:2139307‑M1/1‑27 (MQ=255) agagCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgt > 1:858286‑M1/1‑27 (MQ=255) gagCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtc < 1:1593918‑M1/50‑25 (MQ=255) gCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcag < 2:4563808‑M1/50‑27 (MQ=255) cGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcagg > 1:1824925‑M1/1‑23 (MQ=255) gAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggt < 2:719515‑M1/50‑29 (MQ=255) gAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggt > 2:1606047‑M1/1‑22 (MQ=255) gAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggt < 1:5072290‑M1/50‑29 (MQ=255) aaTATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtc < 2:1476118‑M1/50‑30 (MQ=255) aaTATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggt > 2:5064990‑M1/1‑21 (MQ=255) atatCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggt > 1:3263548‑M1/1‑20 (MQ=255) atatCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggt > 2:34035‑M1/1‑20 (MQ=255) tatCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcag < 1:2735746‑M1/50‑32 (MQ=255) tatCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcag > 1:4090342‑M1/1‑19 (MQ=255) tatCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcag < 1:2900153‑M1/50‑32 (MQ=255) atCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcag > 2:3021894‑M1/1‑18 (MQ=255) atCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcag > 1:4631906‑M1/1‑18 (MQ=255) tCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcagga < 2:659783‑M1/50‑34 (MQ=255) tCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcagga < 2:923763‑M1/50‑34 (MQ=255) tCATTGCCGGTTGGCGACTGATGAAGTCGCAGACCAAACTCTTCGACAAt < 1:1081745/50‑1 (MQ=255) cATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggat > 2:2069170‑M1/1‑16 (MQ=255) cATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggat > 1:1386655‑M1/1‑16 (MQ=255) aTTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatg > 2:2777100‑M1/1‑15 (MQ=255) aTTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatg < 1:702012‑M1/50‑36 (MQ=255) ttGCCGGTTGGCGACTGATGAAGTCGCAGACCAAACTCTTCGACAATCGc < 1:37437/50‑1 (MQ=255) gCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggt > 2:2252661‑M1/1‑12 (MQ=255) ccGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggta < 2:3400349‑M1/49‑39 (MQ=255) ccGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggta < 1:1062601‑M1/49‑39 (MQ=255) ccGGTTGGCGACTGATGAAGTCGCAGACCAAACTCTTCGACAATCGCaaa < 1:1017767/50‑1 (MQ=255) cGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaag < 2:754787‑M1/50‑41 (MQ=255) ggTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaagg > 1:2334923‑M1/1‑9 (MQ=255) ggTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaagg > 2:4229624‑M1/1‑9 (MQ=255) gTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaaggc < 1:5048616‑M1/50‑43 (MQ=255) gTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaaggc < 1:527815‑M1/50‑43 (MQ=255) gTTGGCGACTGATGAAGTCGCAGACCAAACTCTTCGACAATCGCAAatat > 1:2779186/1‑50 (MQ=255) ttGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaaggca < 1:3535274‑M1/50‑44 (MQ=255) ggCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaaggcac < 1:4196799‑M1/49‑45 (MQ=255) ggCGACTGATGAAGTCGCAGACCAAACTCTTCGACAATCGCAAATAtgt < 1:4666230/49‑1 (MQ=255) gCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaaggcacct > 1:1431775‑M1/1‑4 (MQ=255) gCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaaggcacct < 2:3254254‑M1/50‑47 (MQ=255) gCGAgtaatccccgcatagccggttgtcaggtcaggatggtaaggcacct < 2:603728‑M1/50‑47 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |