| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 603466 | 12 (0.110) | 119 (1.130) | 65/94 | 0.0 | 92.4% | coding (1198/1248 nt) | ybdG | miniconductance mechanosensitive channel YbdG |
| ? | NC_000913 | 609352 = | 8 (0.080) | intergenic (+175/+107) | insL‑2/entD | IS186/IS421 transposase/phosphopantetheinyl transferase EntD | |||||
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
GGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTT > NC_000913/609303‑609401 | actgcttaaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgag > 2:2242552‑M2/50‑50 (MQ=255)actgcttaaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgag > 2:3076302‑M2/50‑50 (MQ=255) ctgcttaaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgag < 1:155353‑M2/1‑1 (MQ=255) tgcttaaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGt > 2:2079798‑M2/48‑49 (MQ=255) cttaaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAAt < 1:3314283‑M2/5‑1 (MQ=255) cttaaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAAt > 1:2415481‑M2/46‑50 (MQ=255) cttaaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAAt > 1:2154157‑M2/46‑50 (MQ=255) ttaaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATc > 1:46675‑M2/45‑50 (MQ=255) ttaaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATc > 1:3864240‑M2/45‑50 (MQ=255) taaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATcc > 1:2374574‑M2/44‑50 (MQ=255) cATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATccc > 1:688243/1‑50 (MQ=255) aaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATccc > 1:2445108‑M2/43‑50 (MQ=255) aaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATcc < 2:3764422‑M2/7‑1 (MQ=255) aaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATc < 2:2457023‑M2/6‑1 (MQ=255) aatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATcccc > 1:348839‑M2/42‑50 (MQ=255) aatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATcccc < 2:4850452‑M2/9‑1 (MQ=255) atgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCg > 1:1491761‑M2/41‑50 (MQ=255) atgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCg > 2:1711326‑M2/41‑50 (MQ=255) ttcAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCa > 2:4541603/1‑49 (MQ=255) acccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCata > 2:3718258‑M2/37‑50 (MQ=255) acccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCata < 1:838562‑M2/14‑1 (MQ=255) acccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCata > 1:2996364‑M2/37‑50 (MQ=255) acccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCata > 1:1357058‑M2/37‑50 (MQ=255) acccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCata > 1:1376623‑M2/37‑50 (MQ=255) cccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCatat < 1:3136227‑M2/15‑1 (MQ=255) cccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCatat > 2:4345629‑M2/36‑50 (MQ=255) cccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCatat < 1:3987315‑M2/15‑1 (MQ=255) ccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATc < 2:1311117‑M2/16‑1 (MQ=255) cgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATcc < 2:3909445‑M2/17‑1 (MQ=255) cgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATcc < 2:4059469‑M2/17‑1 (MQ=255) cgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATcc > 1:842810‑M2/34‑50 (MQ=255) cgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATcc > 1:3685117‑M2/34‑50 (MQ=255) gccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCg > 1:304342‑M2/33‑50 (MQ=255) gccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCg > 2:2726852‑M2/33‑50 (MQ=255) gccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCg > 2:2905093‑M2/33‑50 (MQ=255) gccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCg < 2:309814‑M2/18‑1 (MQ=255) gccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCg < 1:362588‑M2/18‑1 (MQ=255) tGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCgg < 1:2367963/50‑1 (MQ=255) ccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCcga > 2:4484811‑M2/32‑49 (MQ=255) ccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCgg < 2:4910550‑M2/19‑1 (MQ=255) ccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCgg < 2:709704‑M2/19‑1 (MQ=255) cagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGt > 2:4479543‑M2/31‑50 (MQ=255) cagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGt > 1:1956338‑M2/31‑50 (MQ=255) cagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGt > 1:575848‑M2/31‑50 (MQ=255) agagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATcaggct > 2:2526039‑M2/30‑48 (MQ=255) agagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGtt < 2:434016‑M2/21‑1 (MQ=255) agagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGtt < 2:1357778‑M2/21‑1 (MQ=255) agagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGtt > 1:3761264‑M2/30‑50 (MQ=255) agagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGtt < 1:2373265‑M2/21‑1 (MQ=255) agagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGtt > 1:1539684‑M2/30‑50 (MQ=255) gagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTg > 2:817066‑M2/29‑50 (MQ=255) agagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgt > 1:858286‑M2/28‑50 (MQ=255) agagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgt > 2:2139307‑M2/28‑50 (MQ=255) gagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtc < 1:1593918‑M2/24‑1 (MQ=255) gagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtc < 1:3639755‑M2/24‑1 (MQ=255) agcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtca < 1:4134594‑M2/25‑1 (MQ=255) gcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcag < 2:4563808‑M2/26‑1 (MQ=255) cgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcagg < 2:1728873‑M2/27‑1 (MQ=255) cgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcagg > 1:1824925‑M2/24‑50 (MQ=255) cgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcagg > 2:302403‑M2/24‑50 (MQ=255) gaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggt < 1:5072290‑M2/28‑1 (MQ=255) gaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggt > 2:579283‑M2/23‑50 (MQ=255) gaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggt > 2:1606047‑M2/23‑50 (MQ=255) gaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggt < 2:719515‑M2/28‑1 (MQ=255) aatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggtc < 2:1476118‑M2/29‑1 (MQ=255) aatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggt > 2:5064990‑M2/22‑49 (MQ=255) atatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggt > 1:3263548‑M2/21‑48 (MQ=255) tatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggtcag < 1:2900153‑M2/31‑1 (MQ=255) atcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggtcag > 1:4631906‑M2/19‑49 (MQ=255) tcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGa < 2:923763‑M2/33‑1 (MQ=255) tcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGa < 1:14519‑M2/33‑1 (MQ=255) tcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGa < 1:4624818‑M2/33‑1 (MQ=255) tcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGa < 2:659783‑M2/33‑1 (MQ=255) cattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGAt > 2:2069170‑M2/17‑50 (MQ=255) cattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGAt > 1:1386655‑M2/17‑50 (MQ=255) attgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGAt < 1:272236‑M2/34‑1 (MQ=255) attgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATg > 2:2777100‑M2/16‑50 (MQ=255) attgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATg < 1:702012‑M2/35‑1 (MQ=255) attgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATg > 2:4358061‑M2/16‑50 (MQ=255) gccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGt > 2:2252661‑M2/13‑49 (MQ=255) ccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTa < 1:1062601‑M2/38‑1 (MQ=255) ccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTa < 2:3400349‑M2/38‑1 (MQ=255) gcTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAg < 1:4283317/50‑1 (MQ=255) cggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAg < 2:754787‑M2/40‑1 (MQ=255) ggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAgg > 2:4229624‑M2/10‑50 (MQ=255) gttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGc < 1:527815‑M2/42‑1 (MQ=255) gttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGc < 1:5048616‑M2/42‑1 (MQ=255) ttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCa > 2:3333330‑M2/8‑50 (MQ=255) tggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCAc > 1:2945970‑M2/7‑50 (MQ=255) tGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCAcc > 2:4000516/1‑50 (MQ=255) ggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCAc < 1:4196799‑M2/44‑1 (MQ=255) gggAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCt > 2:4505000/1‑50 (MQ=255) gcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCt < 2:4329146‑M2/46‑1 (MQ=255) gcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCt < 2:3254254‑M2/46‑1 (MQ=255) gcgaGTAATCCCCGCATAGCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCt < 2:603728‑M2/46‑1 (MQ=255) cgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTg > 1:2161596‑M2/4‑50 (MQ=255) gaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGc < 1:3132735‑M2/48‑1 (MQ=255) gaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGc > 2:910488‑M2/3‑50 (MQ=255) gaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGc > 2:25330‑M2/3‑50 (MQ=255) aGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCt < 2:249788‑M2/49‑1 (MQ=255) | GGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTT > NC_000913/609303‑609401 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |