| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 1,299,499 | Δ1,199 bp | insH21 | insH21 | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 1299499 | 1300697 | 1199 | 112 [0] | [0] 113 | insH21 | insH21 |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1299498 | 0 (0.000) | 106 (0.760) | 61/90 | 0.0 | 100% | intergenic (+253/‑33) | ychE/insH21 | putative inner membrane protein/IS5 transposase and trans‑activator |
| ? | NC_000913 | 1300698 = | 0 (0.000) | intergenic (+151/‑484) | insH21/oppA | IS5 transposase and trans‑activator/oligopeptide ABC transporter periplasmic binding protein | |||||
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
GACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAAT > NC_000913/1300649‑1300747 | ttgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaa < 1:2559142‑M2/1‑1 (MQ=255)ttgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaa < 2:1269055‑M2/1‑1 (MQ=255)ttgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaa > 2:5691464‑M2/50‑50 (MQ=255)ttgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaa > 2:2955183‑M2/50‑50 (MQ=255)ttgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaa < 1:350631‑M2/1‑1 (MQ=255) tgaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaa > 1:412090‑M2/49‑49 (MQ=255) gaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaat < 2:21027‑M2/2‑1 (MQ=255) gaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaat < 1:2766484‑M2/2‑1 (MQ=255) gaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaat > 2:2489135‑M2/48‑49 (MQ=255) gaaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaat > 2:3080196‑M2/48‑49 (MQ=255) aaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataa < 1:4004655‑M2/4‑1 (MQ=255) aaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataa < 1:2444905‑M2/4‑1 (MQ=255) aaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataa < 2:1553092‑M2/4‑1 (MQ=255) aaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaata < 2:4861037‑M2/3‑1 (MQ=255) aaatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaata < 2:1088247‑M2/3‑1 (MQ=255) aatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataat < 1:1282887‑M2/5‑1 (MQ=255) aatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataa > 2:4643896‑M2/46‑49 (MQ=255) aatgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataa > 2:1818195‑M2/46‑49 (MQ=255) atgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataata < 1:1818802‑M2/6‑1 (MQ=255) atgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataata < 1:1668764‑M2/6‑1 (MQ=255) atgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataat > 1:4138366‑M2/45‑49 (MQ=255) tgatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataa > 1:450256‑M2/44‑50 (MQ=255) gatattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataat > 2:5310384‑M2/43‑50 (MQ=255) ttattattaattccactgcctatggtagaggaaagtgctaaataataat > 2:845927‑M2/42‑49 (MQ=255) atattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataat > 1:2192849‑M2/42‑49 (MQ=255) atattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataat > 2:2872295‑M2/42‑49 (MQ=255) atattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATc < 1:2852234‑M2/9‑1 (MQ=255) tattattaattccactgcctttggtagaggaaggtgctaaATAATAATc > 1:1517552‑M2/41‑49 (MQ=255) tattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCa < 2:111543‑M2/10‑1 (MQ=255) attattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCaa > 1:853737‑M2/40‑50 (MQ=255) attaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTg > 2:4547548‑M2/37‑50 (MQ=255) ttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTg < 2:4114055‑M2/14‑1 (MQ=255) ttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTg < 2:3229575‑M2/14‑1 (MQ=255) ttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGt < 2:5053022‑M2/15‑1 (MQ=255) taattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGt > 1:3824691‑M2/35‑49 (MQ=255) taattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGt > 1:1119818‑M2/35‑49 (MQ=255) aattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGtt < 2:624304‑M2/16‑1 (MQ=255) aattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGtt < 2:5043070‑M2/16‑1 (MQ=255) ttccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTaaa < 1:1657246‑M2/19‑1 (MQ=255) ttccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTaaa > 1:3510763‑M2/32‑50 (MQ=255) ttccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTaaa > 1:5012621‑M2/32‑50 (MQ=255) ccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAat > 2:2903011‑M2/30‑49 (MQ=255) ccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAat > 2:418803‑M2/30‑49 (MQ=255) ccactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAat < 1:788366‑M2/20‑1 (MQ=255) cactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAatta > 1:2206566‑M2/29‑50 (MQ=255) cactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAatta < 1:5826726‑M2/22‑1 (MQ=255) cactgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAatta < 1:598269‑M2/22‑1 (MQ=255) actgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAattat < 2:4743776‑M2/23‑1 (MQ=255) actgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAattat < 1:4047400‑M2/23‑1 (MQ=255) ctgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAattatt < 1:2091805‑M2/24‑1 (MQ=255) ctgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAattatt < 2:3776124‑M2/24‑1 (MQ=255) tgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATtg > 1:3123127‑M2/26‑50 (MQ=255) cctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATtgtg > 1:678297‑M2/24‑50 (MQ=255) cctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATtgtg < 1:5565178‑M2/27‑1 (MQ=255) cctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATtgtg < 2:2823585‑M2/27‑1 (MQ=255) cctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATtgtg > 1:897319‑M2/24‑50 (MQ=255) cctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATtgtg < 2:2930367‑M2/27‑1 (MQ=255) cctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATtgt < 1:5340520‑M2/26‑1 (MQ=255) cctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATtg < 2:888656‑M2/25‑1 (MQ=255) ctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATtgtg > 1:2908840‑M2/23‑49 (MQ=255) ctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGc < 1:1044254‑M2/28‑1 (MQ=255) tttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCa > 1:3661080‑M2/22‑50 (MQ=255) tggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCa < 2:2981231‑M2/29‑1 (MQ=255) tggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCa < 2:2489399‑M2/29‑1 (MQ=255) tggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAt < 1:1104086‑M2/30‑1 (MQ=255) gtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAttt < 1:2349357‑M2/32‑1 (MQ=255) gtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAttt < 2:1764457‑M2/32‑1 (MQ=255) gtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc < 1:5529849‑M2/33‑1 (MQ=255) gtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc < 1:2763569‑M2/33‑1 (MQ=255) gtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTc < 1:974372‑M2/33‑1 (MQ=255) tagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCa > 2:4775280‑M2/17‑50 (MQ=255) tagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCa > 1:3356244‑M2/17‑50 (MQ=255) tagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCa < 1:373328‑M2/34‑1 (MQ=255) gaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCac > 2:4669832‑M2/15‑49 (MQ=255) gaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCactact > 2:5380621‑M2/12‑50 (MQ=255) gaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCactact < 2:5558308‑M2/39‑1 (MQ=255) gaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCactact > 2:3943767‑M2/12‑50 (MQ=255) aaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTg < 2:4416788‑M2/40‑1 (MQ=255) aaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTg > 2:4652493‑M2/11‑50 (MQ=255) aagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTgg < 1:3839022‑M2/41‑1 (MQ=255) aagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTg > 1:4637028‑M2/10‑49 (MQ=255) aagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTg > 1:847958‑M2/10‑49 (MQ=255) agtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTgg > 2:4715684‑M2/9‑49 (MQ=255) agtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGa < 2:355885‑M2/42‑1 (MQ=255) agtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGa < 1:3157756‑M2/42‑1 (MQ=255) gtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGaa < 1:4112577‑M2/43‑1 (MQ=255) gtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGaa < 1:4262466‑M2/43‑1 (MQ=255) gtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGaa < 2:5808310‑M2/43‑1 (MQ=255) tgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAAc > 2:685983‑M2/7‑50 (MQ=255) tgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAAc > 2:486662‑M2/7‑50 (MQ=255) tgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAAc > 1:5412888‑M2/7‑50 (MQ=255) tgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAAc > 1:1479291‑M2/7‑50 (MQ=255) tgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAAc > 1:1188982‑M2/7‑50 (MQ=255) gctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACt > 1:5732464‑M2/6‑50 (MQ=255) aATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGt < 2:4621194‑M2/47‑1 (MQ=255) aATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTaa > 1:1037596‑M2/2‑50 (MQ=255) aATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTa < 1:4070258‑M2/48‑1 (MQ=255) ataataatCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAAt < 2:4876476/50‑1 (MQ=255) ataataatCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAAt < 1:3770196/50‑1 (MQ=255) ataataatCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAAt < 1:4324620/50‑1 (MQ=255) | GACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCACTACTGGAACTGTAAT > NC_000913/1300649‑1300747 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |