| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 389,898 | Δ9,908 bp | yaiT–[yaiZ] | yaiT, insF‑2, insE‑2, yaiT, iprA, ampH, sbmA, yaiW, yaiY, [yaiZ] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 389898 | 399805 | 9908 | 131 [0] | [0] 134 | yaiT–[yaiZ] | yaiT,insF‑2,insE‑2,yaiT,iprA,ampH,sbmA,yaiW,yaiY,[yaiZ] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 389897 | 0 (0.000) | 128 (1.360) | 68/98 | 0.0 | 100% | intergenic (‑170/‑354) | hemB/yaiT | porphobilinogen synthase/putative autotransporter YaiT |
| ? | NC_000913 | 399806 = | 0 (0.000) | intergenic (+1/+23) | yaiZ/ddlA | DUF2754 domain‑containing protein YaiZ/D‑alanine‑‑D‑alanine ligase A | |||||
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
TAATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTTATTTATAGCTGTTGGTTATTATTTTTTGGAGTTTGGTTGCGCTGCTA > NC_000913/389849‑389945 | tAATAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCtt < 1:6076303/49‑1 (MQ=255) aTAGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaa < 1:1230845‑M1/50‑4 (MQ=255) aGAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaata > 1:4126809‑M1/1‑45 (MQ=255) gAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatat > 1:54539‑M1/1‑44 (MQ=255) gAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaata < 1:108817‑M1/49‑6 (MQ=255) gAAACAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTGgaata < 1:4932033‑M1/49‑6 (MQ=255) aaaCAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatatt < 1:3615346‑M1/50‑8 (MQ=255) aaaCAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatat > 1:4987281‑M1/1‑43 (MQ=255) aaaCAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatat > 1:4452226‑M1/1‑43 (MQ=255) aaaCAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatat > 1:4059448‑M1/1‑43 (MQ=255) aaCAGCAATAATTTTATATTCACTGAAAATATTTTTAATCTTgaatatta < 1:4209647‑M1/50‑9 (MQ=255) 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aaaaTATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtg < 1:4645945‑M1/50‑34 (MQ=255) aaaaTATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtg > 1:2050147‑M1/1‑17 (MQ=255) aaaaTATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgt < 1:5655659‑M1/49‑33 (MQ=255) aaaaTATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgt < 1:1677812‑M1/49‑33 (MQ=255) aaaaTATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgt < 1:326860‑M1/49‑33 (MQ=255) aaaaTATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattg < 1:4600373‑M1/48‑32 (MQ=255) aaaaTATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattg < 1:4128622‑M1/48‑32 (MQ=255) aaaTATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtgg > 1:229721‑M1/1‑16 (MQ=255) aaaTATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtgg < 1:3762188‑M1/50‑35 (MQ=255) aaaTATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtgg < 1:6350577‑M1/50‑35 (MQ=255) aaTATTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggt > 1:1162781‑M1/1‑15 (MQ=255) atatTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggtt < 1:6515998‑M1/50‑37 (MQ=255) atatTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggtt < 1:2894707‑M1/50‑37 (MQ=255) tatTTTTAATCTTgaatattatctggcgttaaaatattacattgtggttt < 1:6287853‑M1/50‑38 (MQ=255) tatTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggttt < 1:6803071‑M1/50‑38 (MQ=255) atTTTTAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggtttt > 1:4266486‑M1/1‑12 (MQ=255) tttttAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggtttt < 1:1854864‑M1/49‑39 (MQ=255) tttttAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggtttt < 1:4184753‑M1/49‑39 (MQ=255) tttttAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggtttt < 1:780711‑M1/49‑39 (MQ=255) ttttAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggttttc > 1:3217639‑M1/1‑10 (MQ=255) tttAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggttttcaa > 1:704855‑M1/1‑9 (MQ=255) tttAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggttttcaa > 1:5636082‑M1/1‑9 (MQ=255) ttAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggttttcaat > 1:1866246‑M1/1‑8 (MQ=255) ttAATCTTgaatattatcgggcgttaaaatattacattgtggttttcaat > 1:1049810‑M1/1‑8 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |