New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 380111 | 0 (0.000) | 74 (0.640) +CGAGATGGACG |
46/76 | 0.1 | 53.8% | coding (732/774 nt) | yaiO | outer membrane protein YaiO |
? | NC_000913 | 624576 = | 165 (1.110) | intergenic (‑66/‑309) | fepB/entC | ferric enterobactin ABC transporter periplasmic binding protein/isochorismate synthase EntC |
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
GAAGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAAAATCATCGGTTGGGGTGTCGTACCACACTTTACCTGCCGTCAGCCCGA > NC_000913/380062‑380160 | gAAGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTa > 1:4651011/1‑50 (MQ=255) gAAGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTa > 2:141599/1‑50 (MQ=255) aaGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAc < 1:1530020‑M1/50‑2 (MQ=255) aaGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAc > 2:196279‑M1/1‑49 (MQ=255) aaGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAc < 1:5291976‑M1/50‑2 (MQ=255) aaGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAc > 2:2613892‑M1/1‑49 (MQ=255) aaGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAc < 2:3031251‑M1/50‑2 (MQ=255) aaGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAc > 2:652177‑M1/1‑49 (MQ=255) aGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcg < 2:5621040‑M1/50‑3 (MQ=255) aGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAc > 2:4769161‑M1/1‑48 (MQ=255) ggAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAc > 2:761130‑M1/1‑47 (MQ=255) gAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAc > 1:5057965‑M1/1‑46 (MQ=255) aaTCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgaga < 2:5565702‑M1/50‑6 (MQ=255) aaTCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAc > 2:3546405‑M1/1‑45 (MQ=255) aaTCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAc > 2:5121136‑M1/1‑45 (MQ=255) aTCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagat < 2:670620‑M1/50‑7 (MQ=255) tCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatg < 1:2452160‑M1/50‑8 (MQ=255) tCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatg < 2:1563397‑M1/50‑8 (MQ=255) tCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatg < 2:3334389‑M1/50‑8 (MQ=255) tCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatg < 1:4700438‑M1/50‑8 (MQ=255) aGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatgga > 2:5544262‑M1/1‑41 (MQ=255) aGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatgga > 2:3949041‑M1/1‑41 (MQ=255) gAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggac > 1:2942360‑M1/1‑40 (MQ=255) gAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggac < 1:3774936‑M1/50‑11 (MQ=255) gAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggac < 1:5602527‑M1/50‑11 (MQ=255) aaTTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacg > 1:4676902‑M1/1‑39 (MQ=255) aaTTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacg < 1:4280108‑M1/50‑12 (MQ=255) aaTTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacg > 2:2361575‑M1/1‑39 (MQ=255) aTTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacgg > 2:2791622‑M1/1‑38 (MQ=255) aTTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacgg > 2:515224‑M1/1‑38 (MQ=255) tttCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggt < 2:1895588‑M1/50‑14 (MQ=255) tttCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggt > 1:2588533‑M1/1‑37 (MQ=255) ttCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtc > 2:2333344‑M1/1‑36 (MQ=255) tCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcc > 2:681575‑M1/1‑35 (MQ=255) tCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcc > 2:2615932‑M1/1‑35 (MQ=255) tCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtc < 2:383549‑M1/49‑15 (MQ=255) ccAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtccc > 1:2599277‑M1/1‑34 (MQ=255) ccAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcc < 1:2089122‑M1/49‑16 (MQ=255) ccAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcc < 2:1237207‑M1/49‑16 (MQ=255) cAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccc < 2:1611854‑M1/50‑18 (MQ=255) cAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccc > 2:617112‑M1/1‑33 (MQ=255) aGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccct < 2:4986289‑M1/50‑19 (MQ=255) aGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccct > 2:3914355‑M1/1‑32 (MQ=255) aGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccct > 1:1141734‑M1/1‑32 (MQ=255) aGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccct < 1:3375584‑M1/50‑19 (MQ=255) aGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccct < 2:2933293‑M1/50‑19 (MQ=255) ggTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctc < 1:3077925‑M1/50‑20 (MQ=255) ggTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctc < 1:2200529‑M1/50‑20 (MQ=255) ggTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctc > 2:661371‑M1/1‑31 (MQ=255) ggTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctc < 1:4122084‑M1/50‑20 (MQ=255) ggTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctc > 1:4398069‑M1/1‑31 (MQ=255) ggTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctc < 2:4486522‑M1/50‑20 (MQ=255) gTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcg < 2:2831155‑M1/50‑21 (MQ=255) gTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcg > 1:3555280‑M1/1‑30 (MQ=255) tCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgc > 1:5400743‑M1/1‑29 (MQ=255) cAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcc > 2:4217099‑M1/1‑28 (MQ=255) aGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccc > 2:811015‑M1/1‑27 (MQ=255) aGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccc > 1:704284‑M1/1‑27 (MQ=255) gACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccc < 2:2743206‑M1/50‑25 (MQ=255) cGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccccct < 2:3777431‑M1/50‑27 (MQ=255) gggCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccccctt < 1:4562689‑M1/50‑28 (MQ=255) gggCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgccccctt > 2:4977580‑M1/1‑23 (MQ=255) gCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttgg < 1:747597‑M1/50‑30 (MQ=255) gCTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttgg > 2:2826677‑M1/1‑21 (MQ=255) cTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggg > 2:1831108‑M1/1‑20 (MQ=255) cTGCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggg < 2:142807‑M1/50‑31 (MQ=255) gCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggg > 1:1757626‑M1/1‑18 (MQ=255) gCAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggg > 1:4690631‑M1/1‑18 (MQ=255) cAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggag < 2:3286604‑M1/50‑34 (MQ=255) cAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggag < 2:5121141‑M1/50‑34 (MQ=255) cAAGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggg > 1:1597928‑M1/1‑17 (MQ=255) aaGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggaga < 2:320483‑M1/50‑35 (MQ=255) aaGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggaga < 2:1195252‑M1/50‑35 (MQ=255) aaGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttgggga > 1:4722551‑M1/1‑16 (MQ=255) aGTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagag < 1:2386790‑M1/50‑36 (MQ=255) gTTGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagg < 1:3925886‑M1/50‑37 (MQ=255) ttGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagaggg > 1:4729182‑M1/1‑13 (MQ=255) ttGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagaggg > 1:838768‑M1/1‑13 (MQ=255) tGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggt > 2:3025267‑M1/1‑12 (MQ=255) tGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggt > 2:1124254‑M1/1‑12 (MQ=255) tGCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggt > 1:2740110‑M1/1‑12 (MQ=255) gCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggt < 2:201424‑M1/49‑39 (MQ=255) gCAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggt < 1:51188‑M1/49‑39 (MQ=255) cAGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggtt < 1:5610552‑M1/49‑40 (MQ=255) aGACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttag > 1:4586456‑M1/1‑9 (MQ=255) gACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagg < 2:2246186‑M1/50‑43 (MQ=255) gACCGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagg < 2:2555896‑M1/50‑43 (MQ=255) ccGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggt < 1:496958‑M1/50‑45 (MQ=255) ccGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggt < 1:3509136‑M1/50‑45 (MQ=255) cGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggtg < 1:5323668‑M1/50‑46 (MQ=255) cGTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggt > 2:2813199‑M1/1‑5 (MQ=255) gTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggtga < 2:1162179‑M1/50‑47 (MQ=255) gTTAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggt > 1:1407834‑M1/1‑4 (MQ=255) ttAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggtgag > 2:4255274‑M1/1‑3 (MQ=255) ttAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggtgag < 1:3011292‑M1/50‑48 (MQ=255) ttAcgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggtgag > 1:1792083‑M1/1‑3 (MQ=255) acgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggtgaggg > 1:1156703‑M1/1‑1 (MQ=255) acgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggtgagg < 2:2567178‑M1/49‑49 (MQ=255) acgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggtgagg < 2:5256881‑M1/49‑49 (MQ=255) acgagatggacggtcccctcgcccccttggggagagggttagggtgagg < 2:4846974‑M1/49‑49 (MQ=255) | GAAGGAATCAGAATTTCCAGGTCAGACGGGCTGCAAGTTGCAGACCGTTAAAATCATCGGTTGGGGTGTCGTACCACACTTTACCTGCCGTCAGCCCGA > NC_000913/380062‑380160 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |