| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 603,467 | Δ5,885 bp | [ybdG]–insL‑2 | [ybdG], nfsB, ybdF, ybdJ, ybdK, sokE, hokE, insL‑2 | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 603467 | 609351 | 5885 | 143 [0] | [0] 145 | [ybdG]–insL‑2 | [ybdG],nfsB,ybdF,ybdJ,ybdK,sokE,hokE,insL‑2 |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 603466 | 0 (0.000) | 135 (0.940) | 69/94 | 0.0 | 100% | coding (1198/1248 nt) | ybdG | miniconductance mechanosensitive channel YbdG |
| ? | NC_000913 | 609352 = | 0 (0.000) | intergenic (+175/+107) | insL‑2/entD | IS186/IS421 transposase/phosphopantetheinyl transferase EntD | |||||
Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
ACTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGACTGATGAAGTCGCAGACCAAACTCTTCGACAATCGCAAATATGTGATCG > NC_000913/603418‑603515 | aCTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAg > 2:4186639‑M1/1‑49 (MQ=255) cTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgt < 1:1254783‑M1/50‑3 (MQ=255) cTGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAg > 1:5410979‑M1/1‑48 (MQ=255) tGCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgt > 1:5252547‑M1/1‑47 (MQ=255) gCTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaa > 1:1825562‑M1/1‑46 (MQ=255) cTTAAATGCACCCTCCAGATAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaat > 2:5151124‑M1/1‑45 (MQ=255) cTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaat > 2:2141186‑M1/1‑45 (MQ=255) cTTAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaa < 1:3321056‑M1/49‑5 (MQ=255) ttAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatc > 1:5383059‑M1/1‑44 (MQ=255) tAAATGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatcc > 2:2992510‑M1/1‑43 (MQ=255) aaaTGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccc > 1:4569077‑M1/1‑42 (MQ=255) aaaTGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccc > 2:4538174‑M1/1‑42 (MQ=255) aaaTGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatcc < 1:4740029‑M1/49‑8 (MQ=255) aaaTGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatc < 1:5264682‑M1/48‑7 (MQ=255) aaTGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatcccc > 2:5596019‑M1/1‑41 (MQ=255) aaTGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccc < 1:2487116‑M1/49‑9 (MQ=255) aaTGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccc < 2:5261773‑M1/49‑9 (MQ=255) aaTCCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccc < 1:4206846‑M1/49‑9 (MQ=255) aTGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccg < 1:433807‑M1/50‑11 (MQ=255) aTGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccg > 2:5227735‑M1/1‑40 (MQ=255) aTGCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccg > 2:2331495‑M1/1‑40 (MQ=255) gCACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgca < 2:2175037‑M1/50‑13 (MQ=255) cACCCGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcat < 2:472051‑M1/50‑14 (MQ=255) 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cGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatcc < 1:953001‑M1/50‑18 (MQ=255) cGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatcc < 1:394847‑M1/50‑18 (MQ=255) cGCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatcc < 1:1802221‑M1/50‑18 (MQ=255) gCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccg > 1:2482455‑M1/1‑32 (MQ=255) gCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccg < 2:4883625‑M1/50‑19 (MQ=255) gCCAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccg > 1:2663955‑M1/1‑32 (MQ=255) ccAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccgg > 1:5226434‑M1/1‑31 (MQ=255) cAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggt > 2:2471452‑M1/1‑30 (MQ=255) cAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggt < 2:3888193‑M1/50‑21 (MQ=255) cAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggt > 1:3053897‑M1/1‑30 (MQ=255) cAGAGAGCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggt < 1:2371862‑M1/50‑21 (MQ=255) agagagCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggtt > 1:138971‑M1/1‑29 (MQ=255) gagagCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttg < 1:4864902‑M1/50‑23 (MQ=255) agagCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgt > 1:5079251‑M1/1‑27 (MQ=255) gagCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtc < 2:3865253‑M1/50‑25 (MQ=255) agCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtca < 2:3229286‑M1/50‑26 (MQ=255) agCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgt > 2:841473‑M1/1‑25 (MQ=255) agCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgt > 2:5046249‑M1/1‑25 (MQ=255) gCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcag < 1:4774632‑M1/50‑27 (MQ=255) gCGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcag < 2:523617‑M1/50‑27 (MQ=255) cGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcagg > 2:1254506‑M1/1‑23 (MQ=255) cGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcagg > 2:4762202‑M1/1‑23 (MQ=255) cGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcagg > 1:5125394‑M1/1‑23 (MQ=255) cGAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcagg < 1:4157580‑M1/50‑28 (MQ=255) gAATATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggt > 1:1588530‑M1/1‑22 (MQ=255) aaTATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtc < 2:1713365‑M1/50‑30 (MQ=255) aaTATCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtc < 2:1102190‑M1/50‑30 (MQ=255) atatCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtca < 1:4525804‑M1/50‑31 (MQ=255) atatCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggt > 2:2435344‑M1/1‑20 (MQ=255) tatCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcag < 2:4237957‑M1/50‑32 (MQ=255) atCATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcag > 1:4053051‑M1/1‑18 (MQ=255) tCATTGCCGGTTGGCGAgtaatacccgcatatccggttgtcaggtcagga < 1:3903059‑M1/50‑34 (MQ=255) cATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggat > 1:4699840‑M1/1‑16 (MQ=255) cATTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggat > 1:3535453‑M1/1‑16 (MQ=255) aTTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatg > 1:3568953‑M1/1‑15 (MQ=255) aTTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatg > 1:663220‑M1/1‑15 (MQ=255) aTTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatg > 1:1727246‑M1/1‑15 (MQ=255) aTTGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatg > 1:3621721‑M1/1‑15 (MQ=255) ttGCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatgg < 2:4643908‑M1/50‑37 (MQ=255) gCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggt < 2:1893098‑M1/49‑38 (MQ=255) gCCGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggt > 1:3545134‑M1/1‑12 (MQ=255) ccGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggta < 2:448049‑M1/49‑39 (MQ=255) cGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaag < 1:2377810‑M1/50‑41 (MQ=255) cGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaag < 2:5674641‑M1/50‑41 (MQ=255) cGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaag > 2:3175028‑M1/1‑10 (MQ=255) cGGTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaag < 2:4200616‑M1/50‑41 (MQ=255) ggTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaagg > 1:1250975‑M1/1‑9 (MQ=255) ggTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaagg > 2:1481446‑M1/1‑9 (MQ=255) gTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaagg > 1:1904416‑M1/1‑8 (MQ=255) gTTGGCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaagg > 1:2175610‑M1/1‑8 (MQ=255) ggCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaaggcacc > 2:2366015‑M1/1‑5 (MQ=255) ggCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaaggcac < 2:4305029‑M1/49‑45 (MQ=255) ggCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaaggcac < 2:5690486‑M1/49‑45 (MQ=255) ggCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaaggcac < 2:3685600‑M1/49‑45 (MQ=255) gCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaaggcacct > 2:2585612‑M1/1‑4 (MQ=255) gCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaaggcacct < 2:2982326‑M1/50‑47 (MQ=255) gCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaaggcacct > 2:1833290‑M1/1‑4 (MQ=255) gCGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaaggcacct < 2:364958‑M1/50‑47 (MQ=255) cGAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaaggcacctg > 2:916813‑M1/1‑3 (MQ=255) gAgtaatccccgcatatccggttgtcaggtcaggatggtaaggcacctgc > 2:1859907‑M1/1‑2 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |