| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 603,467 | Δ5,885 bp | [ybdG]–insL‑2 | [ybdG], nfsB, ybdF, ybdJ, ybdK, sokE, hokE, insL‑2 | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 603467 | 609351 | 5885 | 143 [0] | [0] 145 | [ybdG]–insL‑2 | [ybdG],nfsB,ybdF,ybdJ,ybdK,sokE,hokE,insL‑2 |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 603466 | 0 (0.000) | 135 (0.940) | 69/94 | 0.0 | 100% | coding (1198/1248 nt) | ybdG | miniconductance mechanosensitive channel YbdG |
| ? | NC_000913 | 609352 = | 0 (0.000) | intergenic (+175/+107) | insL‑2/entD | IS186/IS421 transposase/phosphopantetheinyl transferase EntD | |||||
Only 100 of 145 total aligned reads displayed.
GGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTT > NC_000913/609303‑609401 | actgcttaaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgag > 1:3553189‑M2/50‑50 (MQ=255) ctgcttaaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgag > 1:5410979‑M2/49‑49 (MQ=255) ctgcttaaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGt < 1:1254783‑M2/2‑1 (MQ=255) gcttaaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTaa > 1:1825562‑M2/47‑50 (MQ=255) cttaaatgcaccctccagatagcgaatatcattgccggttggcgaGTAAt > 2:5151124‑M2/46‑50 (MQ=255) cttaaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTaa < 1:3321056‑M2/4‑1 (MQ=255) cttaaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTa < 1:4352868‑M2/3‑1 (MQ=255) cttaaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAAt > 2:2141186‑M2/46‑50 (MQ=255) cttaaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAAt > 1:4534714‑M2/46‑50 (MQ=255) ttaaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATc > 1:5545152‑M2/45‑50 (MQ=255) taaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATcc > 2:4419065‑M2/44‑50 (MQ=255) taaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATcc > 2:2992510‑M2/44‑50 (MQ=255) aaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATccc > 1:4569077‑M2/43‑50 (MQ=255) aaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATcc < 1:4740029‑M2/7‑1 (MQ=255) aaatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATc < 1:5264682‑M2/6‑1 (MQ=255) aatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATcccc > 2:5596019‑M2/42‑50 (MQ=255) aatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATccc < 1:2487116‑M2/8‑1 (MQ=255) aatgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATccc < 2:5261773‑M2/8‑1 (MQ=255) aatccacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATccc < 1:4206846‑M2/8‑1 (MQ=255) atgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCg > 2:4202041‑M2/41‑50 (MQ=255) atgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCg > 2:2331495‑M2/41‑50 (MQ=255) atgcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCg > 2:5227735‑M2/41‑50 (MQ=255) gcacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCa < 2:2175037‑M2/12‑1 (MQ=255) cacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCat < 1:3082103‑M2/13‑1 (MQ=255) cacccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCa > 2:3442371‑M2/38‑49 (MQ=255) acccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCata < 2:5575170‑M2/14‑1 (MQ=255) acccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCata > 2:3579908‑M2/37‑50 (MQ=255) acccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCata > 1:1445977‑M2/37‑50 (MQ=255) acccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCata > 1:1654278‑M2/37‑50 (MQ=255) acccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCata < 2:4089569‑M2/14‑1 (MQ=255) cccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCatat < 1:3058644‑M2/15‑1 (MQ=255) ccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATc < 1:213418‑M2/16‑1 (MQ=255) ccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATc < 1:5146334‑M2/16‑1 (MQ=255) ccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATc < 2:5341205‑M2/16‑1 (MQ=255) ccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATc < 1:295006‑M2/16‑1 (MQ=255) ccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATc > 2:1927915‑M2/35‑50 (MQ=255) cgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATcc < 2:4781193‑M2/17‑1 (MQ=255) cgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATcc < 1:953001‑M2/17‑1 (MQ=255) cgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATcc < 1:3842641‑M2/17‑1 (MQ=255) cgccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATcc < 1:1802221‑M2/17‑1 (MQ=255) gccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCg > 1:2482455‑M2/33‑50 (MQ=255) gccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCg > 1:4039805‑M2/33‑50 (MQ=255) ccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCgg > 1:5226434‑M2/32‑50 (MQ=255) cagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGt < 2:3888193‑M2/20‑1 (MQ=255) cagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGt < 1:2371862‑M2/20‑1 (MQ=255) cagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGt > 2:2471452‑M2/31‑50 (MQ=255) agagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGtt > 1:138971‑M2/30‑50 (MQ=255) agagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGtt > 1:4772121‑M2/30‑50 (MQ=255) gagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTg < 1:4864902‑M2/22‑1 (MQ=255) gagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtc < 2:3865253‑M2/24‑1 (MQ=255) agcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtca < 2:3229286‑M2/25‑1 (MQ=255) agcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgt > 2:841473‑M2/26‑48 (MQ=255) agcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgt > 2:5046249‑M2/26‑48 (MQ=255) cgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcagg > 1:5125394‑M2/24‑50 (MQ=255) cgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcagg > 2:4762202‑M2/24‑50 (MQ=255) cgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcagg < 1:4157580‑M2/27‑1 (MQ=255) cgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcagg < 1:3295996‑M2/27‑1 (MQ=255) gaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggt < 2:5189779‑M2/28‑1 (MQ=255) gaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggt > 1:1588530‑M2/23‑50 (MQ=255) aatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggtc < 2:1102190‑M2/29‑1 (MQ=255) atatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggt > 1:4205328‑M2/21‑48 (MQ=255) atcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggtcag > 1:4053051‑M2/19‑49 (MQ=255) tcattgccggttggcgaGTAATACCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGa < 1:3903059‑M2/33‑1 (MQ=255) cattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGAt > 1:3535453‑M2/17‑50 (MQ=255) attgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGAt < 2:1548805‑M2/34‑1 (MQ=255) attgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATg > 1:1727246‑M2/16‑50 (MQ=255) attgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATg < 2:1211808‑M2/35‑1 (MQ=255) attgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATg > 1:3568953‑M2/16‑50 (MQ=255) ttgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATgg < 2:4643908‑M2/36‑1 (MQ=255) ttgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATgg < 2:2387102‑M2/36‑1 (MQ=255) gccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGt < 2:1893098‑M2/37‑1 (MQ=255) ccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTa < 2:448049‑M2/38‑1 (MQ=255) cggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAg < 1:2377810‑M2/40‑1 (MQ=255) cggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAg < 2:4200616‑M2/40‑1 (MQ=255) cggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAg > 2:3175028‑M2/11‑50 (MQ=255) cggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAg < 2:5674641‑M2/40‑1 (MQ=255) ggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAgg > 1:1250975‑M2/10‑50 (MQ=255) ggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAgg > 2:1481446‑M2/10‑50 (MQ=255) gttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAgg > 1:2175610‑M2/9‑49 (MQ=255) gttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAgg > 1:5316113‑M2/9‑49 (MQ=255) ttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCa < 1:2765564‑M2/43‑1 (MQ=255) ggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCAcc > 2:2366015‑M2/6‑50 (MQ=255) ggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCAc < 2:4305029‑M2/44‑1 (MQ=255) 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gaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGc > 2:3500315‑M2/3‑50 (MQ=255) aGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCt < 1:4508741‑M2/49‑1 (MQ=255) aGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCt > 2:4598259‑M2/2‑50 (MQ=255) aGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCt < 1:5564666‑M2/49‑1 (MQ=255) gTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCtt > 2:3979767/1‑50 (MQ=255) | GGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTT > NC_000913/609303‑609401 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |